{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[348.2277027055769, 844.7815145847208, 1, 0, 0.2918902030753061, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918902030753061, 0.0008018073701787395],
[348.650347697993, 844.4015698877984, 0, 1, 0.292234011411261, 0, 0.001184270654699135, 0.00311628778104848, 0.707765988588739, 1, 0.0008010899095527304],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.000801329571112626],
[348.5558072203176, 844.4961103654739, 0, 1, 0.2921547688600511, 0, 0.00118413807680799, 0.003115938915811828, 0.7078452311399489, 1, 0.0008010930340160782],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008010930341014752],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008011271578973006],
[348.7277027055769, 844.3242148802144, 0, 1, 0.2922988493336043, 0, 0.001184379154803551, 0.003116573288038198, 0.7077011506663957, 1, 0.0008018266777039218],
[348.3562900823559, 844.6956275034356, 1, 0, 0.2919875362903525, 0.002870624209953513, 0, -0.007553755650335476, 1, 0.2919875362903525, 0.0008013354613717088],
[348.3355463163041, 845.1390162619032, 0, 1, 0.2918667537947446, 0, 0.001183237290857847, 0.003113568589198876, 0.7081332462052554, 1, 0.0008010872152951365],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008022874879283626],
[347.643427267252, 844.9966055498135, 1, 1, 0.2914906574501812, 0.002876510589775214, 0.001183436706647278, -0.004455151728592222, 0.9150331966192611, 0.4980145115196235, 0.001602545766998494],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.9355649864145, 844.9104102150138, 1, 0, 0.2916852403577594, 0.00287409538038759, 0, -0.007562889682295761, 1, 0.2916852403577594, 0.000801144528127141],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012401409289543],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008023447122626532],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012286588971387],
[348.541488700667, 844.777974540438, 0, 1, 0.29207726802177, 0, 0.001183742983526533, 0.00311489926802482, 0.70792273197823, 1, 0.0008014435124998123],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8588695923047, 1, 0, 0.291871278070703, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.291871278070703, 0.0008007555086668824],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011322555693206],
[348.2277027055769, 844.8588695923047, 1, 0, 0.291871278070703, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.291871278070703, 0.0008011413174363823],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861763, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.000801084501662295],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.000803406987935464],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.000801335461240974],
[348.3355463163041, 845.1390162619034, 0, 1, 0.2918667537947445, 0, 0.001183237290857846, 0.003113568589198876, 0.7081332462052554, 1, 0.0008010930340160782],
[348.2277027055769, 845.091760535528, 1, 0, 0.2918143158075844, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918143158075843, 0.0008011797524394055],
[347.8912530479604, 845.1606645378308, 0, 1, 0.2915977485304565, 0, 0.001183206982954941, 0.00311348883703486, 0.7084022514695435, 1, 0.0008010847592956004],
[348.1503476979929, 844.9015698877984, 0, 1, 0.2918149181659211, 0, 0.00118356982119562, 0.003114443608962575, 0.7081850818340789, 1, 0.0008013550309283202],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.000801093034021942],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008005064942123528],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008009978630906727],
[348.2277027055769, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2919301485229674, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7080698514770325, 1, 0.0008011294940228676],
[348.0641523631934, 844.9877652225978, 0, 1, 0.2917426704007325, 0, 0.00118344908785344, 0.003114125911451869, 0.7082573295992675, 1, 0.0008018523527680838],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008011322088229282],
[348.4336450899398, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2920523742126958, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7079476257873042, 1, 0.0008017878583743348],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.000801826677744258],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008022772707265011],
[348.099115328798, 844.9528022569932, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.0008011375038548125],
[347.9869986306055, 845.1606645378308, 0, 1, 0.2916545951290861, 0, 0.001183206982954941, 0.00311348883703486, 0.7083454048709139, 1, 0.0008010988505233084],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008011270052055141],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010847592433276],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008015849162701247],
[348.098507515811, 844.9534100699802, 1, 0, 0.2917714664255419, 0.002872750036006917, 0, -0.007559349545386888, 1, 0.2917714664255419, 0.0008011324553234416],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.3562900823559, 844.6956275034354, 1, 0, 0.2919875362903525, 0.002870624209953514, 0, -0.007553755650335477, 1, 0.2919875362903526, 0.0008010969090102041],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008009978713033132],
[348.2277027055769, 845.091760535528, 1, 0, 0.2918143158075844, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918143158075843, 0.0008019464889994576],
[348.021760321214, 845.0301572645774, 0, 1, 0.291707137963833, 0, 0.001183389718583619, 0.003113969687256515, 0.708292862036167, 1, 0.0008018523526722069],
[348.150347697993, 844.9015698877984, 0, 1, 0.2918149181659211, 0, 0.00118356982119562, 0.003114443608962575, 0.7081850818340789, 1, 0.0008013550309273268],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010872153238775],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.000801858342054204],
[348.1850024100834, 844.8669151757078, 0, 1, 0.2918439652774338, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081560347225662, 1, 0.000801126910215584],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010930340160782],
[348.021760321214, 845.0301572645774, 0, 1, 0.291707137963833, 0, 0.001183389718583619, 0.003113969687256515, 0.708292862036167, 1, 0.0008025446743856672],
[347.8839117350582, 845.1680058507332, 1, 0, 0.291591595141158, 0.002874522121510411, 0, -0.007564012608158563, 1, 0.291591595141158, 0.0008011919437246992],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008011322715902148],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008015621935431798],
[348.1092934604054, 845.1341152906762, 0, 1, 0.2917336822541153, 0, 0.001183244152504788, 0.003113586644924936, 0.7082663177458848, 1, 0.0008007528932891678],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2955074653154, 844.8521557031211, 0, 1, 0.2919131623158923, 0, 0.001183639046488268, 0.003114625768279589, 0.7080868376841076, 1, 0.0008012922492268404],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008014437701208999],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008010845007943307],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.7277027055769, 844.9517868703947, 0, 1, 0.2915516748168471, 0, 0.001183499479542953, 0.003114258512057712, 0.7084483251831528, 1, 0.0008011973512167674],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861763, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.0008011375054911155],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2617496046805, 844.7901679811109, 0, 1, 0.2919082937391426, 0, 0.001183725897745485, 0.003114854308529709, 0.7080917062608574, 1, 0.0008011015157415449],
[348.2277027055769, 844.5566692249008, 1, 0, 0.2919452257259065, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2919452257259065, 0.0008018218116837165],
[348.150347697993, 844.9015698877984, 0, 1, 0.2918149181659211, 0, 0.00118356982119562, 0.003114443608962575, 0.7081850818340789, 1, 0.0008005404869444026],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012708161407425],
[348.1850024100834, 844.8669151757078, 0, 1, 0.2918439652774338, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081560347225662, 1, 0.0008017865157714213],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011414932735921],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.021760321214, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2917575005963748, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7082424994036252, 1, 0.0008023776662465779],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2917719758861763, 0.0008011059654145723],
[348.021760321214, 844.8754472494093, 0, 1, 0.2917449702392819, 0, 0.001183606415899073, 0.003114539904202832, 0.7082550297607181, 1, 0.0008009247386890333],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.1503476979929, 844.7468598726302, 0, 1, 0.2918527644196714, 0, 0.00118378658448139, 0.003115013999503069, 0.7081472355803287, 1, 0.0008011259748522014],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008012719326394658],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008013613440523126],
[348.150347697993, 844.8669151757081, 0, 1, 0.2918233947926117, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081766052073883, 1, 0.000801169358558868],
[348.2277027055769, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2919301485229674, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7080698514770325, 1, 0.0008011791507150181],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008018218116826501],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008011414932735921],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008008606408615198],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008033324186762382],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.0045748511226, 844.7901679811109, 0, 1, 0.2917556242952601, 0, 0.001183725897745485, 0.003114854308529709, 0.7082443757047399, 1, 0.0008007054418043578],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918034265184565, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2918034265184565, 0.0008011320290364292],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.1672091270052, 844.8847084587862, 1, 0, 0.2918290511879327, 0.002872183174594188, 0, -0.007557857907232193, 1, 0.2918290511879327, 0.0008007274027649935],
[348.1879528930569, 844.5964190374209, 0, 1, 0.2919119004967574, 0, 0.001183997442399402, 0.003115568850668917, 0.7080880995032426, 1, 0.0008010405831419144],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2957965037841, 844.7561210820072, 1, 0, 0.2919368313900207, 0.002871122792861887, 0, -0.007555067620550257, 1, 0.2919368313900208, 0.0008013851843114901],
[348.1666013140182, 844.885316271773, 1, 0, 0.2918285417272982, 0.002872188188717391, 0, -0.007557871101387439, 1, 0.2918285417272982, 0.000800421258407685],
[348.2617496046805, 844.7901679811109, 0, 1, 0.2919082937391426, 0, 0.001183725897745485, 0.003114854308529709, 0.7080917062608574, 1, 0.0008013134838011121],
[348.0045748511226, 845.0473427346687, 0, 1, 0.2916927333349665, 0, 0.001183365652347816, 0.003113906359404668, 0.7083072666650335, 1, 0.0008008513643895692],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2917719758861763, 0.0008012700607824072],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 2, 0.2918797560882644, 0, 0.002367356385829418, 0.006229457556238726, 0.5014342798376159, 1, 0.001602714375039925],
[348.2277027055769, 844.8588695923047, 1, 0, 0.291871278070703, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.291871278070703, 0.0008011846640245845],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 0, 0.2918797560882644, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003032884905557533],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.000498058929338544],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008013565467795254],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.9869986306055, 845.1606645378308, 0, 1, 0.2916545951290861, 0, 0.001183206982954941, 0.00311348883703486, 0.7083454048709139, 1, 0.0008011414685222054],
[348.1598979458385, 844.8920196399529, 0, 1, 0.2918229230546479, 0, 0.001183583199692365, 0.003114478813116094, 0.7081770769453521, 1, 0.0008016616439289619],
[348.2079743261239, 844.8445510726542, 0, 1, 0.2918630713343784, 0, 0.001183649700682041, 0.003114653803706912, 0.7081369286656216, 1, 0.0008007496402161014],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011322492897078],
[348.2079743261239, 844.8445510726542, 0, 1, 0.2918630713343784, 0, 0.001183649700682041, 0.003114653803706912, 0.7081369286656216, 1, 0.0008012437240621203],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008011414849859598],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.000801857069691003],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008009406387558892],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.8839117350582, 845.1680058507332, 0, 1, 0.291591595141158, 0, 0.001183196705362049, 0.00311346179259445, 0.708408404858842, 1, 0.0008006888229182724],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008010601477948302],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.9693123260452, 845.0826052597461, 0, 1, 0.2916631767628193, 0, 0.00118331627438082, 0.003113776426306526, 0.7083368232371807, 1, 0.0008011216762176782],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.098507515811, 844.9534100699802, 1, 0, 0.2917714664255419, 0.002872750036006917, 0, -0.007559349545386888, 1, 0.2917714664255419, 0.0008011458156545905],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012240299690005],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008012694832138447],
[346.832893126626, 840.2995672184807, 1.6875, 1.5625, 0.2921602303973725, 0.004865455478537633, 0.001859455914242718, -0.007909982126872123, 0.9009825512945657, 0.3746899796932299, 0.000804661049638999],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008016150575245579],
[348.2617496046805, 844.7901679811109, 0, 1, 0.2919082937391426, 0, 0.001183725897745485, 0.003114854308529709, 0.7080917062608574, 1, 0.000801141339290416],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.4259077600509, 844.6260098257405, 0, 1, 0.2920458888873089, 0, 0.001183955962007748, 0.003115459699237061, 0.707954111112691, 1, 0.0008007195846235914],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010873245442359],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011625751341711],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.081690114464, 842.8281866409402, 1.75, 1, 0.29168737640944, 0.00504204067757901, 0.00118648143933755, -0.01014551200400459, 0.9445908934981132, 0.2836293664099891, 0.001604873577055257],
[348.2277027055769, 844.6695048650465, 0, 0, 0.2919176107510175, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002848200267851741],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0005160949483720118],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.650347697993, 844.4015698877984, 1, 0, 0.292234011411261, 0.002868203076814992, 0, -0.007547384684723916, 1, 0.292234011411261, 0.0008023143410469352],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012421618078996],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.815817936851, 845.2360996489404, 0, 1, 0.2915345198394016, 0, 0.001183101384826487, 0.003113210966299739, 0.7084654801605984, 1, 0.0008015104529479317],
[348.021760321214, 845.0301572645774, 0, 1, 0.291707137963833, 0, 0.001183389718583619, 0.003113969687256515, 0.708292862036167, 1, 0.0008016722932753683],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2919301485229674, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7080698514770325, 1, 0.0008011758123836727],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.9394047793637, 844.6493956685067, 1, 0, 0.2917513602749723, 0.002874063662418814, 0, -0.007562806219686817, 1, 0.2917513602749723, 0.0007996190587725576],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2315424985261, 844.5632003337073, 0, 1, 0.2919459065284503, 0, 0.001184044011868947, 0.003115691393491655, 0.7080540934715498, 1, 0.0008001313986758946],
[348.2315424985261, 844.3572579493443, 0, 1, 0.2919963212531843, 0, 0.001184332805320651, 0.003116451324087945, 0.7080036787468157, 1, 0.0008004077290020228],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2315424985261, 844.8307459890209, 0, 1, 0.2918804373072437, 0, 0.001183669042287667, 0.003114704699174972, 0.7081195626927563, 1, 0.0008003037054394934],
[348.2315424985261, 844.5632003337073, 0, 1, 0.2919459065284503, 0, 0.001184044011868947, 0.003115691393491655, 0.7080540934715498, 1, 0.0008002714577580431],
[348.2315424985261, 844.8900997434782, 0, 1, 0.291865917245589, 0, 0.001183585889222297, 0.003114485890340571, 0.7081340827544109, 1, 0.0008012770162293533],
[348.1010352252725, 844.8222949837398, 0, 1, 0.2918050359232069, 0, 0.001183680882876377, 0.003114735856479908, 0.7081949640767931, 1, 0.0008006384337671376],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861763, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.000801240973441648],
[348.3582099788305, 844.5651202301819, 0, 1, 0.2920206195630314, 0, 0.001184041320256578, 0.003115684310787457, 0.7079793804369686, 1, 0.000801239917201825],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.970527952019, 845.3489352890861, 0, 1, 0.2915988037326708, 0, 0.001182943466602969, 0.003112795420555696, 0.7084011962673292, 1, 0.0008006996729595877],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2917719758861763, 0.0008009481645295962],
[348.3050577131609, 845.0144055279438, 0, 2, 0.2918791391930792, 0, 0.002366823555807253, 0.006228055468227121, 0.5014351535099345, 1, 0.001603695574899495],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918034265184565, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2918034265184566, 0.0008012725822011259],
[348.6503476979929, 844.4015698877984, 0, 1, 0.292234011411261, 0, 0.001184270654699135, 0.00311628778104848, 0.7077659885887391, 1, 0.0008012698827462297],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.041488700667, 845.0444757842279, 0, 1, 0.2917153491541836, 0, 0.00118336966710772, 0.003113916923837032, 0.7082846508458165, 1, 0.0008012919456393386],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2957965037841, 844.7561210820072, 0, 0, 0.2919368313900207, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002497376123367197],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2617496046805, 844.7901679811109, 0, 1, 0.2919082937391426, 0, 0.001183725897745485, 0.003114854308529709, 0.7080917062608574, 1, 0.0004413268028073066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 0, 0.2918797560882644, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000109816439429199],
[348.1319571229319, 845.091760535528, 0, 1, 0.2917574902098776, 0, 0.001183303454960096, 0.003113742693304694, 0.7082425097901224, 1, 0.0008019639209491735],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 0, 0.2918797560882644, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002808385492511395],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0005205095765841009],
[347.720072354206, 845.4355515060467, 0, 1, 0.2914289346675639, 0, 0.001182822272163282, 0.003112476509713798, 0.7085710653324362, 1, 0.0008012102515405585],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.815817936851, 845.1680058507332, 0, 0, 0.291551160209848, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002394966857774792],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.021760321214, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917154628378672, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082845371621328, 1, 0.0005614172047390333],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.4959208147978, 844.0543069314986, 0, 1, 0.2922274573486032, 0, 0.001184757890325128, 0.003117569892043758, 0.7077725426513968, 1, 0.0008022221323881633],
[348.3332865389152, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921225804246314, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970652, 1, 0.2921225804246315, 0.0008019286730784467],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921989076923192, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921989076923192, 0.0008021379031931388],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008018091614628718],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921989076923192, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921989076923192, 0.0008019955838137958],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008021133539923465],
[348.4421455362412, 844.1086900230418, 0, 1, 0.2921822157567217, 0, 0.001184681560348233, 0.003117369037472734, 0.7078177842432782, 1, 0.0008020184141359919],
[348.2899784304348, 844.2602493158615, 0, 1, 0.2920547666060487, 0, 0.001184468889551937, 0.003116809415902063, 0.7079452333939513, 1, 0.0008020417353624895],
[348.4618739156942, 843.8824114462391, 0, 1, 0.2922493764541501, 0, 0.001184999220787417, 0.003118204928610647, 0.7077506235458499, 1, 0.000802165657979679],
[348.2559315313313, 844.294296214965, 0, 1, 0.2920262169497647, 0, 0.001184421124817585, 0.00311668372786155, 0.7079737830502353, 1, 0.0008031383223299997],
[347.9618739156942, 844.2159258207823, 0, 1, 0.2918707880591376, 0, 0.001184531077197765, 0.003116973056367237, 0.7081292119408624, 1, 0.0008019765910793957],
[348.1254242580777, 844.4248034882185, 0, 1, 0.291916781497725, 0, 0.001184238070541177, 0.003116202039150801, 0.708083218502275, 1, 0.000802074859667223],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921989076923192, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921989076923192, 0.0008021078576435714],
[348.3332865389152, 844.2169412073808, 1, 0, 0.2920910821485499, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970652, 1, 0.2920910821485498, 0.0008020057516341881],
[348.3332865389153, 844.2169412073811, 1, 0, 0.2920910821485498, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970651, 1, 0.2920910821485498, 0.0008021837933764006],
[348.9421455362412, 843.9464633207713, 0, 1, 0.2925186332951795, 0, 0.001184909284488482, 0.003117968270387011, 0.7074813667048205, 1, 0.0008022335808332415],
[348.5697175264214, 844.4031552122909, 0, 1, 0.2921857868622013, 0, 0.00118426843129049, 0.003116281930374765, 0.7078142131377987, 1, 0.0008021120356955352],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921989076923192, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921989076923192, 0.0008021857276365626],
[348.4959208147978, 844.0543069314986, 0, 1, 0.2922274573486032, 0, 0.001184757890325128, 0.003117569892043758, 0.7077725426513968, 1, 0.0008018357025568647],
[348.2756599107843, 844.2393053104347, 0, 1, 0.2920513956369319, 0, 0.001184498274019936, 0.003116886738141042, 0.7079486043630681, 1, 0.0008024714217719995],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.4618739156942, 844.0536991185118, 0, 1, 0.2922073990439192, 0, 0.001184758743483206, 0.00311757213704247, 0.7077926009560809, 1, 0.0008025409756664691],
[348.3332865389152, 844.2169412073811, 1, 0, 0.2920910821485498, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970652, 1, 0.2920910821485498, 0.0008021572979310124],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2899784304348, 844.2602493158615, 0, 1, 0.2920547666060487, 0, 0.001184468889551937, 0.003116809415902063, 0.7079452333939513, 1, 0.0008021646170564984],
[348.5697175264214, 844.403155212291, 0, 1, 0.2921857868622013, 0, 0.00118426843129049, 0.003116281930374764, 0.7078142131377987, 1, 0.0008022080590375202],
[348.5697175264214, 844.4031552122908, 0, 1, 0.2921857868622013, 0, 0.00118426843129049, 0.003116281930374766, 0.7078142131377987, 1, 0.0008022080590552866],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008022080285369732],
[348.5697175264214, 844.0762558025199, 0, 1, 0.2922658737978089, 0, 0.00118472708256582, 0.003117488824558456, 0.707734126202191, 1, 0.0008022208092134846],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008022334961236793],
[348.5697175264214, 844.403155212291, 0, 1, 0.2921857868622013, 0, 0.00118426843129049, 0.003116281930374764, 0.7078142131377987, 1, 0.0008021187466650884],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2034835361625, 844.5185442828022, 0, 1, 0.2919401800375016, 0, 0.00118410662118644, 0.003115856143542929, 0.7080598199624984, 1, 0.0008020136774797567],
[348.3326787259284, 844.2175490203679, 1, 0, 0.2920905724735922, 0.002870818792131788, 0, -0.007554267673547536, 1, 0.2920905724735922, 0.000801990875325574],
[348.4618739156942, 843.8824114462393, 0, 1, 0.29224937645415, 0, 0.001184999220787417, 0.003118204928610646, 0.7077506235458499, 1, 0.000802158963464371],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008017892309237197],
[348.4618739156942, 844.1230085426923, 1, 0, 0.2921904168342107, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921904168342107, 0.0008019575795752222],
[348.6678163000572, 843.8824114462391, 0, 1, 0.2923715984348736, 0, 0.001184999220787417, 0.003118204928610647, 0.7076284015651264, 1, 0.0008020836108206876],
[348.2559315313313, 844.294296214965, 0, 1, 0.2920262169497647, 0, 0.001184421124817585, 0.00311668372786155, 0.7079737830502353, 1, 0.0008020308151474429],
[348.4618739156942, 844.0536991185115, 0, 1, 0.2922073990439192, 0, 0.001184758743483206, 0.003117572137042471, 0.7077926009560808, 1, 0.000802036323433057],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008025711447633665],
[348.3332865389153, 844.2169412073811, 1, 0, 0.2920910821485498, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970651, 1, 0.2920910821485498, 0.0008020528440331676],
[348.3332865389153, 844.2169412073811, 1, 0, 0.2920910821485498, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970651, 1, 0.2920910821485498, 0.00080208036117748],
[348.3332865389152, 844.2169412073808, 1, 0, 0.2920910821485499, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970652, 1, 0.2920910821485498, 0.0008021298392389494],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008020235998907455],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008026059490098769],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008021441763828288],
[348.5923811889477, 843.8292591805696, 0, 1, 0.2923398648492517, 0, 0.001185073863130896, 0.003118401342345978, 0.7076601351507483, 1, 0.0008021518084137853],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.9618739156942, 844.588353830602, 0, 1, 0.2917796381400883, 0, 0.001184008748717092, 0.003115598602094005, 0.7082203618599117, 1, 0.0008021518622163237],
[348.2756599107843, 844.3086147346155, 0, 1, 0.2920344224850187, 0, 0.001184401038374246, 0.003116630872428805, 0.7079655775149813, 1, 0.0008022016501878648],
[348.4618739156942, 844.0109988230181, 0, 1, 0.2922178624620563, 0, 0.001184818682925353, 0.003117729861588311, 0.7077821375379437, 1, 0.0008026595457385095],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921989076923192, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921989076923192, 0.00080432883287156],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008022208091129188],
[348.4618739156942, 843.8824114462393, 0, 1, 0.29224937645415, 0, 0.001184999220787417, 0.003118204928610646, 0.7077506235458499, 1, 0.0008022335807540918],
[348.4618739156942, 844.2434531677045, 0, 1, 0.2921609101619518, 0, 0.001184492454454788, 0.003116871424547235, 0.7078390898380482, 1, 0.0008042076838117193],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008021723502133032],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921989076923192, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921989076923192, 0.0008035488832365672],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.1254242580777, 844.4248034882187, 0, 1, 0.2919167814977249, 0, 0.001184238070541176, 0.0031162020391508, 0.7080832185022751, 1, 0.0008025871575078537],
[348.6678163000572, 843.8483645471356, 0, 1, 0.29237994578183, 0, 0.001185047032160412, 0.003118330739376003, 0.7076200542181701, 1, 0.0008017608263078169],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.6678163000572, 843.8824114462391, 0, 1, 0.2923715984348736, 0, 0.001184999220787417, 0.003118204928610647, 0.7076284015651264, 1, 0.000801978936059365],
[348.3332865389152, 844.2169412073808, 1, 0, 0.2920910821485499, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970652, 1, 0.2920910821485498, 0.0008020308151471478],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008020308152380126],
[348.3845189081102, 844.165708838186, 0, 1, 0.2921340424935341, 0, 0.001184601541534169, 0.003117158476101877, 0.7078659575064659, 1, 0.0008025648265797271],
[348.5045742111877, 844.0456535351086, 0, 1, 0.2922347135598625, 0, 0.00118477003680039, 0.003117601854258048, 0.7077652864401376, 1, 0.000802544933273725],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921989076923192, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921989076923192, 0.0008025575831083288],
[348.2559315313313, 844.294296214965, 0, 1, 0.2920262169497647, 0, 0.001184421124817585, 0.00311668372786155, 0.7079737830502353, 1, 0.000802069357433208],
[348.3116382629876, 844.3343350659538, 1, 0, 0.2920494816167215, 0.002870992209697468, 0, -0.007554724004234108, 1, 0.2920494816167215, 0.0008021661755573298],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921989076923192, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921989076923192, 0.0008020247449956557],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.9885443123537, 842.4119693458319, 0.25, 1.5, 0.2923289601438092, 0.0007184144538263897, 0.001780601480727788, 0.002795037131070321, 0.6446942349724507, 0.4539844757295539, 0.0008024330209734334],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.8845189081102, 843.665708838186, 0, 1, 0.2925533120457649, 0, 0.001185303597768721, 0.003119005865680146, 0.7074466879542352, 1, 0.0008020308151471478],
[347.9272192036037, 844.2505805328728, 0, 1, 0.291841719649964, 0, 0.001184482454686405, 0.003116845111173768, 0.7081582803500359, 1, 0.0008020308151471478],
[348.4191736202007, 844.1310541260957, 0, 1, 0.2921631018247757, 0, 0.001184650173823152, 0.003117286447024165, 0.7078368981752243, 1, 0.0008020308151473594],
[348.2559315313313, 844.294296214965, 0, 1, 0.2920262169497647, 0, 0.001184421124817585, 0.00311668372786155, 0.7079737830502353, 1, 0.0008025584978550217],
[348.4618739156942, 844.3558994859154, 0, 1, 0.2921333683031654, 0, 0.001184334710764558, 0.003116456338069791, 0.7078666316968345, 1, 0.0008022016501883033],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008022016503839986],
[348.6254242580777, 843.9248034882187, 0, 1, 0.2923360510499557, 0, 0.001184939695890761, 0.003118048294899103, 0.7076639489500443, 1, 0.0008024533085784521],
[348.7899784304348, 843.7602493158615, 0, 1, 0.2924740361582796, 0, 0.001185170788515838, 0.003118656391638612, 0.7075259638417204, 1, 0.0008022419783259956],
[348.3332865389153, 843.8050564386554, 1, 0, 0.2921919998553968, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970651, 1, 0.2921919998553968, 0.0008017900032817274],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.4618739156942, 843.8824114462393, 0, 1, 0.29224937645415, 0, 0.001184999220787417, 0.003118204928610646, 0.7077506235458499, 1, 0.0008021175552451174],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2769835508972, 844.4283435325017, 1, 1, 0.2920058925221386, 0.002871277882920621, 0.001184233105933766, -0.004439286748974981, 0.9147325587323492, 0.4987443437766265, 0.001034695944462386],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.0920931861001, 844.7683332344011, 0, 0, 0.2918129275447959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005701694059007489],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.1347934815936, 844.7256329389077, 0, 1, 0.2918487241011639, 0, 0.001183816331606836, 0.003115092276038235, 0.7081512758988361, 1, 0.000802010544122858],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.1598979458385, 844.7962740573078, 0, 1, 0.2918463444983294, 0, 0.001183717341930611, 0.00311483179477304, 0.7081536555016706, 1, 0.0008013910785092792],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.9736839409286, 845.0782336448628, 0, 1, 0.291666840991357, 0, 0.001183322395711166, 0.003113792533964759, 0.708333159008643, 1, 0.0008012628583396333],
[348.0774670528704, 844.9744505329209, 1, 0, 0.2917538305937474, 0.002872923686979449, 0, -0.007559806490259856, 1, 0.2917538305937474, 0.0008014011636488559],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008010055226348637],
[347.4720252482298, 846.2132967873647, 1, 5, 0.2910918135909428, 0.00287792952334972, 0.005908675766479232, 0.007975100495352997, 0.439625278852397, 0.8730771108351554, 0.004858045894528757],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012718937674013],
[348.0558072203175, 844.9961103654737, 0, 1, 0.2917356756147112, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487029, 0.7082643243852889, 1, 0.0008012718937674013],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.488717252084, 844.3060255801495, 1, 0, 0.2921615134089327, 0.00286953336075049, 0, -0.007550885191603041, 1, 0.2921615134089327, 0.0008005427385384396],
[348.488717252084, 844.3060255801495, 1, 0, 0.2921615134089327, 0.00286953336075049, 0, -0.007550885191603041, 1, 0.2921615134089327, 0.0008012185900516045],
[348.488717252084, 844.3060255801495, 0, 0, 0.2921615134089327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002836481469832823],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.3582099788305, 844.5651202301819, 0, 1, 0.2920206195630314, 0, 0.001184041320256578, 0.003115684310787457, 0.7079793804369686, 1, 0.0004235820453848136],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 0, 0.2918797560882644, 0, 0, 0, 1, 1, 9.36059201597001e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.3582099788305, 844.4104102150141, 0, 1, 0.2920584965776652, 0, 0.001184258256296684, 0.003116255155913416, 0.7079415034223348, 1, 0.0008009062904696085],
[348.2277027055769, 844.6695048650465, 0, 0, 0.2919176107510175, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002769258750462081],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0005240139929492306],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008011867416614239],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.6503476979929, 844.4015698877984, 0, 1, 0.292234011411261, 0, 0.001184270654699135, 0.00311628778104848, 0.7077659885887391, 1, 0.0008011816961499019],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008014877642217119],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.2298160327924, 843.0959773269094, 1.75, 0.75, 0.2917098982226825, 0.005039889776731413, 0.0008895784349225858, -0.01092112218664369, 0.9576372463577379, 0.2517518344302139, 0.0008031194744927561],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008008632326311971],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[346.8918734619718, 840.7991523489484, 1.09375, 3.15625, 0.2920724884867463, 0.003152999777955026, 0.003753869150774421, 0.001581126642877977, 0.6597388811976038, 0.7317443092771041, 0.00160840861628056],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008013081282813574],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918034265184565, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2918034265184565, 0.0008010281789144936],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.0665707922855, 840.3906380040514, 1, 2.333333333333333, 0.2922771180479747, 0.002881291614220276, 0.002776486585898979, -0.0002757837727838262, 0.7507609922258769, 0.6841040016160322, 0.00160429066237285],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2917719758861763, 0.0008011316896774804],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008023447339323024],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008013546405831769],
[348.3779383582835, 844.6739792275079, 1, 0, 0.2920056815827815, 0.002870445828781404, 0, -0.007553286258423409, 1, 0.2920056815827815, 0.0008017413786694342],
[349.2069783703652, 843.9130330136331, 0, 1, 0.2926838667011303, 0, 0.00118495622283374, 0.003118091783868672, 0.7073161332988698, 1, 0.0008020431780056831],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.9705473828591, 844.1154171020357, 1, 0, 0.2924940513683139, 0.002865571342623622, 0, -0.007540459543861066, 1, 0.2924940513683139, 0.0008022581813154271],
[348.6360176217173, 844.83854495649, 0, 1, 0.2921185155958206, 0, 0.001183658115470455, 0.003114675946366794, 0.7078814844041794, 1, 0.0008019375486675163],
[348.5281740109901, 844.5237435748011, 0, 0, 0.2921316070772987, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002875143792751028],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.3779383582835, 844.6739792275077, 1, 0, 0.2920056815827816, 0.002870445828781404, 0, -0.007553286258423409, 1, 0.2920056815827816, 0.0005136687581841214],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.855274695757, 843.9302069270996, 0, 1, 0.2924710939817262, 0, 0.001184932109067619, 0.003118028330945625, 0.7075289060182739, 1, 0.0008009889543144212],
[348.412901323888, 844.4158884074491, 1, 0, 0.2920896144721337, 0.002870157781759035, 0, -0.00755252829198, 1, 0.2920896144721337, 0.0008011786970035262],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918034265184565, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2918034265184566, 0.0008012805083035709],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.8760184618089, 844.1482473395445, 0, 1, 0.2924299433486118, 0, 0.001184626045427027, 0.00311722295560375, 0.7075700566513883, 1, 0.0008037251728200981],
[349.112449449315, 844.0075619346835, 0, 1, 0.292604638358509, 0, 0.00118482350763273, 0.003117742557315074, 0.707395361641491, 1, 0.0008035232526762821],
[349.112449449315, 843.9302069270996, 0, 1, 0.2926236103826008, 0, 0.001184932109067619, 0.003118028330945625, 0.7073763896173992, 1, 0.0008017053650771919],
[349.035094441731, 844.0849169422675, 0, 1, 0.2925398041365985, 0, 0.0011847149261031, 0.003117456836063189, 0.7074601958634015, 1, 0.0008016472985423336],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.3183918336779, 843.8016195503205, 0, 1, 0.2927772466312711, 0, 0.001185112681500802, 0.003118503488938345, 0.7072227533687289, 1, 0.0008023518614123688],
[349.035094441731, 844.0502622301769, 0, 1, 0.29254830133475, 0, 0.001184763567702435, 0.003117584831484721, 0.7074516986652499, 1, 0.0008016677235761484],
[349.112449449315, 844.0075619346835, 0, 1, 0.292604638358509, 0, 0.00118482350763273, 0.003117742557315074, 0.707395361641491, 1, 0.0008017503065990061],
[349.112449449315, 843.9302069270996, 0, 1, 0.2926236103826008, 0, 0.001184932109067619, 0.003118028330945625, 0.7073763896173992, 1, 0.0008022097035393895],
[349.112449449315, 844.0075619346835, 0, 1, 0.292604638358509, 0, 0.00118482350763273, 0.003117742557315074, 0.707395361641491, 1, 0.0008014148271080014],
[349.112449449315, 843.972907222593, 0, 1, 0.2926131374398546, 0, 0.001184872158148858, 0.003117870576200243, 0.7073868625601454, 1, 0.0008014148272125361],
[349.112449449315, 844.179362007352, 0, 1, 0.2925625116149493, 0, 0.001184582382613721, 0.003117108061351284, 0.7074374883850507, 1, 0.0008019445090921071],
[349.112449449315, 844.0075619346835, 1, 0, 0.292604638358509, 0.002864406587554772, 0, -0.007537394609359337, 1, 0.292604638358509, 0.0008019191178153676],
[349.112449449315, 844.0849169422675, 0, 1, 0.2925856687943305, 0, 0.0011847149261031, 0.003117456836063189, 0.7074143312056695, 1, 0.0008019191178134377],
[348.670076077446, 844.4158884074491, 1, 0, 0.2922422075663101, 0.00286804078873084, 0, -0.007546957640136055, 1, 0.29224220756631, 0.0008020667182370476],
[348.412901323888, 844.6730631610069, 1, 0, 0.292026653313546, 0.002870157781759035, 0, -0.00755252829198, 1, 0.292026653313546, 0.0008012078451432911],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.9528022569932, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.0008011322004400321],
[347.8912530479604, 845.0833095302469, 0, 2, 0.2916166563485748, 0, 0.002366630576471487, 0.006227547662732104, 0.5018069615627732, 1, 0.001601971665222944],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 0, 0.2918797560882644, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002680045104941336],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.000533349836882154],
[347.8498648359546, 845.2020527498369, 0, 1, 0.2915630574902798, 0, 0.00118314904317439, 0.003113336374395132, 0.7084369425097202, 1, 0.0008023244229704041],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008010968095047196],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.5201174780517, 841.5571286084501, 0.75, 3.25, 0.2910679305977311, 0.002170640614139181, 0.003861888741141093, 0.004450347437035956, 0.5637124704721116, 0.747408640407344, 0.001605497335423738],
[347.8912530479604, 845.1606645378311, 0, 1, 0.2915977485304564, 0, 0.001183206982954941, 0.00311348883703486, 0.7084022514695436, 1, 0.0008013468587779368],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.348861005981, 845.7030565798102, 0, 1, 0.2911431228482171, 0, 0.00118244813261548, 0.00311149199954579, 0.7088568771517829, 1, 0.0008007935160671327],
[347.8912530479604, 845.1606645378308, 0, 1, 0.2915977485304565, 0, 0.001183206982954941, 0.00311348883703486, 0.7084022514695435, 1, 0.0008012746889566341],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.021760321214, 845.0301572645774, 0, 1, 0.291707137963833, 0, 0.001183389718583619, 0.003113969687256515, 0.708292862036167, 1, 0.0008012401314086462],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.8912530479604, 845.1606645378308, 0, 1, 0.2915977485304565, 0, 0.001183206982954941, 0.00311348883703486, 0.7084022514695435, 1, 0.0008010020242469775],
[348.3355463163041, 844.8121168521322, 0, 1, 0.2919467196468286, 0, 0.001183695143632783, 0.003114773382209994, 0.7080532803531714, 1, 0.000800936846129232],
[348.2277027055769, 844.6695048650463, 0, 0, 0.2919176107510175, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000308729665403698],
[348.2277027055769, 844.6695048650463, 0, 1, 0.2919176107510175, 0, 0.001183894995901114, 0.00311529927312804, 0.7080823892489825, 1, 0.000812423720297543],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0004922449789028478],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012696964419496],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.150347697993, 844.8669151757081, 0, 1, 0.2918233947926117, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081766052073883, 1, 0.0008009607098658734],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.150347697993, 844.8669151757081, 0, 1, 0.2918233947926117, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081766052073883, 1, 0.0008012344006236551],
[348.2277027055769, 844.4123301114887, 0, 0, 0.2919805583609738, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00029572071009053],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.6182724958517, 0, 1, 0.2919301485229673, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158861, 0.7080698514770327, 1, 0.0005052167419452567],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 845.091760535528, 1, 1, 0.2918143158075844, 0.002871684223370046, 0.001183303454960096, -0.004442802274527235, 0.9148444050897514, 0.4984730367049202, 0.001603987170906635],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.7079743261239, 844.6823243703836, 0, 1, 0.2921994377757249, 0, 0.001183877028260759, 0.003115251993109852, 0.7078005622242751, 1, 0.0008011857383906209],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.7553243582792, 845.1680058507332, 1, 0, 0.2915152345099571, 0.002875585016118223, 0, -0.007566809507216833, 1, 0.2915152345099571, 0.0008006438490998203],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008011461420121513],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.2538253439659, 845.6695048650463, 1, 0, 0.2910948395008114, 0.002879737894923024, 0, -0.007577737385421218, 1, 0.2910948395008115, 0.0008004515663777076],
[347.8050577131609, 845.2468598726302, 1, 0, 0.2915255007652678, 0.002875173830349277, 0, -0.00756572751368569, 1, 0.2915255007652678, 0.0008013588617292975],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.970527952019, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2917270804914681, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7082729195085319, 1, 0.0008006403620710377],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918034265184565, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2918034265184565, 0.0008012401274361336],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.2543205283056, 845.6690096807067, 1, 1, 0.2910952546023751, 0.002879733788419451, 0.001182495738347516, -0.004466109310386838, 0.9152635527479784, 0.4974540619527286, 0.001606951975191846],
[347.8912530479604, 845.1606645378308, 0, 1, 0.2915977485304565, 0, 0.001183206982954941, 0.00311348883703486, 0.7084022514695435, 1, 0.0008012690435496776],
[348.072992690409, 844.9096154712015, 0, 0, 0.2917670302225029, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002402023089682232],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.150347697993, 844.8669151757078, 0, 1, 0.2918233947926117, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081766052073883, 1, 0.0005607134716240975],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008010728594848014],
[348.0774670528704, 845.1463460181803, 1, 0, 0.291711800619373, 0.002872923686979449, 0, -0.007559806490259856, 1, 0.2917118006193731, 0.0008012949980063388],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.6736343734064, 844.378283212385, 0, 1, 0.2922535299880054, 0, 0.001184303315091859, 0.003116373723550194, 0.7077464700119946, 1, 0.0008007521274371186],
[348.6395874743029, 844.4123301114887, 1, 0, 0.2922249923371272, 0.002868291599483684, 0, -0.007547617623123342, 1, 0.2922249923371272, 0.0008009064814099832],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.8455298586658, 844.2063877271257, 0, 1, 0.2923976104615586, 0, 0.001184544460380501, 0.003117008272851463, 0.7076023895384413, 1, 0.000800623594860461],
[348.4336450899399, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2920523742126959, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7079476257873041, 1, 0.0008005711566190839],
[348.4336450899399, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2920523742126959, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7079476257873041, 1, 0.0008011868856816384],
[348.4336450899399, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2920523742126959, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7079476257873041, 1, 0.0008008038764281888],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008012662946527473],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008012392536320255],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861763, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.0008012401429747495],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008019279169748802],
[348.4540625399936, 844.34068029224, 1, 0, 0.292132460034663, 0.002869818743712382, 0, -0.007551636147842253, 1, 0.292132460034663, 0.0008006581952340867],
[348.5233719641745, 844.1162715309565, 0, 1, 0.2922285653215395, 0, 0.00118467092002186, 0.003117341038536062, 0.7077714346784605, 1, 0.0008030081412438366],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.3582099788305, 844.5651202301819, 0, 1, 0.2920206195630314, 0, 0.001184041320256578, 0.003115684310787457, 0.7079793804369686, 1, 0.0008009507817403255],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2917719758861763, 0.0008011006627638385],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.4123301114887, 0, 0, 0.2919805583609738, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002876912114801823],
[348.2277027055769, 844.6182724958517, 0, 1, 0.2919301485229673, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158861, 0.7080698514770327, 1, 0.0005132325528939651],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.5548033903439, 844.2911718110845, 0, 1, 0.2922043672331506, 0, 0.001184425507914415, 0.003116695261535072, 0.7077956327668493, 1, 0.0008014295632015582],
[348.3912530479604, 844.6606645378308, 0, 1, 0.2920168417757964, 0, 0.001183907386698498, 0.003115331878251144, 0.7079831582242035, 1, 0.0008015198166094255],
[348.5558072203175, 844.4961103654737, 0, 1, 0.2921547688600511, 0, 0.00118413807680799, 0.003115938915811829, 0.7078452311399489, 1, 0.0008012201537253325],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008032933331435111],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.4123301114885, 0, 1, 0.2919805583609739, 0, 0.001184255563710171, 0.003116248070645859, 0.7080194416390262, 1, 0.0008030642911901675],
[348.2277027055769, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2919301485229674, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7080698514770325, 1, 0.0008011456224256176],
[348.5281740109901, 844.3178011904383, 0, 1, 0.2921820429935527, 0, 0.001184388151700768, 0.003116596962458193, 0.7078179570064473, 1, 0.0008017915580757255],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.3779383582835, 844.673979227508, 1, 0, 0.2920056815827815, 0.002870445828781404, 0, -0.00755328625842341, 1, 0.2920056815827815, 0.000801789639314291],
[348.150347697993, 844.8669151757078, 0, 1, 0.2918233947926117, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081766052073883, 1, 0.0008010847592956004],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.000801329571112626],
[348.150347697993, 844.8669151757078, 0, 1, 0.2918233947926117, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081766052073883, 1, 0.000801093034021942],
[348.2277027055769, 844.9015698877986, 0, 2, 0.2918608324382757, 0, 0.002367139642391239, 0.006228887217925149, 0.5014610806350119, 1, 0.001607539681073086],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008011015157415449],
[348.099115328798, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918034265184565, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2918034265184566, 0.0008011059653295359],
[348.2623574176674, 844.6344608310214, 0, 1, 0.2919467569114294, 0, 0.001183944115915087, 0.003115428527449037, 0.7080532430885706, 1, 0.0008034372287246402],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008013002459843527],
[348.099115328798, 844.9528022569932, 1, 2, 0.2917719758861764, 0.002872745019921833, 0.002366996114644162, -0.001330826806812881, 0.794284955845705, 0.6447620767125961, 0.002405999323419487],
[348.2277027055769, 844.9015698877986, 0, 1, 0.2918608324382757, 0, 0.00118356982119562, 0.003114443608962575, 0.7081391675617243, 1, 0.0008010617635202669],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 0, 0.2918797560882644, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003092860789062445],
[346.0455220380545, 841.0531422681829, 0.75, 1.75, 0.2915052745344381, 0.00216734490763768, 0.002080724643963086, -0.0002279324141058868, 0.7484656654037927, 0.5774855625639543, 0.0008043772373092724],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0004920118775685178],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008018523526722069],
[348.6503476979929, 844.4015698877984, 0, 1, 0.292234011411261, 0, 0.001184270654699135, 0.00311628778104848, 0.7077659885887391, 1, 0.0008011375054493367],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008022772801218649],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861763, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.0008010847597452065],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008011375070848233],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010872152094769],
[347.8839117350582, 845.1680058507332, 0, 1, 0.291591595141158, 0, 0.001183196705362049, 0.00311346179259445, 0.708408404858842, 1, 0.0008027368038979248],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.8839117350582, 844.7453608583173, 1, 0, 0.2916949296226679, 0.002874522121510411, 0, -0.007564012608158563, 1, 0.2916949296226679, 0.000801135596685498],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008012742531701126],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.9869986306055, 845.1606645378311, 0, 1, 0.291654595129086, 0, 0.001183206982954941, 0.00311348883703486, 0.7083454048709139, 1, 0.0008011015157415449],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008018506420202277],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.072992690409, 844.9096154712015, 0, 2, 0.2917670302225029, 0, 0.002367117101495656, 0.006228827903850955, 0.5015939394798531, 1, 0.001606258004188619],
[348.150347697993, 844.8669151757078, 0, 1, 0.2918233947926117, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081766052073883, 1, 0.0008012214440001323],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008034910515088891],
[348.6197795264264, 844.7687158834806, 0, 2, 0.292125976467271, 0, 0.002367511914676373, 0.006229866814581355, 0.5010856331924146, 1, 0.001602926890604955],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008008954717577675],
[348.2277027055769, 844.7895601681239, 0, 1, 0.291888234598364, 0, 0.001183726749417911, 0.003114856549619077, 0.708111765401636, 1, 0.0008016069937933036],
[348.5761434127575, 844.8984191654499, 0, 1, 0.2920683476150047, 0, 0.001183574234862165, 0.003114455223077195, 0.7079316523849953, 1, 0.0008014437701088928],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010872153238775],
[348.0774670528704, 844.9744505329211, 1, 0, 0.2917538305937473, 0.002872923686979449, 0, -0.007559806490259856, 1, 0.2917538305937473, 0.0008011903510920434],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010847592423979],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011850512790273],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008018864826340238],
[348.021760321214, 845.0301572645774, 0, 1, 0.291707137963833, 0, 0.001183389718583619, 0.003113969687256515, 0.708292862036167, 1, 0.0008018523526722069],
[348.4336450899399, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2920523742126959, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7079476257873041, 1, 0.0008011850512790273],
[348.1503476979929, 844.9015698877984, 0, 1, 0.2918149181659211, 0, 0.00118356982119562, 0.003114443608962575, 0.7081850818340789, 1, 0.0008010930340956111],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008011006642311293],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 2, 0.2918797560882644, 0, 0.002367356385829418, 0.006229457556238726, 0.5014342798376159, 1, 0.001604405323113282],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2917719758861763, 0.0008011746511963346],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010845044195168],
[348.1936558064734, 844.8582617793181, 0, 1, 0.2918512184373863, 0, 0.001183630491928841, 0.003114603257826502, 0.7081487815626137, 1, 0.0008018931594237634],
[348.3582099788305, 844.5651202301819, 0, 1, 0.2920206195630314, 0, 0.001184041320256578, 0.003115684310787457, 0.7079793804369686, 1, 0.000801132208721936],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861763, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.0008010899095199205],
[348.6503476979929, 844.7393431855278, 0, 1, 0.2921512984077072, 0, 0.001183797118089684, 0.003115041717621969, 0.7078487015922927, 1, 0.0008034130402483123],
[348.3779383582835, 844.5020837422485, 1, 0, 0.2920477599623371, 0.002870445828781404, 0, -0.007553286258423409, 1, 0.2920477599623371, 0.0008013550309295376],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010988505233084],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011271617792111],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008010847592956004],
[348.3912530479604, 845.0833095302469, 0, 1, 0.2919134298894038, 0, 0.001183315288235743, 0.003113773831366052, 0.7080865701105962, 1, 0.000801787858360616],
[348.3562900823559, 844.6956275034354, 1, 0, 0.2919875362903525, 0.002870624209953514, 0, -0.007553755650335477, 1, 0.2919875362903526, 0.000801335461240974],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008018506420202277],
[348.2093121305159, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918877661245693, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081122338754307, 1, 0.0008021830523065443],
[348.2621952542346, 844.7897223315567, 1, 1, 0.2919086672765784, 0.002871399806315443, 0.00118372652219309, -0.004440940601579436, 0.9147893299688117, 0.4986066645219688, 0.001607128148082118],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010898024153095],
[348.2277027055769, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2919301485229674, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7080698514770325, 1, 0.0008010988504091949],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008013236787703824],
[348.4336450899399, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2920523742126959, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7079476257873041, 1, 0.0008014436170578676],
[348.041488700667, 845.0444757842279, 0, 1, 0.2917153491541836, 0, 0.00118336966710772, 0.003113916923837032, 0.7082846508458165, 1, 0.0008010872153238775],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861763, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.0008013558787496733],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.3840592145467, 842.6741829612945, 0.5, 1, 0.2919050907789248, 0.001439329142305855, 0.001186698275822142, -0.0006647724312132807, 0.7800754066370446, 0.4041496371900772, 0.0008011697383998218],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012719385754621],
[349.0036832662281, 844.8935243043954, 0, 1, 0.2923230585122071, 0, 0.001183581091858059, 0.003114473266564497, 0.7076769414877929, 1, 0.0008006036921327804],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.6156929859025, 844.8588695923049, 0, 1, 0.2921014857935508, 0, 0.001183629640394922, 0.003114601017101599, 0.7078985142064492, 1, 0.000801220199286358],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012401296210937],
[348.2617496046805, 844.7901679811109, 0, 1, 0.2919082937391425, 0, 0.001183725897745485, 0.003114854308529709, 0.7080917062608575, 1, 0.0008010872152895069],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011377547274043],
[348.3562900823559, 844.6956275034356, 1, 0, 0.2919875362903525, 0.002870624209953514, 0, -0.007553755650335477, 1, 0.2919875362903525, 0.000801826677744258],
[348.2277027055769, 844.669115543112, 0, 1, 0.2919177060232382, 0, 0.001183895541577855, 0.003115300709020885, 0.7080822939767618, 1, 0.0008032959049324262],
[348.2277027055769, 844.9960149528829, 0, 1, 0.2918377313090346, 0, 0.001183437533792109, 0.003114095508114589, 0.7081622686909654, 1, 0.0008013835092695458],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008018523526350012],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008011322088229282],
[348.323448288222, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2919365800568553, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7080634199431447, 1, 0.0008034130405503553],
[348.021760321214, 845.0301572645774, 0, 1, 0.291707137963833, 0, 0.001183389718583619, 0.003113969687256515, 0.708292862036167, 1, 0.0008011059653652094],
[348.2277027055769, 844.6182724958514, 1, 1, 0.2919301485229674, 0.002871684223370046, 0.001183966807922583, -0.004441056728673067, 0.9147767883833582, 0.4986370854292931, 0.001606138803303482],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008014358293494283],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010845007941453],
[348.3562900823559, 844.6956275034354, 1, 0, 0.2919875362903525, 0.002870624209953514, 0, -0.007553755650335477, 1, 0.2919875362903526, 0.000801329571112626],
[348.2617496046805, 844.7901679811109, 0, 1, 0.2919082937391426, 0, 0.001183725897745485, 0.003114854308529709, 0.7080917062608574, 1, 0.0008010872152951365],
[348.5719773038102, 845.3252302668132, 1, 0, 0.2919614645996991, 0.002868847942783464, 0, -0.00754908158393356, 1, 0.2919614645996991, 0.0008010979116625329],
[348.5207449346152, 845.376462636008, 0, 1, 0.2919185527234756, 0, 0.001182904947319982, 0.003112694060980139, 0.7080814472765244, 1, 0.0008011935084235584],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.335546316304, 845.1390162619032, 0, 1, 0.2918667537947445, 0, 0.001183237290857847, 0.003113568589198876, 0.7081332462052554, 1, 0.0008012206036258942],
[348.3779383582835, 844.673979227508, 1, 0, 0.2920056815827815, 0.002870445828781404, 0, -0.007553286258423409, 1, 0.2920056815827815, 0.0008013373619196501],
[348.150347697993, 844.9015698877986, 0, 1, 0.291814918165921, 0, 0.00118356982119562, 0.003114443608962575, 0.7081850818340789, 1, 0.0008018523526722069],
[348.3355463163041, 845.1390162619034, 0, 1, 0.2918667537947445, 0, 0.001183237290857846, 0.003113568589198876, 0.7081332462052554, 1, 0.0008010872152895069],
[348.098507515811, 844.9534100699802, 1, 0, 0.2917714664255419, 0.002872750036006917, 0, -0.007559349545386888, 1, 0.2917714664255419, 0.0008011322087822316],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008010898047424864],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011324593260641],
[348.1930479934865, 844.8588695923049, 0, 1, 0.2918507089767517, 0, 0.001183629640394922, 0.003114601017101599, 0.7081492910232483, 1, 0.0008018931594229923],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008011059653652094],
[348.7611806939744, 844.8542635483716, 0.5, 1.5, 0.2921888975015337, 0.001433645794537931, 0.001775454140102257, 0.0008994338975773355, 0.7078111024984663, 0.4990034431799055, 0.001608306943989493],
[348.3779383582835, 844.6739792275077, 1, 0, 0.2920056815827816, 0.002870445828781404, 0, -0.007553286258423409, 1, 0.2920056815827816, 0.0008017001793496323],
[348.2277027055769, 845.091760535528, 1, 0, 0.2918143158075844, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918143158075843, 0.000801443512529696],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010872152094769],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008013550309283202],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008018326722877227],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008010930340160782],
[348.099115328798, 844.9528022569932, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.0008011271614011703],
[348.4336450899399, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2920523742126959, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7079476257873041, 1, 0.0008018931594229923],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008013550309283202],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010847592433276],
[348.150347697993, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918338400657804, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081661599342195, 1, 0.0008022835938996178],
[348.3562900823559, 844.6956275034354, 1, 0, 0.2919875362903525, 0.002870624209953514, 0, -0.007553755650335477, 1, 0.2919875362903526, 0.000801329571112626],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011585488635177],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 1, 0.2917719758861763, 0.002872745019921833, 0.001183498057322081, -0.004445081576441019, 0.9148691140874767, 0.4984130658598291, 0.001602567967207957],
[348.1415073707774, 844.6428645597005, 0, 1, 0.2918729617552945, 0, 0.001183932336326886, 0.003115397530660735, 0.7081270382447055, 1, 0.0008021830300647001],
[348.3562900823559, 844.6956275034354, 1, 0, 0.2919875362903525, 0.002870624209953514, 0, -0.007553755650335477, 1, 0.2919875362903526, 0.0008018266777404165],
[348.1175059038591, 845.0301572645774, 0, 1, 0.2917639757843749, 0, 0.001183389718583619, 0.003113969687256515, 0.7082360242156251, 1, 0.0008018864826340238],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008011375950292857],
[348.5558072203176, 844.4961103654739, 0, 1, 0.2921547688600511, 0, 0.00118413807680799, 0.003115938915811828, 0.7078452311399489, 1, 0.0008010988505233084],
[348.2277027055769, 844.5566692249008, 1, 0, 0.2919452257259065, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2919452257259065, 0.0008013491435366099],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2917719758861763, 0.0008010845007941453],
[348.3995981908363, 844.6523193949549, 0, 1, 0.2920238365618177, 0, 0.001183919083672587, 0.003115362657648812, 0.7079761634381823, 1, 0.0008011850511938529],
[348.2277027055769, 844.6182724958517, 0, 1, 0.2919301485229673, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158861, 0.7080698514770327, 1, 0.0008010930340213219],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.6001307153968, 844.7107531754045, 0, 1, 0.2915348131194549, 0, 0.001183837184788803, 0.003115147149065699, 0.7084651868805452, 1, 0.0008017916704027786],
[347.9139167104869, 844.8704552199911, 0, 1, 0.2916821555495407, 0, 0.001183613409394954, 0.003114558306875964, 0.7083178444504592, 1, 0.0008017330020377147],
[348.3355463163041, 844.8121168521322, 0, 1, 0.2919467196468286, 0, 0.001183695143632783, 0.003114773382209994, 0.7080532803531714, 1, 0.000801135014864649],
[348.099115328798, 844.9528022569932, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.000801084501662295],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008012225431447851],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.000801858063368594],
[348.3912530479604, 844.6606645378311, 0, 1, 0.2920168417757963, 0, 0.001183907386698498, 0.003115331878251144, 0.7079831582242037, 1, 0.0008018523526350012],
[348.2277027055769, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2919301485229674, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7080698514770325, 1, 0.0008018931593844875],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011323046502417],
[348.4336450899399, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2920523742126959, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7079476257873041, 1, 0.000801813175272665],
[347.970527952019, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2917270804914681, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7082729195085319, 1, 0.0008005281363579726],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918034265184565, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2918034265184565, 0.0008011320040378994],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012403007895003],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008018523526722069],
[348.3779383582835, 844.6739792275077, 1, 0, 0.2920056815827816, 0.002870445828781404, 0, -0.007553286258423409, 1, 0.2920056815827816, 0.0008018588240293079],
[348.3355463163041, 845.1390162619032, 0, 1, 0.2918667537947446, 0, 0.001183237290857847, 0.003113568589198876, 0.7081332462052554, 1, 0.0008012225431447851]
],
"NAMES": [
["epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_2"],
["epi_isl_423828_England_20200323_null_23"],
["epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1"],
["epi_isl_428345_Wisconsin_20200316_null_1"],
["epi_isl_427615_New_York_20200316_null_1"],
["epi_isl_428302_Wisconsin_20200325_null_2"],
["epi_isl_422581_Netherlands_20200330_null_1"],
["epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1"],
["epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1"],
["epi_isl_428279_Wisconsin_20200322_null_2"],
["epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1"],
["epi_isl_425221_Comunitat_Valenciana_20200317_null_21"],
["Node1092"],
["epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1"],
["epi_isl_427200_Washington_20200325_null_2"],
["epi_isl_428398_Connecticut_20200408_null_3"],
["Node1098"],
["epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1"],
["epi_isl_428884_Moscow_20200322_null_1"],
["Node1103"],
["epi_isl_427698_New_South_Wales_20200321_null_2"],
["epi_isl_422097_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1"],
["epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_1"],
["epi_isl_426461_Virginia_20200327_null_2"],
["epi_isl_427470_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_422276_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1"],
["epi_isl_425333_England_20200329_null_23"],
["epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_429204_Switzerland_20200403_null_2"],
["Node1064"],
["epi_isl_425439_England_20200101_null_5"],
["epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1"],
["epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_427321_Saint_Petersburg_20200405_null_2"],
["epi_isl_422556_New_York_20200321_null_1"],
["epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1"],
["epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_423204_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_427607_New_York_20200316_null_2"],
["epi_isl_422607_Netherlands_20200401_null_3"],
["epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2"],
["epi_isl_423469_England_20200331_null_2"],
["epi_isl_418060_USA_20200314_null_1"],
["epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_1"],
["Node1037"],
["epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2"],
["epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1"],
["epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2"],
["epi_isl_429020_California_20200331_null_1"],
["epi_isl_423921_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1"],
["epi_isl_428353_Hauts_De_France_20200324_null_1"],
["epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1"],
["epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1"],
["epi_isl_421906_England_20200327_null_1"],
["Node1009"],
["epi_isl_427183_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1"],
["epi_isl_424611_Reykjavik_20200327_null_1"],
["Node1015"],
["epi_isl_428206_Nebraska_20200325_null_2"],
["epi_isl_425249_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1"],
["epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1"],
["Node63"],
["epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1"],
["epi_isl_424872_North_Carolina_20200308_null_3"],
["epi_isl_427665_New_South_Wales_20200311_null_3"],
["Node69"],
["epi_isl_427716_New_South_Wales_20200322_null_1"],
["epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1"],
["epi_isl_428701_Madrid_20200327_null_7"],
["Node708"],
["epi_isl_428854_Friuli_Venezia_Giulia_20200330_null_4"],
["epi_isl_420727_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_427105_Victoria_20200404_null_1"],
["epi_isl_427557_New_York_20200315_null_1"],
["epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_15"],
["Node717"],
["epi_isl_429095_Guangzhou_20200208_null_31"],
["epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_1"],
["epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10"],
["epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1"],
["Node722"],
["epi_isl_424212_Washington_20200319_null_3"],
["epi_isl_421855_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_426102_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_428350_Hauts_De_France_20200324_null_1"],
["epi_isl_423634_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_424955_New_York_20200401_null_2"],
["epi_isl_420745_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_424176_Washington_20200317_null_1"],
["Node788"],
["epi_isl_428457_Guangdong_20200123_null_1"],
["epi_isl_423945_England_20200319_null_5"],
["epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_424657_Li_ge_20200405_null_2"],
["Node761"],
["epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_422274_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_429016_California_20200323_null_208"],
["epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_422106_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_422152_Wales_20200330_null_1"],
["Node746"],
["epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1"],
["Node737"],
["epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1"],
["epi_isl_422510_New_York_20200320_null_1"],
["Node758"],
["epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_427454_Wisconsin_20200410_null_7"],
["epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2"],
["epi_isl_414617_USA_20200308_null_1"],
["epi_isl_423875_England_20200318_null_1"],
["Node696"],
["epi_isl_427428_Wisconsin_20200411_null_9"],
["epi_isl_421844_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_425441_England_20200331_null_5"],
["Node676"],
["epi_isl_427344_Liege_20200330_null_11"],
["epi_isl_422727_Netherlands_20200324_null_3"],
["epi_isl_425512_England_20200319_null_12"],
["Node681"],
["epi_isl_422989_Washington_20200318_null_4"],
["epi_isl_428822_Singapore_20200216_null_2"],
["epi_isl_426096_Washington_20200325_null_8"],
["epi_isl_428796_New_York_20200406_null_1"],
["epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2"],
["epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1"],
["Node670"],
["epi_isl_423867_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_424336_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_427119_Victoria_20200405_null_30"],
["Node665"],
["epi_isl_429181_Bangkok_20200328_null_1"],
["epi_isl_429164_Bangkok_20200313_null_1"],
["epi_isl_423192_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1"],
["epi_isl_428799_New_York_20200405_null_2"],
["Node138"],
["epi_isl_418754_England_20200317_null_2"],
["epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_2"],
["Node135"],
["epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1"],
["epi_isl_428898_Republic_of_Kabardino_Balkaria_20200323_null_59"],
["Node131"],
["epi_isl_425549_England_20200322_null_4"],
["epi_isl_417257_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_423998_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_423646_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_422053_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_422172_Wales_20200323_null_4"],
["Node167"],
["epi_isl_426127_Washington_20200325_null_4"],
["epi_isl_426848_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1"],
["Node162"],
["epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1"],
["Node161"],
["epi_isl_429062_California_20200408_null_79"],
["epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_428844_Singapore_20200408_null_1"],
["Node153"],
["epi_isl_414485_USA_20200224_null_1"],
["epi_isl_428484_Karnataka_20200410_null_1"],
["Node158"],
["epi_isl_423463_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_427488_New_York_20200401_null_3"],
["epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1"],
["epi_isl_426967_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_61"],
["Node190"],
["epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_5"],
["epi_isl_428710_Madrid_20200322_null_93"],
["epi_isl_425219_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1"],
["epi_isl_425781_Scotland_20200324_null_1"],
["epi_isl_426675_Victoria_20200322_null_1"],
["Node180"],
["epi_isl_426453_Washington_20200320_null_2"],
["Node179"],
["epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1"],
["epi_isl_421955_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_423819_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_425452_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_425938_Scotland_20200325_null_6"],
["Node207"],
["epi_isl_425814_Scotland_20200312_null_2"],
["epi_isl_417938_California_20200318_null_1"],
["epi_isl_425627_England_20200329_null_11"],
["Node202"],
["epi_isl_429035_California_20200325_null_2"],
["epi_isl_423376_England_20200328_null_2"],
["epi_isl_426761_Victoria_20200327_null_7"],
["Node432"],
["epi_isl_420461_England_20200310_null_1"],
["epi_isl_428897_St__Petersburg_20200324_null_16"],
["Node427"],
["epi_isl_420641_England_20200325_null_1"],
["Node426"],
["epi_isl_420657_England_20200325_null_1"],
["Node425"],
["epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2"],
["epi_isl_424142_England_20200321_null_2"],
["Node421"],
["epi_isl_424138_England_20200320_null_2"],
["Node420"],
["epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1"],
["epi_isl_428932_Malopolskie_20200328_null_13"],
["Node220"],
["epi_isl_423862_England_20200318_null_1"],
["Node219"],
["epi_isl_427404_Doha_20200323_null_17"],
["epi_isl_420706_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_423896_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_426906_Victoria_20200328_null_1"],
["epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1"],
["epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1"],
["epi_isl_425276_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421783_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_425804_Scotland_20200307_null_1"],
["epi_isl_425739_Scotland_20200313_null_2"],
["epi_isl_427043_Athens_20200318_null_1"],
["epi_isl_423566_England_20200401_null_2"],
["epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_23"],
["epi_isl_421879_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_424957_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1"],
["epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1"],
["epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1"],
["epi_isl_422937_Zuid_Holland_20200324_null_1"],
["epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1"],
["epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_1"],
["epi_isl_425264_England_20200331_null_3"],
["epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1"],
["epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2"],
["Node388"],
["epi_isl_420691_England_20200328_null_2"],
["epi_isl_423714_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423064_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_423172_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_423783_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_422951_Zuid_Holland_20200327_null_4"],
["epi_isl_428825_Singapore_20200316_null_4"],
["epi_isl_428888_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200320_null_1"],
["epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1"],
["epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_425619_England_20200329_null_1"],
["Node376"],
["epi_isl_423524_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_424662_Li_ge_20200405_null_5"],
["epi_isl_426684_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_425323_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_423270_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_423628_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_425695_Scotland_20200316_null_1"],
["epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1"],
["epi_isl_427697_New_South_Wales_20200322_null_9"],
["epi_isl_427363_Liege_20200407_null_1"],
["epi_isl_421803_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_421804_England_20200325_null_1"],
["Node358"],
["epi_isl_422103_Wales_20200329_null_2"],
["epi_isl_423454_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_424097_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_422226_Wales_20200325_null_2"],
["epi_isl_422245_Wales_20200330_null_1"],
["Node349"],
["epi_isl_422748_Netherlands_20200325_null_1"],
["epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_423548_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1"],
["epi_isl_427111_Victoria_20200404_null_1"],
["epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2"],
["epi_isl_425428_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1"],
["epi_isl_426703_Victoria_20200324_null_1"],
["epi_isl_426854_Victoria_20200325_null_1"],
["epi_isl_425656_Scotland_20200314_null_1"],
["epi_isl_423207_England_20200324_null_3"],
["epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1"],
["epi_isl_424056_England_20200312_null_1"],
["epi_isl_424058_England_20200312_null_1"],
["Node334"],
["epi_isl_423500_England_20200331_null_2"],
["epi_isl_426662_Victoria_20200321_null_1"],
["Node331"],
["epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1"],
["epi_isl_426626_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1"],
["epi_isl_429203_Switzerland_20200321_null_25"],
["epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3"],
["epi_isl_427781_New_South_Wales_20200322_null_2"],
["epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1"],
["epi_isl_421850_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_422186_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_423478_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_423531_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_423833_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_422287_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_425914_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_422251_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_417297_England_20200306_null_2"],
["epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_422657_Netherlands_20200318_null_1"],
["epi_isl_423553_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_425742_Scotland_20200319_null_1"],
["epi_isl_427159_Victoria_20200330_null_44"],
["Node363"],
["epi_isl_429169_Bangkok_20200317_null_1662"],
["Node231"],
["epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1"],
["Node230"],
["epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1"],
["epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1"],
["epi_isl_424207_Washington_20200320_null_4"],
["Node227"],
["epi_isl_422288_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_429214_Switzerland_20200323_null_1"],
["Node416"],
["epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2"],
["epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2"],
["epi_isl_424185_USA_20200318_null_1"],
["epi_isl_425430_England_20200330_null_1"],
["Node438"],
["epi_isl_427155_Victoria_20200330_null_1"],
["epi_isl_429219_Switzerland_20200403_null_61"],
["epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1"],
["epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2"],
["Node447"],
["epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1"],
["Node446"],
["epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1"],
["Node445"],
["epi_isl_426062_Idaho_20200324_null_4"],
["epi_isl_428444_Guangdong_20200130_null_1"],
["Node455"],
["epi_isl_423288_England_20200326_null_1"],
["Node454"],
["epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1"],
["epi_isl_423765_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423382_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_421860_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_428831_Singapore_20200313_null_2"],
["Node495"],
["epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_421898_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_423133_England_20200323_null_1"],
["Node477"],
["epi_isl_417259_England_20200304_null_1"],
["epi_isl_423971_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_423668_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_1"],
["Node486"],
["epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1"],
["epi_isl_423187_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_423128_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423378_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1"],
["epi_isl_428489_Taiwan_20200131_null_3"],
["epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1"],
["epi_isl_426678_Victoria_20200322_null_1"],
["Node500"],
["epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_421917_England_20200327_null_1"],
["Node508"],
["epi_isl_423152_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_422464_Wisconsin_20200326_null_1"],
["epi_isl_422270_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1"],
["epi_isl_429207_Switzerland_20200403_null_7094"],
["epi_isl_423203_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_421871_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4"],
["epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1"],
["epi_isl_426850_Victoria_20200323_null_3"],
["Node577"],
["epi_isl_429079_Guangzhou_20200205_null_4"],
["epi_isl_427085_Victoria_20200402_null_1"],
["epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_17"],
["Node571"],
["epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1"],
["Node570"],
["epi_isl_423569_England_20200331_null_1"],
["Node569"],
["epi_isl_415137_England_20200302_null_1"],
["epi_isl_424301_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_426930_Victoria_20200328_null_1"],
["Node564"],
["epi_isl_427509_New_York_20200403_null_1"],
["Node563"],
["epi_isl_417238_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1"],
["Node557"],
["epi_isl_429175_Bangkok_20200328_null_1"],
["epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1"],
["epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_2"],
["epi_isl_428722_Balikesir_20200322_null_90"],
["epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2"],
["epi_isl_421670_India_20200312_null_2"],
["epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1"],
["epi_isl_426978_Victoria_20200329_null_3"],
["epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1"],
["epi_isl_427134_Victoria_20200406_null_2"],
["epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2"],
["epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6"],
["epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_9"],
["Node531"],
["epi_isl_424361_India_20200310_null_1"],
["epi_isl_427164_Connecticut_20200331_null_3"],
["Node560"],
["epi_isl_422256_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_5"],
["Node584"],
["epi_isl_421842_England_20200323_null_1"],
["Node583"],
["epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1"],
["epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_3"],
["Node590"],
["epi_isl_426658_Victoria_20200320_null_4"],
["epi_isl_426984_Victoria_20200327_null_1"],
["Node601"],
["epi_isl_424501_Reykjavik_20200320_null_6"],
["epi_isl_426733_Victoria_20200325_null_1"],
["Node598"],
["epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_427006_Victoria_20200328_null_1"],
["epi_isl_424085_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_427689_New_South_Wales_20200322_null_1"],
["Node612"],
["epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1"],
["epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1"],
["epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1"],
["Node607"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_423551_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_1"],
["Node619"],
["epi_isl_422953_Zuid_Holland_20200327_null_1"],
["epi_isl_424122_England_20200312_null_1"],
["Node622"],
["epi_isl_423726_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_422429_Singapore_20200216_null_1"],
["epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1"],
["epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_1"],
["epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1"],
["epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1"],
["epi_isl_427062_Victoria_20200330_null_1"],
["Node651"],
["epi_isl_426010_Scotland_20200331_null_1"],
["epi_isl_427074_Victoria_20200401_null_1"],
["Node648"],
["epi_isl_427148_Victoria_20200408_null_37"],
["epi_isl_422164_Wales_20200326_null_2"],
["epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_1"],
["Node640"],
["epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_427008_Victoria_20200329_null_1"],
["Node645"],
["epi_isl_426033_New_York_20200304_null_3"],
["epi_isl_426326_New_York_20200306_null_1"],
["Node656"],
["epi_isl_420648_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_420758_England_20200327_null_7"],
["Node659"],
["epi_isl_422822_Netherlands_20200309_null_1"],
["epi_isl_424021_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_421872_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_423426_England_20200330_null_1"],
["Node775"],
["epi_isl_426653_Victoria_20200320_null_6"],
["epi_isl_427687_New_South_Wales_20200318_null_33"],
["epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1"],
["epi_isl_418669_England_20200311_null_1"],
["Node767"],
["epi_isl_421929_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_1"],
["Node778"],
["epi_isl_424123_England_20200312_null_1"],
["epi_isl_427471_New_York_20200401_null_1"],
["Node117"],
["epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1"],
["epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3"],
["epi_isl_423247_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_423977_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_424269_Washington_20200322_null_4"],
["epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2"],
["epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_1"],
["epi_isl_429209_Switzerland_20200316_null_12"],
["Node109"],
["epi_isl_425296_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_420743_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_427722_New_South_Wales_20200318_null_3"],
["Node795"],
["epi_isl_421709_New_York_20200318_null_2"],
["epi_isl_424951_New_York_20200401_null_1"],
["Node799"],
["epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2"],
["epi_isl_423701_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_427693_New_South_Wales_20200322_null_1"],
["epi_isl_428280_Wisconsin_20200322_null_1"],
["Node102"],
["epi_isl_417253_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_425505_England_20200318_null_6"],
["Node105"],
["epi_isl_422628_Zuid_Holland_20200331_null_5"],
["epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1"],
["epi_isl_426958_Victoria_20200327_null_2"],
["epi_isl_422983_USA_20200317_null_1"],
["epi_isl_423879_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_423890_England_20200318_null_2"],
["Node813"],
["epi_isl_427612_New_York_20200316_null_1"],
["epi_isl_423807_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1"],
["epi_isl_422877_Noord_Brabant_20200312_null_6"],
["Node95"],
["epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1"],
["Node94"],
["epi_isl_423044_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1"],
["epi_isl_425050_Ghent_20200324_null_4"],
["epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1"],
["epi_isl_428955_Luxembourg_20200401_null_1"],
["epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2"],
["epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1"],
["epi_isl_426415_Gujarat_20200405_null_2"],
["Node89"],
["epi_isl_423546_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_6"],
["Node836"],
["epi_isl_427214_Washington_20200327_null_4"],
["epi_isl_422917_Zuid_Holland_20200319_null_6"],
["epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1"],
["Node85"],
["epi_isl_427583_New_York_20200316_null_8"],
["epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1"],
["epi_isl_428730_Wisconsin_20200406_null_1"],
["Node841"],
["epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1"],
["epi_isl_423060_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2"],
["epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_1"],
["epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1"],
["epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_423970_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_426008_Scotland_20200331_null_2"],
["epi_isl_427250_Washington_20200331_null_2"],
["epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1"],
["epi_isl_422942_Zuid_Holland_20200326_null_1"],
["epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1"],
["epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2"],
["epi_isl_426073_Idaho_20200327_null_1"],
["epi_isl_424092_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_424971_Taoyuan_20200317_null_2"],
["epi_isl_425995_Scotland_20200330_null_2"],
["epi_isl_427267_Washington_20200330_null_1"],
["epi_isl_423338_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_421969_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_425451_England_20200401_null_3"],
["epi_isl_418938_Washington_20200316_null_6"],
["epi_isl_422511_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_428758_New_York_20200403_null_2"],
["epi_isl_423805_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2"],
["epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1"],
["epi_isl_427232_Washington_20200328_null_1"],
["epi_isl_428969_Budapest_20200326_null_4"],
["epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_1"],
["epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1"],
["epi_isl_421878_England_20200327_null_1"],
["Node21"],
["epi_isl_423357_England_20200329_null_2"],
["epi_isl_425238_England_20200330_null_1"],
["Node17"],
["epi_isl_423156_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_422515_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_4"],
["epi_isl_427377_Liege_20200407_null_1"],
["epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4"],
["epi_isl_425947_Scotland_20200326_null_2"],
["epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_413609_USA_20200221_null_1"],
["epi_isl_428953_Luxembourg_20200404_null_4"],
["epi_isl_427461_Wisconsin_20200412_null_4"],
["epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_424645_Li_ge_20200404_null_1"],
["epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1"],
["epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2"],
["epi_isl_428912_Sakhalin_Region_20200327_null_5"],
["epi_isl_425457_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1"],
["epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2"],
["Node903"],
["epi_isl_428782_New_York_20200406_null_1"],
["epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3"],
["epi_isl_417281_England_20200306_null_1"],
["epi_isl_424507_Reykjavik_20200320_null_1"],
["epi_isl_423790_England_20200312_null_1"],
["epi_isl_413607_USA_20200218_null_1"],
["epi_isl_428331_Wisconsin_20200328_null_1"],
["epi_isl_426288_Latvia_20200330_null_3"],
["epi_isl_424623_Reykjavik_20200328_null_1"],
["epi_isl_425611_England_20200329_null_2"],
["epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1"],
["epi_isl_425895_Scotland_20200322_null_1"],
["epi_isl_424049_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1"],
["epi_isl_429063_California_20200325_null_4"],
["epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1"],
["epi_isl_424215_Washington_20200320_null_4"],
["epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2"],
["epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_424341_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_426535_Arizona_20200317_null_5"],
["epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1"],
["epi_isl_422543_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1"],
["epi_isl_426451_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_423514_England_20200329_null_3"],
["epi_isl_426559_Arizona_20200325_null_3"],
["epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1"],
["epi_isl_425592_England_20200325_null_2"],
["epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1"],
["epi_isl_428890_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3"],
["Node972"],
["epi_isl_428780_New_York_20200406_null_2"],
["epi_isl_428307_Wisconsin_20200325_null_2"],
["epi_isl_424438_Reykjavik_20200319_null_2"],
["epi_isl_426963_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_420772_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_422883_Noord_Brabant_20200101_null_1"],
["epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1"],
["epi_isl_429069_California_20200325_null_1"],
["Node990"],
["epi_isl_428305_Wisconsin_20200325_null_1"],
["epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1"],
["epi_isl_420640_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_422142_Wales_20200325_null_3"]
],
"RESOLVED": [
[348.2277027055769, 844.7815145847208, 1, 0, 0.2918902030753061, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918902030753061, 0.0008018073701787395],
[348.650347697993, 844.4015698877984, 0, 1, 0.292234011411261, 0, 0.001184270654699135, 0.00311628778104848, 0.707765988588739, 1, 0.0008010899095527304],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.000801329571112626],
[348.5558072203176, 844.4961103654739, 0, 1, 0.2921547688600511, 0, 0.00118413807680799, 0.003115938915811828, 0.7078452311399489, 1, 0.0008010930340160782],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008010930341014752],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008011271578973006],
[348.7277027055769, 844.3242148802144, 0, 1, 0.2922988493336043, 0, 0.001184379154803551, 0.003116573288038198, 0.7077011506663957, 1, 0.0008018266777039218],
[348.3562900823559, 844.6956275034356, 1, 0, 0.2919875362903525, 0.002870624209953513, 0, -0.007553755650335476, 1, 0.2919875362903525, 0.0008013354613717088],
[348.3355463163041, 845.1390162619032, 0, 1, 0.2918667537947446, 0, 0.001183237290857847, 0.003113568589198876, 0.7081332462052554, 1, 0.0008010872152951365],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008022874879283626],
[347.643427267252, 844.9966055498135, 1, 1, 0.2914906574501812, 0.002876510589775214, 0.001183436706647278, -0.004455151728592222, 0.9150331966192611, 0.4980145115196235, 0.001602545766998494],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.9355649864145, 844.9104102150138, 1, 0, 0.2916852403577594, 0.00287409538038759, 0, -0.007562889682295761, 1, 0.2916852403577594, 0.000801144528127141],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012401409289543],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008023447122626532],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012286588971387],
[348.541488700667, 844.777974540438, 0, 1, 0.29207726802177, 0, 0.001183742983526533, 0.00311489926802482, 0.70792273197823, 1, 0.0008014435124998123],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8588695923047, 1, 0, 0.291871278070703, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.291871278070703, 0.0008007555086668824],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011322555693206],
[348.2277027055769, 844.8588695923047, 1, 0, 0.291871278070703, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.291871278070703, 0.0008011413174363823],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861763, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.000801084501662295],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.000803406987935464],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.000801335461240974],
[348.3355463163041, 845.1390162619034, 0, 1, 0.2918667537947445, 0, 0.001183237290857846, 0.003113568589198876, 0.7081332462052554, 1, 0.0008010930340160782],
[348.2277027055769, 845.091760535528, 1, 0, 0.2918143158075844, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918143158075843, 0.0008011797524394055],
[347.8912530479604, 845.1606645378308, 0, 1, 0.2915977485304565, 0, 0.001183206982954941, 0.00311348883703486, 0.7084022514695435, 1, 0.0008010847592956004],
[348.1503476979929, 844.9015698877984, 0, 1, 0.2918149181659211, 0, 0.00118356982119562, 0.003114443608962575, 0.7081850818340789, 1, 0.0008013550309283202],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.000801093034021942],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008005064942123528],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008009978630906727],
[348.2277027055769, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2919301485229674, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7080698514770325, 1, 0.0008011294940228676],
[348.0641523631934, 844.9877652225978, 0, 1, 0.2917426704007325, 0, 0.00118344908785344, 0.003114125911451869, 0.7082573295992675, 1, 0.0008018523527680838],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008011322088229282],
[348.4336450899398, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2920523742126958, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7079476257873042, 1, 0.0008017878583743348],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.000801826677744258],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008022772707265011],
[348.099115328798, 844.9528022569932, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.0008011375038548125],
[347.9869986306055, 845.1606645378308, 0, 1, 0.2916545951290861, 0, 0.001183206982954941, 0.00311348883703486, 0.7083454048709139, 1, 0.0008010988505233084],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008011270052055141],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010847592433276],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008015849162701247],
[348.098507515811, 844.9534100699802, 1, 0, 0.2917714664255419, 0.002872750036006917, 0, -0.007559349545386888, 1, 0.2917714664255419, 0.0008011324553234416],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.3562900823559, 844.6956275034354, 1, 0, 0.2919875362903525, 0.002870624209953514, 0, -0.007553755650335477, 1, 0.2919875362903526, 0.0008010969090102041],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008009978713033132],
[348.2277027055769, 845.091760535528, 1, 0, 0.2918143158075844, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918143158075843, 0.0008019464889994576],
[348.021760321214, 845.0301572645774, 0, 1, 0.291707137963833, 0, 0.001183389718583619, 0.003113969687256515, 0.708292862036167, 1, 0.0008018523526722069],
[348.150347697993, 844.9015698877984, 0, 1, 0.2918149181659211, 0, 0.00118356982119562, 0.003114443608962575, 0.7081850818340789, 1, 0.0008013550309273268],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010872153238775],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.000801858342054204],
[348.1850024100834, 844.8669151757078, 0, 1, 0.2918439652774338, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081560347225662, 1, 0.000801126910215584],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010930340160782],
[348.021760321214, 845.0301572645774, 0, 1, 0.291707137963833, 0, 0.001183389718583619, 0.003113969687256515, 0.708292862036167, 1, 0.0008025446743856672],
[347.8839117350582, 845.1680058507332, 1, 0, 0.291591595141158, 0.002874522121510411, 0, -0.007564012608158563, 1, 0.291591595141158, 0.0008011919437246992],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008011322715902148],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008015621935431798],
[348.1092934604054, 845.1341152906762, 0, 1, 0.2917336822541153, 0, 0.001183244152504788, 0.003113586644924936, 0.7082663177458848, 1, 0.0008007528932891678],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2955074653154, 844.8521557031211, 0, 1, 0.2919131623158923, 0, 0.001183639046488268, 0.003114625768279589, 0.7080868376841076, 1, 0.0008012922492268404],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008014437701208999],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008010845007943307],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.7277027055769, 844.9517868703947, 0, 1, 0.2915516748168471, 0, 0.001183499479542953, 0.003114258512057712, 0.7084483251831528, 1, 0.0008011973512167674],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861763, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.0008011375054911155],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2617496046805, 844.7901679811109, 0, 1, 0.2919082937391426, 0, 0.001183725897745485, 0.003114854308529709, 0.7080917062608574, 1, 0.0008011015157415449],
[348.2277027055769, 844.5566692249008, 1, 0, 0.2919452257259065, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2919452257259065, 0.0008018218116837165],
[348.150347697993, 844.9015698877984, 0, 1, 0.2918149181659211, 0, 0.00118356982119562, 0.003114443608962575, 0.7081850818340789, 1, 0.0008005404869444026],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012708161407425],
[348.1850024100834, 844.8669151757078, 0, 1, 0.2918439652774338, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081560347225662, 1, 0.0008017865157714213],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011414932735921],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.021760321214, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2917575005963748, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7082424994036252, 1, 0.0008023776662465779],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2917719758861763, 0.0008011059654145723],
[348.021760321214, 844.8754472494093, 0, 1, 0.2917449702392819, 0, 0.001183606415899073, 0.003114539904202832, 0.7082550297607181, 1, 0.0008009247386890333],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.1503476979929, 844.7468598726302, 0, 1, 0.2918527644196714, 0, 0.00118378658448139, 0.003115013999503069, 0.7081472355803287, 1, 0.0008011259748522014],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008012719326394658],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008013613440523126],
[348.150347697993, 844.8669151757081, 0, 1, 0.2918233947926117, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081766052073883, 1, 0.000801169358558868],
[348.2277027055769, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2919301485229674, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7080698514770325, 1, 0.0008011791507150181],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008018218116826501],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008011414932735921],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008008606408615198],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008033324186762382],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.0045748511226, 844.7901679811109, 0, 1, 0.2917556242952601, 0, 0.001183725897745485, 0.003114854308529709, 0.7082443757047399, 1, 0.0008007054418043578],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918034265184565, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2918034265184565, 0.0008011320290364292],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.1672091270052, 844.8847084587862, 1, 0, 0.2918290511879327, 0.002872183174594188, 0, -0.007557857907232193, 1, 0.2918290511879327, 0.0008007274027649935],
[348.1879528930569, 844.5964190374209, 0, 1, 0.2919119004967574, 0, 0.001183997442399402, 0.003115568850668917, 0.7080880995032426, 1, 0.0008010405831419144],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2957965037841, 844.7561210820072, 1, 0, 0.2919368313900207, 0.002871122792861887, 0, -0.007555067620550257, 1, 0.2919368313900208, 0.0008013851843114901],
[348.1666013140182, 844.885316271773, 1, 0, 0.2918285417272982, 0.002872188188717391, 0, -0.007557871101387439, 1, 0.2918285417272982, 0.000800421258407685],
[348.2617496046805, 844.7901679811109, 0, 1, 0.2919082937391426, 0, 0.001183725897745485, 0.003114854308529709, 0.7080917062608574, 1, 0.0008013134838011121],
[348.0045748511226, 845.0473427346687, 0, 1, 0.2916927333349665, 0, 0.001183365652347816, 0.003113906359404668, 0.7083072666650335, 1, 0.0008008513643895692],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2917719758861763, 0.0008012700607824072],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 2, 0.2918797560882644, 0, 0.002367356385829418, 0.006229457556238726, 0.5014342798376159, 1, 0.001602714375039925],
[348.2277027055769, 844.8588695923047, 1, 0, 0.291871278070703, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.291871278070703, 0.0008011846640245845],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 0, 0.2918797560882644, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003032884905557533],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.000498058929338544],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008013565467795254],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.9869986306055, 845.1606645378308, 0, 1, 0.2916545951290861, 0, 0.001183206982954941, 0.00311348883703486, 0.7083454048709139, 1, 0.0008011414685222054],
[348.1598979458385, 844.8920196399529, 0, 1, 0.2918229230546479, 0, 0.001183583199692365, 0.003114478813116094, 0.7081770769453521, 1, 0.0008016616439289619],
[348.2079743261239, 844.8445510726542, 0, 1, 0.2918630713343784, 0, 0.001183649700682041, 0.003114653803706912, 0.7081369286656216, 1, 0.0008007496402161014],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011322492897078],
[348.2079743261239, 844.8445510726542, 0, 1, 0.2918630713343784, 0, 0.001183649700682041, 0.003114653803706912, 0.7081369286656216, 1, 0.0008012437240621203],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008011414849859598],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.000801857069691003],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008009406387558892],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.8839117350582, 845.1680058507332, 0, 1, 0.291591595141158, 0, 0.001183196705362049, 0.00311346179259445, 0.708408404858842, 1, 0.0008006888229182724],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008010601477948302],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.9693123260452, 845.0826052597461, 0, 1, 0.2916631767628193, 0, 0.00118331627438082, 0.003113776426306526, 0.7083368232371807, 1, 0.0008011216762176782],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.098507515811, 844.9534100699802, 1, 0, 0.2917714664255419, 0.002872750036006917, 0, -0.007559349545386888, 1, 0.2917714664255419, 0.0008011458156545905],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012240299690005],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008012694832138447],
[346.8325589901428, 840.3000125154388, 1, 0, 0.2921599215749529, 0.002883235653860342, 0, -0.007586941382323585, 1, 0.2921599215749529, 0.000804661049638999],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008016150575245579],
[348.2617496046805, 844.7901679811109, 0, 1, 0.2919082937391426, 0, 0.001183725897745485, 0.003114854308529709, 0.7080917062608574, 1, 0.000801141339290416],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.4259077600509, 844.6260098257405, 0, 1, 0.2920458888873089, 0, 0.001183955962007748, 0.003115459699237061, 0.707954111112691, 1, 0.0008007195846235914],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010873245442359],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011625751341711],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.081690114464, 842.8281866409402, 1, 1, 0.29168737640944, 0.00288116610147372, 0.00118648143933755, -0.004459390329727368, 0.9149184744433776, 0.4982932272622578, 0.001604873577055257],
[348.2277027055769, 844.6695048650465, 0, 0, 0.2919176107510175, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002848200267851741],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0005160949483720118],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.650347697993, 844.4015698877984, 1, 0, 0.292234011411261, 0.002868203076814992, 0, -0.007547384684723916, 1, 0.292234011411261, 0.0008023143410469352],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012421618078996],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.815817936851, 845.2360996489404, 0, 1, 0.2915345198394016, 0, 0.001183101384826487, 0.003113210966299739, 0.7084654801605984, 1, 0.0008015104529479317],
[348.021760321214, 845.0301572645774, 0, 1, 0.291707137963833, 0, 0.001183389718583619, 0.003113969687256515, 0.708292862036167, 1, 0.0008016722932753683],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2919301485229674, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7080698514770325, 1, 0.0008011758123836727],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.9394047793637, 844.6493956685067, 1, 0, 0.2917513602749723, 0.002874063662418814, 0, -0.007562806219686817, 1, 0.2917513602749723, 0.0007996190587725576],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2315424985261, 844.5632003337073, 0, 1, 0.2919459065284503, 0, 0.001184044011868947, 0.003115691393491655, 0.7080540934715498, 1, 0.0008001313986758946],
[348.2315424985261, 844.3572579493443, 0, 1, 0.2919963212531843, 0, 0.001184332805320651, 0.003116451324087945, 0.7080036787468157, 1, 0.0008004077290020228],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2315424985261, 844.8307459890209, 0, 1, 0.2918804373072437, 0, 0.001183669042287667, 0.003114704699174972, 0.7081195626927563, 1, 0.0008003037054394934],
[348.2315424985261, 844.5632003337073, 0, 1, 0.2919459065284503, 0, 0.001184044011868947, 0.003115691393491655, 0.7080540934715498, 1, 0.0008002714577580431],
[348.2315424985261, 844.8900997434782, 0, 1, 0.291865917245589, 0, 0.001183585889222297, 0.003114485890340571, 0.7081340827544109, 1, 0.0008012770162293533],
[348.1010352252725, 844.8222949837398, 0, 1, 0.2918050359232069, 0, 0.001183680882876377, 0.003114735856479908, 0.7081949640767931, 1, 0.0008006384337671376],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861763, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.000801240973441648],
[348.3582099788305, 844.5651202301819, 0, 1, 0.2920206195630314, 0, 0.001184041320256578, 0.003115684310787457, 0.7079793804369686, 1, 0.000801239917201825],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.970527952019, 845.3489352890861, 0, 1, 0.2915988037326708, 0, 0.001182943466602969, 0.003112795420555696, 0.7084011962673292, 1, 0.0008006996729595877],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2917719758861763, 0.0008009481645295962],
[348.3050577131609, 845.0144055279438, 0, 2, 0.2918791391930792, 0, 0.002366823555807253, 0.006228055468227121, 0.5014351535099345, 1, 0.001603695574899495],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918034265184565, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2918034265184566, 0.0008012725822011259],
[348.6503476979929, 844.4015698877984, 0, 1, 0.292234011411261, 0, 0.001184270654699135, 0.00311628778104848, 0.7077659885887391, 1, 0.0008012698827462297],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.041488700667, 845.0444757842279, 0, 1, 0.2917153491541836, 0, 0.00118336966710772, 0.003113916923837032, 0.7082846508458165, 1, 0.0008012919456393386],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2957965037841, 844.7561210820072, 0, 0, 0.2919368313900207, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002497376123367197],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2617496046805, 844.7901679811109, 0, 1, 0.2919082937391426, 0, 0.001183725897745485, 0.003114854308529709, 0.7080917062608574, 1, 0.0004413268028073066],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 0, 0.2918797560882644, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000109816439429199],
[348.1319571229319, 845.091760535528, 0, 1, 0.2917574902098776, 0, 0.001183303454960096, 0.003113742693304694, 0.7082425097901224, 1, 0.0008019639209491735],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 0, 0.2918797560882644, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002808385492511395],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0005205095765841009],
[347.720072354206, 845.4355515060467, 0, 1, 0.2914289346675639, 0, 0.001182822272163282, 0.003112476509713798, 0.7085710653324362, 1, 0.0008012102515405585],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.815817936851, 845.1680058507332, 0, 0, 0.291551160209848, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002394966857774792],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.021760321214, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917154628378672, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082845371621328, 1, 0.0005614172047390333],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.4959208147978, 844.0543069314986, 0, 1, 0.2922274573486032, 0, 0.001184757890325128, 0.003117569892043758, 0.7077725426513968, 1, 0.0008022221323881633],
[348.3332865389152, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921225804246314, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970652, 1, 0.2921225804246315, 0.0008019286730784467],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921989076923192, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921989076923192, 0.0008021379031931388],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008018091614628718],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921989076923192, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921989076923192, 0.0008019955838137958],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008021133539923465],
[348.4421455362412, 844.1086900230418, 0, 1, 0.2921822157567217, 0, 0.001184681560348233, 0.003117369037472734, 0.7078177842432782, 1, 0.0008020184141359919],
[348.2899784304348, 844.2602493158615, 0, 1, 0.2920547666060487, 0, 0.001184468889551937, 0.003116809415902063, 0.7079452333939513, 1, 0.0008020417353624895],
[348.4618739156942, 843.8824114462391, 0, 1, 0.2922493764541501, 0, 0.001184999220787417, 0.003118204928610647, 0.7077506235458499, 1, 0.000802165657979679],
[348.2559315313313, 844.294296214965, 0, 1, 0.2920262169497647, 0, 0.001184421124817585, 0.00311668372786155, 0.7079737830502353, 1, 0.0008031383223299997],
[347.9618739156942, 844.2159258207823, 0, 1, 0.2918707880591376, 0, 0.001184531077197765, 0.003116973056367237, 0.7081292119408624, 1, 0.0008019765910793957],
[348.1254242580777, 844.4248034882185, 0, 1, 0.291916781497725, 0, 0.001184238070541177, 0.003116202039150801, 0.708083218502275, 1, 0.000802074859667223],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921989076923192, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921989076923192, 0.0008021078576435714],
[348.3332865389152, 844.2169412073808, 1, 0, 0.2920910821485499, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970652, 1, 0.2920910821485498, 0.0008020057516341881],
[348.3332865389153, 844.2169412073811, 1, 0, 0.2920910821485498, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970651, 1, 0.2920910821485498, 0.0008021837933764006],
[348.9421455362412, 843.9464633207713, 0, 1, 0.2925186332951795, 0, 0.001184909284488482, 0.003117968270387011, 0.7074813667048205, 1, 0.0008022335808332415],
[348.5697175264214, 844.4031552122909, 0, 1, 0.2921857868622013, 0, 0.00118426843129049, 0.003116281930374765, 0.7078142131377987, 1, 0.0008021120356955352],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921989076923192, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921989076923192, 0.0008021857276365626],
[348.4959208147978, 844.0543069314986, 0, 1, 0.2922274573486032, 0, 0.001184757890325128, 0.003117569892043758, 0.7077725426513968, 1, 0.0008018357025568647],
[348.2756599107843, 844.2393053104347, 0, 1, 0.2920513956369319, 0, 0.001184498274019936, 0.003116886738141042, 0.7079486043630681, 1, 0.0008024714217719995],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.4618739156942, 844.0536991185118, 0, 1, 0.2922073990439192, 0, 0.001184758743483206, 0.00311757213704247, 0.7077926009560809, 1, 0.0008025409756664691],
[348.3332865389152, 844.2169412073811, 1, 0, 0.2920910821485498, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970652, 1, 0.2920910821485498, 0.0008021572979310124],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2899784304348, 844.2602493158615, 0, 1, 0.2920547666060487, 0, 0.001184468889551937, 0.003116809415902063, 0.7079452333939513, 1, 0.0008021646170564984],
[348.5697175264214, 844.403155212291, 0, 1, 0.2921857868622013, 0, 0.00118426843129049, 0.003116281930374764, 0.7078142131377987, 1, 0.0008022080590375202],
[348.5697175264214, 844.4031552122908, 0, 1, 0.2921857868622013, 0, 0.00118426843129049, 0.003116281930374766, 0.7078142131377987, 1, 0.0008022080590552866],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008022080285369732],
[348.5697175264214, 844.0762558025199, 0, 1, 0.2922658737978089, 0, 0.00118472708256582, 0.003117488824558456, 0.707734126202191, 1, 0.0008022208092134846],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008022334961236793],
[348.5697175264214, 844.403155212291, 0, 1, 0.2921857868622013, 0, 0.00118426843129049, 0.003116281930374764, 0.7078142131377987, 1, 0.0008021187466650884],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2034835361625, 844.5185442828022, 0, 1, 0.2919401800375016, 0, 0.00118410662118644, 0.003115856143542929, 0.7080598199624984, 1, 0.0008020136774797567],
[348.3326787259284, 844.2175490203679, 1, 0, 0.2920905724735922, 0.002870818792131788, 0, -0.007554267673547536, 1, 0.2920905724735922, 0.000801990875325574],
[348.4618739156942, 843.8824114462393, 0, 1, 0.29224937645415, 0, 0.001184999220787417, 0.003118204928610646, 0.7077506235458499, 1, 0.000802158963464371],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008017892309237197],
[348.4618739156942, 844.1230085426923, 1, 0, 0.2921904168342107, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921904168342107, 0.0008019575795752222],
[348.6678163000572, 843.8824114462391, 0, 1, 0.2923715984348736, 0, 0.001184999220787417, 0.003118204928610647, 0.7076284015651264, 1, 0.0008020836108206876],
[348.2559315313313, 844.294296214965, 0, 1, 0.2920262169497647, 0, 0.001184421124817585, 0.00311668372786155, 0.7079737830502353, 1, 0.0008020308151474429],
[348.4618739156942, 844.0536991185115, 0, 1, 0.2922073990439192, 0, 0.001184758743483206, 0.003117572137042471, 0.7077926009560808, 1, 0.000802036323433057],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008025711447633665],
[348.3332865389153, 844.2169412073811, 1, 0, 0.2920910821485498, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970651, 1, 0.2920910821485498, 0.0008020528440331676],
[348.3332865389153, 844.2169412073811, 1, 0, 0.2920910821485498, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970651, 1, 0.2920910821485498, 0.00080208036117748],
[348.3332865389152, 844.2169412073808, 1, 0, 0.2920910821485499, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970652, 1, 0.2920910821485498, 0.0008021298392389494],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008020235998907455],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008026059490098769],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008021441763828288],
[348.5923811889477, 843.8292591805696, 0, 1, 0.2923398648492517, 0, 0.001185073863130896, 0.003118401342345978, 0.7076601351507483, 1, 0.0008021518084137853],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.9618739156942, 844.588353830602, 0, 1, 0.2917796381400883, 0, 0.001184008748717092, 0.003115598602094005, 0.7082203618599117, 1, 0.0008021518622163237],
[348.2756599107843, 844.3086147346155, 0, 1, 0.2920344224850187, 0, 0.001184401038374246, 0.003116630872428805, 0.7079655775149813, 1, 0.0008022016501878648],
[348.4618739156942, 844.0109988230181, 0, 1, 0.2922178624620563, 0, 0.001184818682925353, 0.003117729861588311, 0.7077821375379437, 1, 0.0008026595457385095],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921989076923192, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921989076923192, 0.00080432883287156],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008022208091129188],
[348.4618739156942, 843.8824114462393, 0, 1, 0.29224937645415, 0, 0.001184999220787417, 0.003118204928610646, 0.7077506235458499, 1, 0.0008022335807540918],
[348.4618739156942, 844.2434531677045, 0, 1, 0.2921609101619518, 0, 0.001184492454454788, 0.003116871424547235, 0.7078390898380482, 1, 0.0008042076838117193],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008021723502133032],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921989076923192, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921989076923192, 0.0008035488832365672],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.1254242580777, 844.4248034882187, 0, 1, 0.2919167814977249, 0, 0.001184238070541176, 0.0031162020391508, 0.7080832185022751, 1, 0.0008025871575078537],
[348.6678163000572, 843.8483645471356, 0, 1, 0.29237994578183, 0, 0.001185047032160412, 0.003118330739376003, 0.7076200542181701, 1, 0.0008017608263078169],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.6678163000572, 843.8824114462391, 0, 1, 0.2923715984348736, 0, 0.001184999220787417, 0.003118204928610647, 0.7076284015651264, 1, 0.000801978936059365],
[348.3332865389152, 844.2169412073808, 1, 0, 0.2920910821485499, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970652, 1, 0.2920910821485498, 0.0008020308151471478],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008020308152380126],
[348.3845189081102, 844.165708838186, 0, 1, 0.2921340424935341, 0, 0.001184601541534169, 0.003117158476101877, 0.7078659575064659, 1, 0.0008025648265797271],
[348.5045742111877, 844.0456535351086, 0, 1, 0.2922347135598625, 0, 0.00118477003680039, 0.003117601854258048, 0.7077652864401376, 1, 0.000802544933273725],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921989076923192, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921989076923192, 0.0008025575831083288],
[348.2559315313313, 844.294296214965, 0, 1, 0.2920262169497647, 0, 0.001184421124817585, 0.00311668372786155, 0.7079737830502353, 1, 0.000802069357433208],
[348.3116382629876, 844.3343350659538, 1, 0, 0.2920494816167215, 0.002870992209697468, 0, -0.007554724004234108, 1, 0.2920494816167215, 0.0008021661755573298],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 1, 0, 0.2921989076923192, 0.002869754411760803, 0, -0.007551466864854584, 1, 0.2921989076923192, 0.0008020247449956557],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.9886004958914, 842.4114669504306, 0, 1, 0.2923291169181516, 0, 0.001187068361759186, 0.00312364966263492, 0.7076708830818484, 1, 0.0008024330209734334],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.8845189081102, 843.665708838186, 0, 1, 0.2925533120457649, 0, 0.001185303597768721, 0.003119005865680146, 0.7074466879542352, 1, 0.0008020308151471478],
[347.9272192036037, 844.2505805328728, 0, 1, 0.291841719649964, 0, 0.001184482454686405, 0.003116845111173768, 0.7081582803500359, 1, 0.0008020308151471478],
[348.4191736202007, 844.1310541260957, 0, 1, 0.2921631018247757, 0, 0.001184650173823152, 0.003117286447024165, 0.7078368981752243, 1, 0.0008020308151473594],
[348.2559315313313, 844.294296214965, 0, 1, 0.2920262169497647, 0, 0.001184421124817585, 0.00311668372786155, 0.7079737830502353, 1, 0.0008025584978550217],
[348.4618739156942, 844.3558994859154, 0, 1, 0.2921333683031654, 0, 0.001184334710764558, 0.003116456338069791, 0.7078666316968345, 1, 0.0008022016501883033],
[348.4618739156942, 844.088353830602, 0, 1, 0.2921989076923192, 0, 0.001184710102279989, 0.00311744414266328, 0.7078010923076808, 1, 0.0008022016503839986],
[348.6254242580777, 843.9248034882187, 0, 1, 0.2923360510499557, 0, 0.001184939695890761, 0.003118048294899103, 0.7076639489500443, 1, 0.0008024533085784521],
[348.7899784304348, 843.7602493158615, 0, 1, 0.2924740361582796, 0, 0.001185170788515838, 0.003118656391638612, 0.7075259638417204, 1, 0.0008022419783259956],
[348.3332865389153, 843.8050564386554, 1, 0, 0.2921919998553968, 0.00287081378278869, 0, -0.007554254491970651, 1, 0.2921919998553968, 0.0008017900032817274],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.4618739156942, 843.8824114462393, 0, 1, 0.29224937645415, 0, 0.001184999220787417, 0.003118204928610646, 0.7077506235458499, 1, 0.0008021175552451174],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2769835508972, 844.4283435325017, 1, 1, 0.2920058925221386, 0.002871277882920621, 0.001184233105933766, -0.004439286748974981, 0.9147325587323492, 0.4987443437766265, 0.001034695944462386],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.0920931861001, 844.7683332344011, 0, 0, 0.2918129275447959, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005701694059007489],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.1347934815936, 844.7256329389077, 0, 1, 0.2918487241011639, 0, 0.001183816331606836, 0.003115092276038235, 0.7081512758988361, 1, 0.000802010544122858],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.1598979458385, 844.7962740573078, 0, 1, 0.2918463444983294, 0, 0.001183717341930611, 0.00311483179477304, 0.7081536555016706, 1, 0.0008013910785092792],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.9736839409286, 845.0782336448628, 0, 1, 0.291666840991357, 0, 0.001183322395711166, 0.003113792533964759, 0.708333159008643, 1, 0.0008012628583396333],
[348.0774670528704, 844.9744505329209, 1, 0, 0.2917538305937474, 0.002872923686979449, 0, -0.007559806490259856, 1, 0.2917538305937474, 0.0008014011636488559],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008010055226348637],
[347.4720252482298, 846.2132967873647, 1, 5, 0.2910918135909428, 0.00287792952334972, 0.005908675766479232, 0.007975100495352997, 0.439625278852397, 0.8730771108351554, 0.004858045894528757],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012718937674013],
[348.0558072203175, 844.9961103654737, 0, 1, 0.2917356756147112, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487029, 0.7082643243852889, 1, 0.0008012718937674013],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.488717252084, 844.3060255801495, 1, 0, 0.2921615134089327, 0.00286953336075049, 0, -0.007550885191603041, 1, 0.2921615134089327, 0.0008005427385384396],
[348.488717252084, 844.3060255801495, 1, 0, 0.2921615134089327, 0.00286953336075049, 0, -0.007550885191603041, 1, 0.2921615134089327, 0.0008012185900516045],
[348.488717252084, 844.3060255801495, 0, 0, 0.2921615134089327, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002836481469832823],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.3582099788305, 844.5651202301819, 0, 1, 0.2920206195630314, 0, 0.001184041320256578, 0.003115684310787457, 0.7079793804369686, 1, 0.0004235820453848136],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 0, 0.2918797560882644, 0, 0, 0, 1, 1, 9.36059201597001e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.3582099788305, 844.4104102150141, 0, 1, 0.2920584965776652, 0, 0.001184258256296684, 0.003116255155913416, 0.7079415034223348, 1, 0.0008009062904696085],
[348.2277027055769, 844.6695048650465, 0, 0, 0.2919176107510175, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002769258750462081],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0005240139929492306],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008011867416614239],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.6503476979929, 844.4015698877984, 0, 1, 0.292234011411261, 0, 0.001184270654699135, 0.00311628778104848, 0.7077659885887391, 1, 0.0008011816961499019],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008014877642217119],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.2298160327924, 843.095987189959, 1, 0, 0.2917098958055719, 0.002879937015275093, 0, -0.007578261350376059, 1, 0.2917098958055719, 0.0008031194744927561],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008008632326311971],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[346.8921934259014, 840.7984440394803, 1, 2, 0.2920728533873051, 0.002882739995166847, 0.002378691366733891, -0.001326352701223457, 0.793911800869601, 0.6452146330680126, 0.00160840861628056],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008013081282813574],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918034265184565, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2918034265184565, 0.0008010281789144936],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.0665707922855, 840.3920415198418, 1, 1, 0.2922767725912606, 0.002881291614220276, 0.001189920835270535, -0.004450670183162296, 0.9145742882036365, 0.4991278333861577, 0.00160429066237285],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2917719758861763, 0.0008011316896774804],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008023447339323024],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008013546405831769],
[348.3779383582835, 844.6739792275079, 1, 0, 0.2920056815827815, 0.002870445828781404, 0, -0.007553286258423409, 1, 0.2920056815827815, 0.0008017413786694342],
[349.2069783703652, 843.9130330136331, 0, 1, 0.2926838667011303, 0, 0.00118495622283374, 0.003118091783868672, 0.7073161332988698, 1, 0.0008020431780056831],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.9705473828591, 844.1154171020357, 1, 0, 0.2924940513683139, 0.002865571342623622, 0, -0.007540459543861066, 1, 0.2924940513683139, 0.0008022581813154271],
[348.6360176217173, 844.83854495649, 0, 1, 0.2921185155958206, 0, 0.001183658115470455, 0.003114675946366794, 0.7078814844041794, 1, 0.0008019375486675163],
[348.5281740109901, 844.5237435748011, 0, 0, 0.2921316070772987, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002875143792751028],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.3779383582835, 844.6739792275077, 1, 0, 0.2920056815827816, 0.002870445828781404, 0, -0.007553286258423409, 1, 0.2920056815827816, 0.0005136687581841214],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.855274695757, 843.9302069270996, 0, 1, 0.2924710939817262, 0, 0.001184932109067619, 0.003118028330945625, 0.7075289060182739, 1, 0.0008009889543144212],
[348.412901323888, 844.4158884074491, 1, 0, 0.2920896144721337, 0.002870157781759035, 0, -0.00755252829198, 1, 0.2920896144721337, 0.0008011786970035262],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918034265184565, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2918034265184566, 0.0008012805083035709],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.8760184618089, 844.1482473395445, 0, 1, 0.2924299433486118, 0, 0.001184626045427027, 0.00311722295560375, 0.7075700566513883, 1, 0.0008037251728200981],
[349.112449449315, 844.0075619346835, 0, 1, 0.292604638358509, 0, 0.00118482350763273, 0.003117742557315074, 0.707395361641491, 1, 0.0008035232526762821],
[349.112449449315, 843.9302069270996, 0, 1, 0.2926236103826008, 0, 0.001184932109067619, 0.003118028330945625, 0.7073763896173992, 1, 0.0008017053650771919],
[349.035094441731, 844.0849169422675, 0, 1, 0.2925398041365985, 0, 0.0011847149261031, 0.003117456836063189, 0.7074601958634015, 1, 0.0008016472985423336],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.3183918336779, 843.8016195503205, 0, 1, 0.2927772466312711, 0, 0.001185112681500802, 0.003118503488938345, 0.7072227533687289, 1, 0.0008023518614123688],
[349.035094441731, 844.0502622301769, 0, 1, 0.29254830133475, 0, 0.001184763567702435, 0.003117584831484721, 0.7074516986652499, 1, 0.0008016677235761484],
[349.112449449315, 844.0075619346835, 0, 1, 0.292604638358509, 0, 0.00118482350763273, 0.003117742557315074, 0.707395361641491, 1, 0.0008017503065990061],
[349.112449449315, 843.9302069270996, 0, 1, 0.2926236103826008, 0, 0.001184932109067619, 0.003118028330945625, 0.7073763896173992, 1, 0.0008022097035393895],
[349.112449449315, 844.0075619346835, 0, 1, 0.292604638358509, 0, 0.00118482350763273, 0.003117742557315074, 0.707395361641491, 1, 0.0008014148271080014],
[349.112449449315, 843.972907222593, 0, 1, 0.2926131374398546, 0, 0.001184872158148858, 0.003117870576200243, 0.7073868625601454, 1, 0.0008014148272125361],
[349.112449449315, 844.179362007352, 0, 1, 0.2925625116149493, 0, 0.001184582382613721, 0.003117108061351284, 0.7074374883850507, 1, 0.0008019445090921071],
[349.112449449315, 844.0075619346835, 1, 0, 0.292604638358509, 0.002864406587554772, 0, -0.007537394609359337, 1, 0.292604638358509, 0.0008019191178153676],
[349.112449449315, 844.0849169422675, 0, 1, 0.2925856687943305, 0, 0.0011847149261031, 0.003117456836063189, 0.7074143312056695, 1, 0.0008019191178134377],
[348.670076077446, 844.4158884074491, 1, 0, 0.2922422075663101, 0.00286804078873084, 0, -0.007546957640136055, 1, 0.29224220756631, 0.0008020667182370476],
[348.412901323888, 844.6730631610069, 1, 0, 0.292026653313546, 0.002870157781759035, 0, -0.00755252829198, 1, 0.292026653313546, 0.0008012078451432911],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.9528022569932, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.0008011322004400321],
[347.8912530479604, 845.0833095302469, 0, 2, 0.2916166563485748, 0, 0.002366630576471487, 0.006227547662732104, 0.5018069615627732, 1, 0.001601971665222944],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 0, 0.2918797560882644, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002680045104941336],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.000533349836882154],
[347.8498648359546, 845.2020527498369, 0, 1, 0.2915630574902798, 0, 0.00118314904317439, 0.003113336374395132, 0.7084369425097202, 1, 0.0008023244229704041],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008010968095047196],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[345.5205525007511, 841.5567133027421, 0, 2, 0.2910682922285431, 0, 0.002376548090444047, 0.006253644592085571, 0.5025841662837545, 1, 0.001605497335423738],
[347.8912530479604, 845.1606645378311, 0, 1, 0.2915977485304564, 0, 0.001183206982954941, 0.00311348883703486, 0.7084022514695436, 1, 0.0008013468587779368],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.348861005981, 845.7030565798102, 0, 1, 0.2911431228482171, 0, 0.00118244813261548, 0.00311149199954579, 0.7088568771517829, 1, 0.0008007935160671327],
[347.8912530479604, 845.1606645378308, 0, 1, 0.2915977485304565, 0, 0.001183206982954941, 0.00311348883703486, 0.7084022514695435, 1, 0.0008012746889566341],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.021760321214, 845.0301572645774, 0, 1, 0.291707137963833, 0, 0.001183389718583619, 0.003113969687256515, 0.708292862036167, 1, 0.0008012401314086462],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.8912530479604, 845.1606645378308, 0, 1, 0.2915977485304565, 0, 0.001183206982954941, 0.00311348883703486, 0.7084022514695435, 1, 0.0008010020242469775],
[348.3355463163041, 844.8121168521322, 0, 1, 0.2919467196468286, 0, 0.001183695143632783, 0.003114773382209994, 0.7080532803531714, 1, 0.000800936846129232],
[348.2277027055769, 844.6695048650463, 0, 0, 0.2919176107510175, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000308729665403698],
[348.2277027055769, 844.6695048650463, 0, 1, 0.2919176107510175, 0, 0.001183894995901114, 0.00311529927312804, 0.7080823892489825, 1, 0.000812423720297543],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0004922449789028478],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012696964419496],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.150347697993, 844.8669151757081, 0, 1, 0.2918233947926117, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081766052073883, 1, 0.0008009607098658734],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.150347697993, 844.8669151757081, 0, 1, 0.2918233947926117, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081766052073883, 1, 0.0008012344006236551],
[348.2277027055769, 844.4123301114887, 0, 0, 0.2919805583609738, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00029572071009053],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.6182724958517, 0, 1, 0.2919301485229673, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158861, 0.7080698514770327, 1, 0.0005052167419452567],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 845.091760535528, 1, 1, 0.2918143158075844, 0.002871684223370046, 0.001183303454960096, -0.004442802274527235, 0.9148444050897514, 0.4984730367049202, 0.001603987170906635],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.7079743261239, 844.6823243703836, 0, 1, 0.2921994377757249, 0, 0.001183877028260759, 0.003115251993109852, 0.7078005622242751, 1, 0.0008011857383906209],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.7553243582792, 845.1680058507332, 1, 0, 0.2915152345099571, 0.002875585016118223, 0, -0.007566809507216833, 1, 0.2915152345099571, 0.0008006438490998203],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008011461420121513],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.2538253439659, 845.6695048650463, 1, 0, 0.2910948395008114, 0.002879737894923024, 0, -0.007577737385421218, 1, 0.2910948395008115, 0.0008004515663777076],
[347.8050577131609, 845.2468598726302, 1, 0, 0.2915255007652678, 0.002875173830349277, 0, -0.00756572751368569, 1, 0.2915255007652678, 0.0008013588617292975],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.970527952019, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2917270804914681, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7082729195085319, 1, 0.0008006403620710377],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918034265184565, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2918034265184565, 0.0008012401274361336],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.2543205283056, 845.6690096807067, 1, 1, 0.2910952546023751, 0.002879733788419451, 0.001182495738347516, -0.004466109310386838, 0.9152635527479784, 0.4974540619527286, 0.001606951975191846],
[347.8912530479604, 845.1606645378308, 0, 1, 0.2915977485304565, 0, 0.001183206982954941, 0.00311348883703486, 0.7084022514695435, 1, 0.0008012690435496776],
[348.072992690409, 844.9096154712015, 0, 0, 0.2917670302225029, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002402023089682232],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.150347697993, 844.8669151757078, 0, 1, 0.2918233947926117, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081766052073883, 1, 0.0005607134716240975],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008010728594848014],
[348.0774670528704, 845.1463460181803, 1, 0, 0.291711800619373, 0.002872923686979449, 0, -0.007559806490259856, 1, 0.2917118006193731, 0.0008012949980063388],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.6736343734064, 844.378283212385, 0, 1, 0.2922535299880054, 0, 0.001184303315091859, 0.003116373723550194, 0.7077464700119946, 1, 0.0008007521274371186],
[348.6395874743029, 844.4123301114887, 1, 0, 0.2922249923371272, 0.002868291599483684, 0, -0.007547617623123342, 1, 0.2922249923371272, 0.0008009064814099832],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.8455298586658, 844.2063877271257, 0, 1, 0.2923976104615586, 0, 0.001184544460380501, 0.003117008272851463, 0.7076023895384413, 1, 0.000800623594860461],
[348.4336450899399, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2920523742126959, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7079476257873041, 1, 0.0008005711566190839],
[348.4336450899399, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2920523742126959, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7079476257873041, 1, 0.0008011868856816384],
[348.4336450899399, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2920523742126959, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7079476257873041, 1, 0.0008008038764281888],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008012662946527473],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008012392536320255],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861763, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.0008012401429747495],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008019279169748802],
[348.4540625399936, 844.34068029224, 1, 0, 0.292132460034663, 0.002869818743712382, 0, -0.007551636147842253, 1, 0.292132460034663, 0.0008006581952340867],
[348.5233719641745, 844.1162715309565, 0, 1, 0.2922285653215395, 0, 0.00118467092002186, 0.003117341038536062, 0.7077714346784605, 1, 0.0008030081412438366],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.3582099788305, 844.5651202301819, 0, 1, 0.2920206195630314, 0, 0.001184041320256578, 0.003115684310787457, 0.7079793804369686, 1, 0.0008009507817403255],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2917719758861763, 0.0008011006627638385],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.4123301114887, 0, 0, 0.2919805583609738, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002876912114801823],
[348.2277027055769, 844.6182724958517, 0, 1, 0.2919301485229673, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158861, 0.7080698514770327, 1, 0.0005132325528939651],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.5548033903439, 844.2911718110845, 0, 1, 0.2922043672331506, 0, 0.001184425507914415, 0.003116695261535072, 0.7077956327668493, 1, 0.0008014295632015582],
[348.3912530479604, 844.6606645378308, 0, 1, 0.2920168417757964, 0, 0.001183907386698498, 0.003115331878251144, 0.7079831582242035, 1, 0.0008015198166094255],
[348.5558072203175, 844.4961103654737, 0, 1, 0.2921547688600511, 0, 0.00118413807680799, 0.003115938915811829, 0.7078452311399489, 1, 0.0008012201537253325],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008032933331435111],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.4123301114885, 0, 1, 0.2919805583609739, 0, 0.001184255563710171, 0.003116248070645859, 0.7080194416390262, 1, 0.0008030642911901675],
[348.2277027055769, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2919301485229674, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7080698514770325, 1, 0.0008011456224256176],
[348.5281740109901, 844.3178011904383, 0, 1, 0.2921820429935527, 0, 0.001184388151700768, 0.003116596962458193, 0.7078179570064473, 1, 0.0008017915580757255],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.3779383582835, 844.673979227508, 1, 0, 0.2920056815827815, 0.002870445828781404, 0, -0.00755328625842341, 1, 0.2920056815827815, 0.000801789639314291],
[348.150347697993, 844.8669151757078, 0, 1, 0.2918233947926117, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081766052073883, 1, 0.0008010847592956004],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.000801329571112626],
[348.150347697993, 844.8669151757078, 0, 1, 0.2918233947926117, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081766052073883, 1, 0.000801093034021942],
[348.2277027055769, 844.9015698877986, 0, 2, 0.2918608324382757, 0, 0.002367139642391239, 0.006228887217925149, 0.5014610806350119, 1, 0.001607539681073086],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008011015157415449],
[348.099115328798, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918034265184565, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2918034265184566, 0.0008011059653295359],
[348.2623574176674, 844.6344608310214, 0, 1, 0.2919467569114294, 0, 0.001183944115915087, 0.003115428527449037, 0.7080532430885706, 1, 0.0008034372287246402],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008013002459843527],
[348.099115328798, 844.9528022569932, 1, 2, 0.2917719758861764, 0.002872745019921833, 0.002366996114644162, -0.001330826806812881, 0.794284955845705, 0.6447620767125961, 0.002405999323419487],
[348.2277027055769, 844.9015698877986, 0, 1, 0.2918608324382757, 0, 0.00118356982119562, 0.003114443608962575, 0.7081391675617243, 1, 0.0008010617635202669],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 0, 0.2918797560882644, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003092860789062445],
[346.0457219744479, 841.0529423317896, 1, 1, 0.2915054429588491, 0.002889791540534752, 0.001188985793483506, -0.004475497342133629, 0.9150245767253653, 0.4980354626430633, 0.0008043772373092724],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0004920118775685178],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008018523526722069],
[348.6503476979929, 844.4015698877984, 0, 1, 0.292234011411261, 0, 0.001184270654699135, 0.00311628778104848, 0.7077659885887391, 1, 0.0008011375054493367],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008022772801218649],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861763, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.0008010847597452065],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008011375070848233],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010872152094769],
[347.8839117350582, 845.1680058507332, 0, 1, 0.291591595141158, 0, 0.001183196705362049, 0.00311346179259445, 0.708408404858842, 1, 0.0008027368038979248],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.8839117350582, 844.7453608583173, 1, 0, 0.2916949296226679, 0.002874522121510411, 0, -0.007564012608158563, 1, 0.2916949296226679, 0.000801135596685498],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008012742531701126],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.9869986306055, 845.1606645378311, 0, 1, 0.291654595129086, 0, 0.001183206982954941, 0.00311348883703486, 0.7083454048709139, 1, 0.0008011015157415449],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008018506420202277],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.072992690409, 844.9096154712015, 0, 2, 0.2917670302225029, 0, 0.002367117101495656, 0.006228827903850955, 0.5015939394798531, 1, 0.001606258004188619],
[348.150347697993, 844.8669151757078, 0, 1, 0.2918233947926117, 0, 0.00118361836880786, 0.003114571357066628, 0.7081766052073883, 1, 0.0008012214440001323],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008034910515088891],
[348.6197795264264, 844.7687158834806, 0, 2, 0.292125976467271, 0, 0.002367511914676373, 0.006229866814581355, 0.5010856331924146, 1, 0.001602926890604955],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008008954717577675],
[348.2277027055769, 844.7895601681239, 0, 1, 0.291888234598364, 0, 0.001183726749417911, 0.003114856549619077, 0.708111765401636, 1, 0.0008016069937933036],
[348.5761434127575, 844.8984191654499, 0, 1, 0.2920683476150047, 0, 0.001183574234862165, 0.003114455223077195, 0.7079316523849953, 1, 0.0008014437701088928],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010872153238775],
[348.0774670528704, 844.9744505329211, 1, 0, 0.2917538305937473, 0.002872923686979449, 0, -0.007559806490259856, 1, 0.2917538305937473, 0.0008011903510920434],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010847592423979],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011850512790273],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008018864826340238],
[348.021760321214, 845.0301572645774, 0, 1, 0.291707137963833, 0, 0.001183389718583619, 0.003113969687256515, 0.708292862036167, 1, 0.0008018523526722069],
[348.4336450899399, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2920523742126959, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7079476257873041, 1, 0.0008011850512790273],
[348.1503476979929, 844.9015698877984, 0, 1, 0.2918149181659211, 0, 0.00118356982119562, 0.003114443608962575, 0.7081850818340789, 1, 0.0008010930340956111],
[348.0558072203175, 844.9961103654739, 0, 1, 0.2917356756147111, 0, 0.001183437400164463, 0.003114095156487028, 0.7082643243852889, 1, 0.0008011006642311293],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 2, 0.2918797560882644, 0, 0.002367356385829418, 0.006229457556238726, 0.5014342798376159, 1, 0.001604405323113282],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2917719758861763, 0.0008011746511963346],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010845044195168],
[348.1936558064734, 844.8582617793181, 0, 1, 0.2918512184373863, 0, 0.001183630491928841, 0.003114603257826502, 0.7081487815626137, 1, 0.0008018931594237634],
[348.3582099788305, 844.5651202301819, 0, 1, 0.2920206195630314, 0, 0.001184041320256578, 0.003115684310787457, 0.7079793804369686, 1, 0.000801132208721936],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861763, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.0008010899095199205],
[348.6503476979929, 844.7393431855278, 0, 1, 0.2921512984077072, 0, 0.001183797118089684, 0.003115041717621969, 0.7078487015922927, 1, 0.0008034130402483123],
[348.3779383582835, 844.5020837422485, 1, 0, 0.2920477599623371, 0.002870445828781404, 0, -0.007553286258423409, 1, 0.2920477599623371, 0.0008013550309295376],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010988505233084],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011271617792111],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008010847592956004],
[348.3912530479604, 845.0833095302469, 0, 1, 0.2919134298894038, 0, 0.001183315288235743, 0.003113773831366052, 0.7080865701105962, 1, 0.000801787858360616],
[348.3562900823559, 844.6956275034354, 1, 0, 0.2919875362903525, 0.002870624209953514, 0, -0.007553755650335477, 1, 0.2919875362903526, 0.000801335461240974],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008018506420202277],
[348.2093121305159, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918877661245693, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081122338754307, 1, 0.0008021830523065443],
[348.2621952542346, 844.7897223315567, 1, 1, 0.2919086672765784, 0.002871399806315443, 0.00118372652219309, -0.004440940601579436, 0.9147893299688117, 0.4986066645219688, 0.001607128148082118],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010898024153095],
[348.2277027055769, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2919301485229674, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7080698514770325, 1, 0.0008010988504091949],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008013236787703824],
[348.4336450899399, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2920523742126959, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7079476257873041, 1, 0.0008014436170578676],
[348.041488700667, 845.0444757842279, 0, 1, 0.2917153491541836, 0, 0.00118336966710772, 0.003113916923837032, 0.7082846508458165, 1, 0.0008010872153238775],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861763, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.0008013558787496733],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.3841947582873, 842.674047417554, 0, 1, 0.2919052046756535, 0, 0.001186698466702024, 0.003122676321412346, 0.7080947953243466, 1, 0.0008011697383998218],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012719385754621],
[349.0036832662281, 844.8935243043954, 0, 1, 0.2923230585122071, 0, 0.001183581091858059, 0.003114473266564497, 0.7076769414877929, 1, 0.0008006036921327804],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.6156929859025, 844.8588695923049, 0, 1, 0.2921014857935508, 0, 0.001183629640394922, 0.003114601017101599, 0.7078985142064492, 1, 0.000801220199286358],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012401296210937],
[348.2617496046805, 844.7901679811109, 0, 1, 0.2919082937391425, 0, 0.001183725897745485, 0.003114854308529709, 0.7080917062608575, 1, 0.0008010872152895069],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011377547274043],
[348.3562900823559, 844.6956275034356, 1, 0, 0.2919875362903525, 0.002870624209953514, 0, -0.007553755650335477, 1, 0.2919875362903525, 0.000801826677744258],
[348.2277027055769, 844.669115543112, 0, 1, 0.2919177060232382, 0, 0.001183895541577855, 0.003115300709020885, 0.7080822939767618, 1, 0.0008032959049324262],
[348.2277027055769, 844.9960149528829, 0, 1, 0.2918377313090346, 0, 0.001183437533792109, 0.003114095508114589, 0.7081622686909654, 1, 0.0008013835092695458],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008018523526350012],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008011322088229282],
[348.323448288222, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2919365800568553, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7080634199431447, 1, 0.0008034130405503553],
[348.021760321214, 845.0301572645774, 0, 1, 0.291707137963833, 0, 0.001183389718583619, 0.003113969687256515, 0.708292862036167, 1, 0.0008011059653652094],
[348.2277027055769, 844.6182724958514, 1, 1, 0.2919301485229674, 0.002871684223370046, 0.001183966807922583, -0.004441056728673067, 0.9147767883833582, 0.4986370854292931, 0.001606138803303482],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008014358293494283],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010845007941453],
[348.3562900823559, 844.6956275034354, 1, 0, 0.2919875362903525, 0.002870624209953514, 0, -0.007553755650335477, 1, 0.2919875362903526, 0.000801329571112626],
[348.2617496046805, 844.7901679811109, 0, 1, 0.2919082937391426, 0, 0.001183725897745485, 0.003114854308529709, 0.7080917062608574, 1, 0.0008010872152951365],
[348.5719773038102, 845.3252302668132, 1, 0, 0.2919614645996991, 0.002868847942783464, 0, -0.00754908158393356, 1, 0.2919614645996991, 0.0008010979116625329],
[348.5207449346152, 845.376462636008, 0, 1, 0.2919185527234756, 0, 0.001182904947319982, 0.003112694060980139, 0.7080814472765244, 1, 0.0008011935084235584],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.335546316304, 845.1390162619032, 0, 1, 0.2918667537947445, 0, 0.001183237290857847, 0.003113568589198876, 0.7081332462052554, 1, 0.0008012206036258942],
[348.3779383582835, 844.673979227508, 1, 0, 0.2920056815827815, 0.002870445828781404, 0, -0.007553286258423409, 1, 0.2920056815827815, 0.0008013373619196501],
[348.150347697993, 844.9015698877986, 0, 1, 0.291814918165921, 0, 0.00118356982119562, 0.003114443608962575, 0.7081850818340789, 1, 0.0008018523526722069],
[348.3355463163041, 845.1390162619034, 0, 1, 0.2918667537947445, 0, 0.001183237290857846, 0.003113568589198876, 0.7081332462052554, 1, 0.0008010872152895069],
[348.098507515811, 844.9534100699802, 1, 0, 0.2917714664255419, 0.002872750036006917, 0, -0.007559349545386888, 1, 0.2917714664255419, 0.0008011322087822316],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008010898047424864],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011324593260641],
[348.1930479934865, 844.8588695923049, 0, 1, 0.2918507089767517, 0, 0.001183629640394922, 0.003114601017101599, 0.7081492910232483, 1, 0.0008018931594229923],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008011059653652094],
[348.7611806939744, 844.8542635483716, 0.5, 1.5, 0.2921888975015337, 0.001433645794537931, 0.001775454140102257, 0.0008994338975773355, 0.7078111024984663, 0.4990034431799055, 0.001608306943989493],
[348.3779383582835, 844.6739792275077, 1, 0, 0.2920056815827816, 0.002870445828781404, 0, -0.007553286258423409, 1, 0.2920056815827816, 0.0008017001793496323],
[348.2277027055769, 845.091760535528, 1, 0, 0.2918143158075844, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918143158075843, 0.000801443512529696],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010872152094769],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008013550309283202],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008018326722877227],
[348.2277027055769, 844.7468598726305, 0, 1, 0.2918986821923525, 0, 0.001183786584481389, 0.003115013999503068, 0.7081013178076475, 1, 0.0008010930340160782],
[348.099115328798, 844.9528022569932, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.0008011271614011703],
[348.4336450899399, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2920523742126959, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7079476257873041, 1, 0.0008018931594229923],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008013550309283202],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008010847592433276],
[348.150347697993, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918338400657804, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081661599342195, 1, 0.0008022835938996178],
[348.3562900823559, 844.6956275034354, 1, 0, 0.2919875362903525, 0.002870624209953514, 0, -0.007553755650335477, 1, 0.2919875362903526, 0.000801329571112626],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011585488635177],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 1, 0.2917719758861763, 0.002872745019921833, 0.001183498057322081, -0.004445081576441019, 0.9148691140874767, 0.4984130658598291, 0.001602567967207957],
[348.1415073707774, 844.6428645597005, 0, 1, 0.2918729617552945, 0, 0.001183932336326886, 0.003115397530660735, 0.7081270382447055, 1, 0.0008021830300647001],
[348.3562900823559, 844.6956275034354, 1, 0, 0.2919875362903525, 0.002870624209953514, 0, -0.007553755650335477, 1, 0.2919875362903526, 0.0008018266777404165],
[348.1175059038591, 845.0301572645774, 0, 1, 0.2917639757843749, 0, 0.001183389718583619, 0.003113969687256515, 0.7082360242156251, 1, 0.0008018864826340238],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008011375950292857],
[348.5558072203176, 844.4961103654739, 0, 1, 0.2921547688600511, 0, 0.00118413807680799, 0.003115938915811828, 0.7078452311399489, 1, 0.0008010988505233084],
[348.2277027055769, 844.5566692249008, 1, 0, 0.2919452257259065, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2919452257259065, 0.0008013491435366099],
[348.099115328798, 844.9528022569934, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921832, 0, -0.007559336346069152, 1, 0.2917719758861763, 0.0008010845007941453],
[348.3995981908363, 844.6523193949549, 0, 1, 0.2920238365618177, 0, 0.001183919083672587, 0.003115362657648812, 0.7079761634381823, 1, 0.0008011850511938529],
[348.2277027055769, 844.6182724958517, 0, 1, 0.2919301485229673, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158861, 0.7080698514770327, 1, 0.0008010930340213219],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[347.6001307153968, 844.7107531754045, 0, 1, 0.2915348131194549, 0, 0.001183837184788803, 0.003115147149065699, 0.7084651868805452, 1, 0.0008017916704027786],
[347.9139167104869, 844.8704552199911, 0, 1, 0.2916821555495407, 0, 0.001183613409394954, 0.003114558306875964, 0.7083178444504592, 1, 0.0008017330020377147],
[348.3355463163041, 844.8121168521322, 0, 1, 0.2919467196468286, 0, 0.001183695143632783, 0.003114773382209994, 0.7080532803531714, 1, 0.000801135014864649],
[348.099115328798, 844.9528022569932, 1, 0, 0.2917719758861764, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2917719758861763, 0.000801084501662295],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008012225431447851],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.000801858063368594],
[348.3912530479604, 844.6606645378311, 0, 1, 0.2920168417757963, 0, 0.001183907386698498, 0.003115331878251144, 0.7079831582242037, 1, 0.0008018523526350012],
[348.2277027055769, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2919301485229674, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7080698514770325, 1, 0.0008018931593844875],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008011323046502417],
[348.4336450899399, 844.6182724958514, 0, 1, 0.2920523742126959, 0, 0.001183966807922583, 0.003115488239158862, 0.7079476257873041, 1, 0.000801813175272665],
[347.970527952019, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2917270804914681, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7082729195085319, 1, 0.0008005281363579726],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.099115328798, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918034265184565, 0.002872745019921833, 0, -0.007559336346069154, 1, 0.2918034265184565, 0.0008011320040378994],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 0, 1, 0.2918797560882644, 0, 0.001183678192914709, 0.003114728778119363, 0.7081202439117356, 1, 0.0008012403007895003],
[348.2277027055769, 844.8242148802144, 1, 0, 0.2918797560882644, 0.002871684223370046, 0, -0.007556544967831929, 1, 0.2918797560882644, 0.0008018523526722069],
[348.3779383582835, 844.6739792275077, 1, 0, 0.2920056815827816, 0.002870445828781404, 0, -0.007553286258423409, 1, 0.2920056815827816, 0.0008018588240293079],
[348.3355463163041, 845.1390162619032, 0, 1, 0.2918667537947446, 0, 0.001183237290857847, 0.003113568589198876, 0.7081332462052554, 1, 0.0008012225431447851]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0, 2.999999999999997, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411014375705072, 0, 2, 0.1960953037526405, 0, 0.8295263687157088, 2.182814271914061, 0.6462627606485594, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 1, 0.1960384104247077, 0, 0.4146135059877962, 1.09101327254933, 0.8039615895752923, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.465472118532226, 0, 1, 0.4056018287464276, 0, 0.6823739512707828, 1.795597651612118, 0.5943981712535724, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 2, 0.3333333333333333, 1, 1, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.588386374830145, 2.411613625169853, 1, 0, 0.1961287916100485, 1.699563488853187, 0, -4.472228466029878, 1, 0.1961287916100485, 0.3800260880593912],
[0.3728829684466904, 1.783610054394111, 0, 2, 0.1729117435100636, 0, 1.121321330900098, 2.950643037761279, 0.6840749840235627, 1, 0.3800260880593912],
[1.069309424180954, 1.085400590987012, 0, 0, 0.4962660481705694, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5885500389376729, 2.411449961062325, 0, 2, 0.1961833463125578, 0, 0.8293765295958837, 2.182419985509698, 0.6461212127452775, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999836936042895, 0, 2, 0.3333514525356523, 0, 1.000081538626558, 2.631612855142364, 0.4444202858363247, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 9, 0.3333333333333333, 0, 4.500000000000002, 11.84129232542776, 0.02601229487374895, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998369205068948, 2.000090020578653, 1, 1, 0.3332870900332978, 1.000163106092364, 0.4999774958682542, -1.316187561696922, 0.8889197156171365, 0.5554938956837321, 0.3800260880593912],
[0.6562090294812474, 2.343790970518751, 0, 0, 0.218736343160416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9995654630284471, 2.000434536971552, 0, 2, 0.3331884876761491, 0, 0.9997827787095649, 2.630826698806312, 0.4446375929676212, 1, 0.3800260880593912],
[1.000073265722325, 1.465636550761299, 0, 2, 0.4055924419964961, 0, 1.364594789179579, 3.590792400984634, 0.3533203450116889, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2.000000000000001, 5.262796589079003, 0.1975308641975309, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.845289984832031, 0, 0, 0.3514580254845391, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5924547341784587, 2.407110522256222, 0, 3, 0.1975135339721389, 0, 1.246307542699807, 3.279531542331987, 0.5167888681780411, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.845780260075935, 0, 2, 0.3513974757746463, 0, 1.083552600089959, 2.851258463920559, 0.4206852344315005, 1, 0.3800260880593912],
[0.9984047050566963, 2.001595294943303, 0, 3, 0.3328015683522322, 0, 1.498804482394119, 3.943951558820042, 0.2970058819694574, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 2.154546632344528, 0, 1, 0.2817786742091364, 0, 0.4641347673741565, 1.221323435304843, 0.7182213257908636, 1, 0.3800260880593912],
[0.373390174743031, 1.783102090953126, 0, 2, 0.1731470039019563, 0, 1.121640768718372, 2.951483605891497, 0.6836858771563116, 1, 0.3800260880593912],
[0.5885497470147983, 2.411450252985199, 0, 1, 0.1961832490049329, 0, 0.4146882145970347, 1.091209860656267, 0.8038167509950671, 1, 0.3800260880593912],
[1.000073226593687, 1.465071440495295, 0, 2, 0.4056854106556939, 0, 1.365121143392067, 3.592177448561699, 0.3532098311074913, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.792009374139903, 0, 0, 0.2729915790122753, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998367814821896, 2.000163218517809, 1, 1, 0.3332789271607299, 1.000163245162444, 0.4999591987003115, -1.316236074782212, 0.8889251567105929, 0.5554830110320528, 0.3800260880593912],
[0.5881870014405645, 2.411812998559433, 0, 1, 0.1960623338135217, 0, 0.4146258439594183, 1.091045738666814, 0.8039376661864783, 1, 0.3800260880593912],
[0.9959046454909419, 2.000830844895409, 0, 3, 0.3323298464899036, 0, 1.499377125084665, 3.945458409819327, 0.2976362937363895, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 3, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 1.5, -1.315699147269751, 0.7901234567901239, 0.5390946502057611, 0.3800260880593912],
[1.071762199347954, 1.085619669199909, 0, 1, 0.4967883595264286, 0, 0.9211329053544048, 2.423867556193796, 0.5032116404735714, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.845289984832031, 0, 0, 0.3514580254845391, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[1.068108043149115, 1.930214980694487, 2, 1, 0.3562351469989009, 1.872469749505282, 0.518077006966448, -3.563946752853365, 0.954792520162729, 0.2902954801974437, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[1.261014546507106, 1.327100684767017, 0, 0, 0.487232767409012, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0, 2.255143980360307, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8447475093955579, 2.155252490604442, 2, 0, 0.2815825031318526, 2.367571348545389, 0, -6.230023208762923, 1, 0.07928870606999983, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9996738702451825, 2.000180025021454, 0, 2, 0.3332408527703741, 0, 0.9999099955907961, 2.63116145709062, 0.444567760414378, 1, 0.3800260880593912],
[0.372744802391168, 2.43576403231865, 1, 0, 0.132719825476241, 2.682800654992298, 0, -7.059517068136186, 1, 0.1327198254762409, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.792371912737297, 0, 1, 0.2729514333345776, 0, 0.5579199232556639, 1.468109534544563, 0.7270485666654224, 1, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 2.154710015167968, 0, 0, 0.2817633282773439, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450189243620643, 2.154981075637936, 1, 0, 0.2816729747873548, 1.183405449475509, 0, -3.114011081498606, 1, 0.2816729747873548, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.631398294539502, 0.4444444444444445, 1, 0.3800260880593912],
[1.070951540155401, 1.085547262332144, 0, 1, 0.4966158751955004, 0, 0.9211943456534925, 2.424029230092031, 0.5033841248044997, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.465473275083363, 1, 0, 0.4056016384790007, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.4056016384790007, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9996373017442751, 2.000362698255724, 0, 1, 0.3332124339147585, 0, 0.4999093418768406, 1.315460589639083, 0.6667875660852416, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6562090294812474, 2.343790970518751, 0, 0, 0.218736343160416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 2.154710015167968, 0, 0, 0.2817633282773439, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999098826268041, 2.000090117373194, 0, 1, 0.3333032942089348, 0, 0.4999774716717983, 1.315639866265341, 0.6666967057910651, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450189207235471, 2.154981079276453, 1, 0, 0.2816729735745157, 1.183405454571065, 0, -3.114011094907043, 1, 0.2816729735745157, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411015920354326, 0, 2, 0.1960952027572357, 0, 0.8295258372686637, 2.182812873465213, 0.64626292302993, 1, 0.3800260880593912],
[0.8445657860085627, 2.15399510847631, 1, 2, 0.2816570400694337, 1.184040386866751, 0.9285072153273167, -0.6724095517871366, 0.8066960289997889, 0.6293231023771837, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6562090294812474, 2.343790970518751, 0, 0, 0.218736343160416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2970839490309219, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450189452495162, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2970169835460993, 1.18340542022371, 0, -3.114011004525472, 1, 0.2970169835460993, 0.3800260880593912],
[1.069309424180954, 1.085400590987012, 0, 0, 0.4962660481705694, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8080014263887501, 2.000709241652496, 0, 1, 0.2876769884426146, 0, 0.4998227524425512, 1.315232738349368, 0.7123230115573853, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.315699147269751, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.80818887078032, 2.000708309468301, 0.34375, 1.15625, 0.287724618922785, 0.4253337461429079, 0.5779203267803089, 0.4015160680588711, 0.7263436717747107, 0.3988651579235269, 0.3800260880593912],
[1.069309424180954, 1.085400590987012, 0, 0, 0.4962660481705694, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6562090294812474, 2.343790970518751, 0, 0, 0.218736343160416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.999565463028447, 2.000434536971552, 0, 1, 0.3331884876761491, 0, 0.4998913893547824, 1.315413349403156, 0.6668115123238509, 1, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 2.154710015167968, 0, 0, 0.2817633282773439, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.0003450900633800206, 2.999654909936618, 0, 1, 0.0001150300211266736, 0, 0.3333716810848518, 0.8772336730544453, 0.9998849699788733, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5883865410403784, 2.409875643267357, 1, 2, 0.1962425247931512, 1.699563008752395, 0.8299183427109794, -2.288381491076754, 0.8995816565819721, 0.4807517098646538, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8085088347098194, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2878783305637549, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.0008935136533300563, 2.2549645531357, 0, 1, 0.0003960859357618524, 0, 0.4434659509877545, 1.166935547115515, 0.9996039140642381, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2272368804014167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8449392635157724, 2.155060736484228, 2.5, 1, 0.2816464211719241, 2.958792552257021, 0.4640240449238581, -6.564729595467341, 0.9773317355913748, 0.1490278526038809, 0.3800260880593912],
[0.8444770493509085, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2968830595921359, 1.184164804441555, 0, -3.116009246861209, 1, 0.2968830595921359, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2970839490309219, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[1.845289984832031, 1.154710015167966, 0, 0, 0.6150966616106774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.465472735286117, 1, 0, 0.4056017272825165, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.4056017272825165, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999435834832189, 1, 0, 0.3333960301424309, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333960301424309, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999836928068792, 0, 1, 0.3333514534217601, 0, 0.50004077130713, 1.315806432817798, 0.6666485465782399, 1, 0.3800260880593912],
[0.6757593746733936, 1.799626046072524, 0, 0, 0.2729915790122753, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3784176794431107],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.5, 3.947097441809252, 0.2962962962962963, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.464908689372888, 0, 0, 0.4056945412669284, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9995650878479295, 2.000434912152069, 0, 1, 0.3331883626159767, 0, 0.4998912956004148, 1.315413102698073, 0.6668116373840234, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.315699147269751, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2272368804014167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.8450189261045657, 2.154981073895434, 1, 0, 0.2816729753681886, 1.183405447035226, 0, -3.114011075077248, 1, 0.2816729753681886, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8412273971629939, 2.158227149396868, 1, 1, 0.2804601250343385, 1.188739220063993, 0.463343258507084, -1.908805696106691, 0.9213421182657233, 0.4822623683344002, 0.3800260880593912],
[0.9998369293377279, 2.000163070662271, 0, 1, 0.3332789764459095, 0, 0.4999592356581664, 1.315591880050171, 0.6667210235540906, 1, 0.3800260880593912],
[0.9143270529011475, 2.085672947098848, 1, 0, 0.3047756843003829, 1.093700549302368, 0, -2.877961760171165, 1, 0.3047756843003828, 0.3800260880593912],
[0.3271006847670173, 2.672899315232983, 0, 0, 0.1090335615890057, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.001653756147457464, 2.254909888972738, 0, 2, 0.000732864836776796, 0, 0.8869534032294006, 2.33392767259385, 0.9985348074173154, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.315699147269751, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3800260880593912],
[0.9989128283834493, 2.001087171616549, 1, 2, 0.3329709427944832, 1.001088354845047, 0.9994567095167217, -0.004293508734248169, 0.7412237967037882, 0.7032202536171733, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.09248067955304, 0, 0, 0.1510920105988174, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.465474100887649, 1, 0, 0.4056015026237623, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.4056015026237623, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999990136950458, 0.75, 0.75, 0.3333344292313298, 0.7500000000000002, 0.3750018493309092, -0.9867694941261128, 0.8505166845888256, 0.4556702882430819, 0.3800260880593912],
[0.9914980189607051, 1.942994756516367, 4, 2, 0.3378771374891231, 4.034299538180447, 1.029338856058386, -7.907248414094243, 0.9810183833854557, 0.1046861217461822, 0.3800260880593912],
[0.5888207961335021, 2.411179203866495, 1, 1, 0.1962735987111676, 1.698309581737789, 0.4147348311549924, -3.377596409597535, 0.9614766744489676, 0.3540238718713027, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999836983346948, 0, 1, 0.3333514472790751, 0, 0.5000407574853374, 1.315806396447157, 0.6666485527209249, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5878879123832902, 2.411113967528988, 0, 3, 0.1960278572417855, 0, 1.244238157300597, 3.274086165121762, 0.5196644437713349, 1, 0.3800260880593912],
[0.8444771154680953, 2.155359817942601, 1, 1, 0.2815076733214155, 1.184164711728983, 0.4639596561443509, -1.895146354984127, 0.9207534298611633, 0.4837687765039942, 0.3800260880593912],
[0.6561371871095035, 2.343862812890495, 0, 1, 0.218712395703168, 0, 0.4266461306951586, 1.122675900683117, 0.781287604296832, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999099841909044, 2.000090015809095, 0, 1, 0.3333033280636349, 0, 0.4999774970605365, 1.315639933073224, 0.6666966719363652, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -5.262796589079003, 1, 0.1111111111111109, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.631398294539502, 0.4444444444444445, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.5, 3.947097441809252, 0.2962962962962963, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450189082572723, 2.154981091742728, 1, 0, 0.2816729694190908, 1.183405472029441, 0, -3.114011140846983, 1, 0.2816729694190907, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999836936042894, 0, 1, 0.3333514525356524, 0, 0.5000407693132792, 1.315806427571183, 0.6666485474643475, 1, 0.3800260880593912],
[0.9144171679128456, 2.08558283208715, 1, 1, 0.3048057226376156, 1.093592766070323, 0.4794822745060902, -1.615969300160937, 0.9070934714473611, 0.5167049167225921, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[1.845289984832031, 1.154710015167966, 0, 0, 0.6150966616106774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9995653454299996, 2.000434654569999, 0, 1, 0.3331884484766667, 0, 0.4998913599679435, 1.315413272074678, 0.6668115515233333, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6725825807794258, 1.482816694920643, 1, 1, 0.3120454703507184, 1.486806272682746, 0.6743921911760765, -2.137785028536525, 0.9026276244335989, 0.5267185651350359, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.466037927107451, 1, 0, 0.4055087673257945, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.4055087673257944, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9992907731825381, 2.000709226817461, 0, 1, 0.3330969243941795, 0, 0.499822756148681, 1.315232748101672, 0.6669030756058205, 1, 0.3800260880593912],
[0.9601490936616623, 1.971829173053857, 0, 1, 0.3274748331396219, 0, 0.5071433234001994, 1.334496076282379, 0.6725251668603781, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999836916968532, 0, 1, 0.3333514546552565, 0, 0.5000407740826476, 1.315806440121291, 0.6666485453447435, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450190470215189, 2.154688314863122, 1, 2, 0.2817004944411026, 1.18340527769729, 0.9282084959592176, -0.671524376237533, 0.806643274739244, 0.6293903678403873, 0.3800260880593912],
[0.8450189189293466, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2970169770425811, 1.18340545708375, 0, -3.114011101518919, 1, 0.2970169770425811, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2.75, 0, 0.3333333333333333, 2.750000000000001, 0, -7.236345309983628, 1, 0.0732819804361311, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.792009374139903, 0, 0, 0.2729915790122753, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 2.154710015167968, 0, 0, 0.2817633282773439, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8081917144837334, 2.000519221792978, 1, 0, 0.2877447102317656, 1.23733018054855, 0, -3.255908526877707, 1, 0.2877447102317656, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9997880785023862, 2.00011698157433, 0, 1, 0.3332732398127355, 0, 0.4999707563169036, 1.315622195491924, 0.6667267601872644, 1, 0.3800260880593912],
[0.5891279328869659, 2.410800236597138, 0, 4, 0.1963806796708329, 0, 1.659200102637301, 4.366016320379557, 0.4170628219234493, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.482138919714024, 0, 1, 0.3122447223074578, 0, 0.6747005875757909, 1.775405975471735, 0.6877552776925422, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.631398294539502, 0.4444444444444445, 1, 0.3800260880593912],
[0.9995651783523855, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3332366922933248, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6667633077066752, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.998133772110337, 2.001629454136663, 0, 3, 0.3327375185404552, 0, 1.498778904257257, 3.943884252554328, 0.29709142622218, 1, 0.3800260880593912],
[0.9996735169235808, 2.000163176778665, 0, 2, 0.3332426458487761, 0, 0.9999184182667898, 2.631183620505865, 0.4445653693147407, 1, 0.3800260880593912],
[1.000275472259775, 1.844743092793289, 0, 1, 0.3515883813718167, 0, 0.542080902162811, 1.426430761453655, 0.6484116186281833, 1, 0.3800260880593912],
[1.00137651114104, 1.842720444555278, 0, 2, 0.3520894423572398, 0, 1.085351826376833, 2.855992944903329, 0.4197880907049524, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5886336939735874, 2.41136630602641, 0, 2, 0.1962112313245293, 0, 0.8294053022975661, 2.182495697947834, 0.6460763846488293, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998369377272301, 2.000090011072955, 1, 3, 0.3332870949164656, 1.000163088866411, 1.499932494733395, 1.3150923622614, 0.5926747942221843, 0.8024143290142376, 0.3800260880593912],
[0.8442474467514712, 2.155550058900441, 2, 2, 0.2814348119034123, 2.368973702787825, 0.927837417526834, -3.792203563234763, 0.9296557590086663, 0.3157242790790197, 0.3800260880593912],
[0.5893192848250619, 2.410680715174936, 1, 5, 0.1964397616083541, 1.696873029187985, 2.074102957113159, 0.9926421889915611, 0.6641090603784572, 0.7307779458292765, 0.3800260880593912],
[1.001715471525702, 1.841884278134526, 0, 2, 0.3522702066791903, 0, 1.085844547207719, 2.857289489657407, 0.4195538851554189, 1, 0.3800260880593912],
[0.8078583675470984, 2.000852310560042, 0, 2, 0.2876260534216127, 0, 0.9995740262509414, 2.630277387942709, 0.507476639763667, 1, 0.3800260880593912],
[0.5883863728370898, 2.411613627162908, 1, 0, 0.1961287909456968, 1.699563494610159, 0, -4.472228481178765, 1, 0.1961287909456968, 0.3800260880593912],
[1.003848291945189, 1.837650013281751, 0, 2, 0.3532813270022399, 0, 1.088346521668899, 2.863873180987539, 0.4182450420039838, 1, 0.3800260880593912],
[0.9992747395637328, 2.000725260436266, 1, 2, 0.3330915798545778, 1.000725786820734, 0.9996375012348733, -0.002863712834604639, 0.7410630202394122, 0.7033812488284112, 0.3800260880593912],
[1.000890929989771, 1.998619591288219, 0, 4, 0.3336847538588812, 0, 2.001381362133943, 5.266431503042399, 0.1971146950048611, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998368827129435, 2.000163117287055, 1, 1, 0.3332789609043146, 1.000163143898647, 0.4999592240038711, -1.316235741733085, 0.8889251342185402, 0.5554830560271696, 0.3800260880593912],
[0.8450189261921855, 2.154981073807814, 1, 0, 0.2816729753973952, 1.183405446912519, 0, -3.114011074754357, 1, 0.2816729753973952, 0.3800260880593912],
[0.5881870062895846, 2.411812993710413, 0, 4, 0.1960623354298617, 0, 1.658503379172142, 4.364182963441573, 0.4177240726304734, 1, 0.3800260880593912],
[0.5333592886286025, 2.434503472836081, 1, 2, 0.1797115741178618, 1.874908755355597, 0.8215227549747935, -2.771878124893833, 0.9147192701894136, 0.4480499826404128, 0.3800260880593912],
[1.010810334811165, 1.405197278336043, 1, 3, 0.418380442723206, 0.9893052787067271, 2.134931547513695, 3.014599009918307, 0.4437013687668672, 0.8855657557059844, 0.3800260880593912],
[0.9985505322372653, 2.001449467762733, 0, 2, 0.3328501774124219, 0, 0.9992757909774491, 2.62949261215267, 0.4450888857786369, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2.000000000000001, 5.262796589079003, 0.1975308641975309, 1, 0.3800260880593912],
[0.8087112504178171, 1.999999999999999, 0, 1, 0.2879296511157974, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.7120703488842026, 1, 0.3800260880593912],
[0.0006916426251948834, 2.999308357374803, 0, 1, 0.000230547541731628, 0, 0.3334102002353861, 0.8773350322814685, 0.9997694524582684, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.315699147269751, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411450209640494, 0, 1, 0.1960668112961045, 0, 0.4146882220508641, 1.091209880270261, 0.8039331887038955, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998368190637811, 2.000090076575687, 1, 1, 0.3332870612670896, 1.000163207568583, 0.4999774818702563, -1.316187865555579, 0.8889197347919474, 0.5554938573261263, 0.3800260880593912],
[0.998696857224651, 2.001303142775348, 0, 1, 0.3328989524082171, 0, 0.4996744264405789, 1.314842433560742, 0.6671010475917829, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.315699147269751, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.631398294539502, 0.4444444444444445, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -5.262796589079003, 1, 0.1111111111111109, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9605432410939679, 1.971362960698904, 0, 0, 0.3276173161701394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[1.845289984832031, 1.154710015167966, 0, 0, 0.6150966616106774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[1.845289984832031, 1.154710015167966, 0, 0, 0.6150966616106774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450186874751159, 2.154981312524884, 1, 0, 0.2816728958250386, 1.183405781223564, 0, -3.114011954459871, 1, 0.2816728958250386, 0.3800260880593912],
[0.8082763103424049, 2.000434555467139, 0, 1, 0.2877748365563568, 0, 0.4998913847328942, 1.315413337241127, 0.7122251634436432, 1, 0.3800260880593912],
[0.9605432410939679, 1.971362960698904, 0, 0, 0.3276173161701394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.844476903895776, 2.155359804846989, 1, 1, 0.2815076238765333, 1.184165008405509, 0.4639596589632935, -1.895147128240472, 0.9207534576993882, 0.4837687054524549, 0.3800260880593912],
[0.3729737665406538, 1.782628422164028, 1, 1, 0.1730253237332147, 2.681153715648795, 0.5609694020170769, -5.579049386999903, 0.9700622373470162, 0.3161128848134458, 0.3800260880593912],
[1.000023815384314, 1.999976184615685, 1, 2, 0.3333412717947715, 0.9999761851828448, 1.000011907833952, 9.40005232010421e-05, 0.7407301560624717, 0.7037142881929167, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.09248067955304, 0, 0, 0.1510920105988174, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8453970336360188, 2.15440086054508, 1, 2, 0.2818179968976876, 1.182876163758276, 0.9283323436354294, -0.6698061741568276, 0.8065006002211359, 0.6295722157404933, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.001729630934904371, 2.998270369065093, 0, 3, 0.0005765436449681243, 0, 1.000576876239299, 2.632916285691752, 0.9982713660811745, 1, 0.3800260880593912],
[0.9995658675079985, 2.000434132492, 0, 2, 0.3331886225026663, 0, 0.9997829808615295, 2.630827230748647, 0.4446374131598916, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9991829963762372, 2.000450989499496, 0, 1, 0.3331016387602799, 0, 0.4998872780433353, 1.315402530905226, 0.6668983612397201, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998369360428944, 2.000090012002715, 0, 1, 0.3332870944388387, 0, 0.4999774980120457, 1.315639935577023, 0.6667129055611614, 1, 0.3800260880593912],
[0.6733178293445944, 1.481392185823373, 0, 1, 0.3124865177238743, 0, 0.6750406877866647, 1.776300914586601, 0.6875134822761257, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.315699147269751, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3800260880593912],
[0.999746958591511, 2.000253041408488, 0, 3, 0.3332489861971705, 0, 1.49981024295183, 3.946598115436318, 0.2964087733739924, 1, 0.3800260880593912],
[0.9996376297683548, 2.000362370231644, 0, 2, 0.3332125432561184, 0, 0.9998188477062774, 2.630921610702747, 0.4446055124709738, 1, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.436080824889973, 0, 0, 0.1326070280488632, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 2, 0.3333333333333333, 1, 1, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.3800260880593912],
[0.3740406740954156, 2.09143224688284, 1, 1, 0.1517115320605521, 2.67350603625772, 0.4781412362224227, -5.776879190704933, 0.97698361103984, 0.2804066751609443, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9982621685482788, 2.00173783145172, 0, 3.5, 0.3327540561827597, 0, 1.748480717608107, 4.600949178349175, 0.2426614556027514, 1, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.436080824889973, 0, 0, 0.1326070280488632, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.436080824889973, 0, 0, 0.1326070280488632, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[1.069309424180954, 1.930690575819045, 0, 0, 0.3564364747269849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9995650803567643, 2.000434919643235, 1, 1, 0.3331883601189215, 1.000435108880635, 0.4998912937284378, -1.317130141533787, 0.8889855166812639, 0.5553622369191069, 0.3800260880593912],
[0.9992731346656362, 2.000726865334362, 0, 1, 0.3330910448885456, 0, 0.4998183496840683, 1.315221152938205, 0.6669089551114544, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999980283008617, 0.75, 0.75, 0.3333355241245522, 0.7500000000000002, 0.3750036969723309, -0.9867646322456268, 0.8505160979155638, 0.4556716292062878, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.8439346262245655, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2967489542278692, 1.184925904123179, 0, -3.118012003265408, 1, 0.2967489542278692, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9992894430597387, 2.00071055694026, 0, 1, 0.333096481019913, 0, 0.4998224238539165, 1.315231873701795, 0.666903518980087, 1, 0.3800260880593912],
[0.9964477414148681, 2.003552258585131, 0.75, 1, 0.3321492471382895, 0.7526736915827277, 0.4991135098747963, -0.6672178297093765, 0.8154524324283001, 0.5066115429985226, 0.3800260880593912],
[0.6761724536103295, 1.48767562527399, 0, 1, 0.3124861029795419, 0, 0.6721895438838198, 1.776299843029008, 0.6875138970204582, 1, 0.378421214482336],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.8447475233255676, 2.155252476674433, 2, 0, 0.2815825077751892, 2.367571309503793, 0, -6.230023106028933, 1, 0.07928870868496452, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8085088347098194, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2878783305637549, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[1.000891976415399, 1.998944961364449, 0, 2, 0.3336487939761651, 0, 1.00052779774128, 2.632787140615766, 0.4440239297694191, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.792009374139903, 0, 0, 0.2729915790122753, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.672264860818045, 1.482445154349922, 1, 0, 0.3119978354793324, 1.487508954109472, 0, -3.914228524955901, 1, 0.3119978354793324, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.464908689372888, 0, 0, 0.4056945412669284, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999435502064747, 1, 0, 0.3333960671305055, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333960671305054, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 2.154710015167968, 0, 1, 0.2817633282773439, 0, 0.4640995739382805, 1.2212308273577, 0.718236671722656, 1, 0.3800260880593912],
[0.3738358378691723, 1.785329220832172, 1, 1, 0.1731390735333686, 2.674970932963255, 0.5601207823921029, -5.565013079419534, 0.9700228612160067, 0.3163010082827441, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.792009374139903, 0, 0, 0.2729915790122753, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[1.84159557648019, 1.155800051626408, 2, 0, 0.6143985662791847, 1.086014771941713, 0, -2.857737418732127, 1, 0.3774855982459175, 0.3800260880593912],
[0.9138725183532802, 2.086127481646715, 1, 1, 0.3046241727844272, 1.094244525266953, 0.4793570904931636, -1.618013747197518, 0.9072041133554033, 0.5164524589242578, 0.3800260880593912],
[0.8085088347098194, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2878783305637549, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.464908689372888, 0, 0, 0.4056945412669284, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450188625520949, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2970169631121811, 1.183405536037192, 0, -3.11401130927687, 1, 0.2970169631121811, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411450264639042, 0, 1, 0.1960668077011205, 0, 0.4146882125929663, 1.091209855382765, 0.8039331922988795, 1, 0.3800260880593912],
[0, 2.255143980360307, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -5.262796589079003, 1, 0.1111111111111109, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6562090294812474, 2.343790970518751, 0, 0, 0.218736343160416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5883863728370898, 2.411613627162908, 1, 0, 0.1961287909456968, 1.699563494610159, 0, -4.472228481178765, 1, 0.1961287909456968, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.8444758798238458, 2.155524120176154, 1, 1, 0.2814919599412819, 1.184166444408804, 0.4639242913775782, -1.895243973141826, 0.9207622764884157, 0.4837461963709796, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.845289984832031, 0, 0, 0.3514580254845391, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -5.262796589079003, 1, 0.1111111111111109, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 2.154710015167968, 0, 0, 0.2817633282773439, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8447474994119714, 2.155252500588029, 2, 0, 0.2815824998039904, 2.367571376526358, 0, -6.230023282391997, 1, 0.07928870419586431, 0.3800260880593912],
[0.9996549099365625, 1.465253779436326, 0, 1, 0.4055545401119465, 0, 0.682475632572464, 1.795865215615948, 0.5944454598880535, 1, 0.3800260880593912],
[0, 2.999999999999997, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.930746561085163, 3, 0, 0.3412099883620546, 3.000000000000001, 0, -7.894194883618503, 1, 0.03972511908874343, 0.3800260880593912],
[0.9998366364568184, 2.000163363543181, 1, 1, 0.3332788788189396, 1.000163390235189, 0.4999591624498883, -1.316236551915689, 0.8889251889331906, 0.5554829465710698, 0.3800260880593912],
[0.6562090294812474, 2.343790970518751, 0, 0, 0.218736343160416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998368827129432, 2.000163117287056, 0, 2, 0.3332789609043145, 0, 0.999918448007742, 2.631183698766157, 0.4445169439728305, 1, 0.3800260880593912],
[0.002781478222554617, 2.997218521777443, 0, 3, 0.0009271594075182063, 0, 1.000928019829835, 2.633840284337026, 0.9972210998541372, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.792009374139903, 0, 0, 0.2729915790122753, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9964452346259215, 2.003554765374077, 0, 1, 0.3321484115419741, 0, 0.4991128853986147, 1.313364795420604, 0.6678515884580259, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998751999979362, 1.930965411895639, 2, 3, 0.3411564572772624, 2.000249631158097, 1.553627000006636, -1.175242029914698, 0.7783992552240615, 0.5544549691561804, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.465473454721734, 0, 1, 0.4056016089262113, 0, 0.6823733290958052, 1.795596014421943, 0.5943983910737887, 1, 0.3800260880593912],
[0.9989446094789008, 2.001055390521098, 2, 1, 0.332981536492967, 2.002113011094078, 0.4997362915274366, -3.95335153762351, 0.9630801048589404, 0.2587903206535318, 0.3800260880593912],
[0.002034983755918313, 2.264119208526754, 0, 2, 0.0008979899791675237, 0, 0.883345714513586, 2.334305087354354, 0.9982048264276675, 1, 0.3784191360841994],
[0.9601507057830124, 1.971827266176304, 0, 1, 0.3274754159020453, 0, 0.5071438138388072, 1.334497366821695, 0.6725245840979548, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998196039356487, 2.00018039606435, 1, 1, 0.333273201311883, 1.000180428612963, 0.4999549050513881, -1.316292589585057, 0.8889289732873289, 0.5554753759110953, 0.3800260880593912],
[0.8444771693471416, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2968830892536094, 1.184164636177307, 0, -3.116008804090954, 1, 0.2968830892536094, 0.3800260880593912],
[0.9964543886223257, 2.003382385912647, 0, 3, 0.3321695357164203, 0, 1.497467493522631, 3.940433408583791, 0.2978507368782431, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9134362100940939, 2.086563789905902, 2, 1, 0.3044787366980318, 2.189534395394702, 0.4792568551403345, -4.500421402614554, 0.9717725980780139, 0.2216670994597152, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9601501597063462, 1.971827912096251, 0, 1, 0.3274752185019038, 0, 0.5071436477115792, 1.334496929674791, 0.6725247814980961, 1, 0.3800260880593912],
[0.5885495467451265, 2.411450453254871, 0, 2, 0.1961831822483756, 0, 0.8293763603148, 2.182419540063743, 0.6461214765003481, 1, 0.3800260880593912],
[0.8442053389433763, 2.155794661056624, 2, 0, 0.2814017796477921, 2.36909186395722, 0, -6.234024290424434, 1, 0.07918696158894456, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5885497903595243, 2.411450209640473, 0, 1, 0.1961832634531749, 0, 0.4146882220508677, 1.091209880270271, 0.8038167365468251, 1, 0.3800260880593912],
[1.000891032069988, 1.998293666832657, 0, 2, 0.3337210383996018, 0, 1.000853895098435, 2.633645232645239, 0.4439276546713048, 1, 0.3800260880593912],
[0.588386541040377, 2.411613458959621, 1, 0, 0.1961288470134592, 1.699563008752399, 0, -4.472227202693484, 1, 0.1961288470134592, 0.3800260880593912],
[0.845018908257826, 2.154981091742174, 1, 0, 0.2816729694192753, 1.183405472028665, 0, -3.114011140844942, 1, 0.2816729694192753, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.410145723235182, 0, 3, 0.1961521162424548, 0, 1.244738013589089, 3.275401486106815, 0.5194235286896474, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998369360428794, 2.00016306395712, 0, 1, 0.3332789786809599, 0, 0.4999592373341809, 1.315591884460433, 0.6667210213190401, 1, 0.3800260880593912],
[0.6565714258995059, 2.343428574100492, 0, 1, 0.2188571419665021, 0, 0.4267251884917563, 1.122883933234254, 0.7811428580334978, 1, 0.3800260880593912],
[0.9605432410939679, 1.971362960698904, 0, 0, 0.3276173161701394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[1.84261831561157, 1.157381684388427, 1, 0, 0.6142061052038574, 0.5427059915379693, 0, -1.428075620569381, 1, 0.6142061052038574, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.436080824889973, 0, 0, 0.1326070280488632, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6562090294812474, 2.343790970518751, 0, 0, 0.218736343160416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450189261918918, 2.154981073808108, 1, 0, 0.2816729753972972, 1.18340544691293, 0, -3.114011074755439, 1, 0.2816729753972973, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999836934316425, 0, 1, 0.3333514527275032, 0, 0.500040769744967, 1.315806428707125, 0.6666485472724968, 1, 0.3800260880593912],
[0.843120222852912, 1.999999999999999, 5, 0, 0.2965475100475661, 5.930352356015405, 0, -15.60511907563724, 0.9999999999999999, 0.002293355647670525, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8455081255788597, 2.15449187442114, 1, 2, 0.2818360418596199, 1.182720744777433, 0.9282931273701609, -0.6695003985292433, 0.8064786863597627, 0.6296001370220952, 0.3800260880593912],
[1.000891130146474, 1.999108869853525, 0, 1, 0.3336303767154915, 0, 0.5002228818449843, 1.316285638176526, 0.6663696232845085, 1, 0.3800260880593912],
[1.00214239041653, 2.003726965302462, 0, 1, 0.3333951918135915, 0, 0.4990699917286636, 1.316065423429452, 0.6666048081864084, 1, 0.3792136643390936],
[1.000720092858594, 2.005707078390998, 0, 2, 0.332860247681521, 0, 0.9971545803210825, 2.629532303533832, 0.4450754491235615, 1, 0.3792136643390936],
[0.3755638047263897, 2.094625681400231, 1, 0, 0.1520384597358531, 2.662663407429616, 0, -7.021538667574641, 1, 0.1520384597358531, 0.3792136643390936],
[1.00214239041653, 2.004284780833061, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.498931094803983, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3792136643390936],
[0.6743409282772271, 2.139481567510248, 0, 0.6666666666666666, 0.2396529735926027, 0, 0.3116019678741511, 0.8217055374764027, 0.833056712014445, 1, 0.3792136643390936],
[0.3734536724140706, 2.441274308868665, 0, 1, 0.1326784239533794, 0, 0.4096221372449619, 1.080188230977555, 0.8673215760466206, 1, 0.3792136643390936],
[0.8452899848320317, 2.154710015167968, 0, 1, 0.2817633282773439, 0, 0.4640995739382805, 1.2212308273577, 0.718236671722656, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.3727764768548347, 2.436039929444102, 0, 4.666666666666666, 0.1327165691637451, 0, 1.915677411630764, 5.040910273853037, 0.5145389200038348, 1, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.436080824889973, 0, 0, 0.1326070280488632, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.436080824889973, 0, 0, 0.1326070280488632, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.5889837646557624, 2.4097136041379, 0, 5, 0.1964132062091691, 0, 2.074935374649554, 5.459981406132516, 0.3350919189298235, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.792406381333852, 0, 3, 0.2729476170724208, 0, 1.673727582785939, 4.404243906866641, 0.3843236466737363, 1, 0.3800260880593912],
[0.9970049093690382, 2.002995090630961, 1, 2, 0.3323349697896795, 1.003004088147226, 0.9985046939730554, -0.01183969815637395, 0.7420708934123166, 0.702370557857536, 0.3800260880593912],
[0.6723856430410478, 1.488618941022916, 1, 2, 0.3111449406444877, 1.487241749358637, 1.34352717467486, -0.3781702867233614, 0.7698110917650942, 0.6731236066830176, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 5, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 2.500000000000001, 1.31569914726975, 0.5706447187928672, 0.736625514403292, 0.3800260880593912],
[1.254212174545941, 1.336959736639666, 1, 2, 0.4840327919316122, 0.7973132618984718, 1.49593136217163, 1.838342477593214, 0.5239426703678293, 0.8626380954810842, 0.3800260880593912],
[1.000890982923419, 1.998962797804475, 3, 3, 0.3336465894949585, 2.99732943066142, 1.500778305276614, -3.938022079028746, 0.8995531462106114, 0.3202348349609205, 0.3800260880593912],
[0.3729723790680503, 1.78262871359778, 1, 1, 0.1730247680505652, 2.681163689650987, 0.5609693103067749, -5.579075873898593, 0.9700624296410482, 0.3161119657421785, 0.3800260880593912],
[0.8080014280768681, 2.00070923929289, 0, 1, 0.2876769891124201, 0, 0.4998227530320345, 1.315232739900533, 0.71232301088758, 1, 0.3800260880593912],
[0.3726553419439261, 1.7829456002174, 0, 1, 0.1728777041497677, 0, 0.5608696080677206, 1.475871330128438, 0.8271222958502323, 1, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.436080824889973, 0, 0, 0.1326070280488632, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.3752303261608253, 1.782756761537227, 1.5, 2.5, 0.1738797828309007, 3.997544695673382, 1.402322545586259, -6.82906313969039, 0.919811688282555, 0.3381594463196688, 0.3800260880593912],
[0.6728431316953534, 1.482313095336377, 0.25, 0.5, 0.312201557945547, 0.3715576309296322, 0.3373106542558988, -0.09011743601239594, 0.8368393119982198, 0.2447410320026703, 0.3800260880593912],
[0.9996376417521151, 2.000362358247884, 1, 1, 0.3332125472507051, 1.000362489598981, 0.4999094268479934, -1.316891335820018, 0.8889693983546967, 0.5553944928561069, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2.75, 0, 0.3333333333333333, 2.750000000000001, 0, -7.236345309983628, 1, 0.0732819804361311, 0.3800260880593912],
[1.000303898638345, 2.006059480997004, 0, 1, 0.3327288728349516, 0, 0.4984897055510059, 1.314507295667152, 0.6672711271650484, 1, 0.3792217108220819],
[0.9998000636066394, 2.00019993639336, 0, 0.75, 0.3332666878688799, 0, 0.3749625156734856, 0.9866757242594507, 0.737843262273579, 1, 0.3800260880593912],
[0.9994924986335502, 2.000507501366449, 1, 1, 0.3331641662111836, 1.000507759054864, 0.4998731568449251, -1.317369038442695, 0.889001638352807, 0.5553299707751739, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.631398294539502, 0.4444444444444445, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999510727129661, 1, 3, 0.3333877058532594, 1, 1.500367044445199, 1.316664987396865, 0.592495930335589, 0.8025335694243396, 0.3800260880593912],
[0.5884589859035404, 2.41078148877326, 0.4375, 2.0625, 0.1962026689330248, 0.7434672772109127, 0.8555317060483633, 0.2948861469214107, 0.7338979452578123, 0.4207495237101824, 0.3800260880593912],
[0.9608504225040836, 1.970747373746611, 1.25, 0.5, 0.3277565646054663, 1.300930894886178, 0.2537108544000969, -2.755653028542661, 0.94993979111937, 0.3944614311886276, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411450643241582, 0, 1, 0.1960667829537422, 0, 0.4146881474860934, 1.091209684060651, 0.8039332170462579, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.410860522519745, 0, 2, 0.1961053638163379, 0, 0.8295793063589062, 2.182953571938087, 0.6462465860848624, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450189261918919, 2.154981073808108, 1, 0, 0.2816729753972973, 1.18340544691293, 0, -3.114011074755439, 1, 0.2816729753972973, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9605432410939679, 1.971362960698904, 0, 0, 0.3276173161701394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0, 2.999999999999997, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 2.154710015167968, 0, 0, 0.2817633282773439, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881870014405639, 2.411812998559434, 0, 1, 0.1960623338135215, 0, 0.4146258439594181, 1.091045738666814, 0.8039376661864786, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.315699147269751, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3800260880593912],
[0.8450188735283808, 2.154981126471619, 1, 0, 0.2816729578427936, 1.183405520665467, 0, -3.11401126882774, 1, 0.2816729578427937, 0.3800260880593912],
[1.000275122112299, 1.844743787937211, 0, 1, 0.3515882156631754, 0, 0.5420806978936616, 1.426430223940163, 0.6484117843368246, 1, 0.3800260880593912],
[0.9989133179438398, 2.001086682056159, 0, 1, 0.33297110598128, 0, 0.4997284770155377, 1.314984662151508, 0.6670288940187199, 1, 0.3800260880593912],
[0.373200158489395, 1.783293796112519, 1, 2, 0.1730587547871365, 2.679527265067913, 1.121520191658766, -4.099737155849308, 0.9205179905904339, 0.4345112607439151, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.315699147269751, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3800260880593912]
],
"RESOLVED": [
[0, 2.999999999999997, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411014375705072, 0, 2, 0.1960953037526405, 0, 0.8295263687157088, 2.182814271914061, 0.6462627606485594, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 1, 0.1960384104247077, 0, 0.4146135059877962, 1.09101327254933, 0.8039615895752923, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.465472118532226, 0, 1, 0.4056018287464276, 0, 0.6823739512707828, 1.795597651612118, 0.5943981712535724, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 2, 0.3333333333333333, 1, 1, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.588386374830145, 2.411613625169853, 1, 0, 0.1961287916100485, 1.699563488853187, 0, -4.472228466029878, 1, 0.1961287916100485, 0.3800260880593912],
[0.3728829684466904, 1.783610054394111, 0, 2, 0.1729117435100636, 0, 1.121321330900098, 2.950643037761279, 0.6840749840235627, 1, 0.3800260880593912],
[1.069309424180954, 1.085400590987012, 0, 0, 0.4962660481705694, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5885500389376729, 2.411449961062325, 0, 2, 0.1961833463125578, 0, 0.8293765295958837, 2.182419985509698, 0.6461212127452775, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999836936042895, 0, 2, 0.3333514525356523, 0, 1.000081538626558, 2.631612855142364, 0.4444202858363247, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 9, 0.3333333333333333, 0, 4.500000000000002, 11.84129232542776, 0.02601229487374895, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998369205068948, 2.000090020578653, 1, 1, 0.3332870900332978, 1.000163106092364, 0.4999774958682542, -1.316187561696922, 0.8889197156171365, 0.5554938956837321, 0.3800260880593912],
[0.6562090294812474, 2.343790970518751, 0, 0, 0.218736343160416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9995654630284471, 2.000434536971552, 0, 2, 0.3331884876761491, 0, 0.9997827787095649, 2.630826698806312, 0.4446375929676212, 1, 0.3800260880593912],
[1.000073265722325, 1.465636550761299, 0, 2, 0.4055924419964961, 0, 1.364594789179579, 3.590792400984634, 0.3533203450116889, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2.000000000000001, 5.262796589079003, 0.1975308641975309, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.845289984832031, 0, 0, 0.3514580254845391, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5924547341784587, 2.407110522256222, 0, 3, 0.1975135339721389, 0, 1.246307542699807, 3.279531542331987, 0.5167888681780411, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.845780260075935, 0, 2, 0.3513974757746463, 0, 1.083552600089959, 2.851258463920559, 0.4206852344315005, 1, 0.3800260880593912],
[0.9984047050566963, 2.001595294943303, 0, 3, 0.3328015683522322, 0, 1.498804482394119, 3.943951558820042, 0.2970058819694574, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 2.154546632344528, 0, 1, 0.2817786742091364, 0, 0.4641347673741565, 1.221323435304843, 0.7182213257908636, 1, 0.3800260880593912],
[0.373390174743031, 1.783102090953126, 0, 2, 0.1731470039019563, 0, 1.121640768718372, 2.951483605891497, 0.6836858771563116, 1, 0.3800260880593912],
[0.5885497470147983, 2.411450252985199, 0, 1, 0.1961832490049329, 0, 0.4146882145970347, 1.091209860656267, 0.8038167509950671, 1, 0.3800260880593912],
[1.000073226593687, 1.465071440495295, 0, 2, 0.4056854106556939, 0, 1.365121143392067, 3.592177448561699, 0.3532098311074913, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.792009374139903, 0, 0, 0.2729915790122753, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998367814821896, 2.000163218517809, 1, 1, 0.3332789271607299, 1.000163245162444, 0.4999591987003115, -1.316236074782212, 0.8889251567105929, 0.5554830110320528, 0.3800260880593912],
[0.5881870014405645, 2.411812998559433, 0, 1, 0.1960623338135217, 0, 0.4146258439594183, 1.091045738666814, 0.8039376661864783, 1, 0.3800260880593912],
[0.9959046454909419, 2.000830844895409, 0, 3, 0.3323298464899036, 0, 1.499377125084665, 3.945458409819327, 0.2976362937363895, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 3, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 1.5, -1.315699147269751, 0.7901234567901239, 0.5390946502057611, 0.3800260880593912],
[1.071762199347954, 1.085619669199909, 0, 1, 0.4967883595264286, 0, 0.9211329053544048, 2.423867556193796, 0.5032116404735714, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.845289984832031, 0, 0, 0.3514580254845391, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[1.068108043149115, 1.930214980694487, 2, 1, 0.3562351469989009, 1.872469749505282, 0.518077006966448, -3.563946752853365, 0.954792520162729, 0.2902954801974437, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[1.261014546507106, 1.327100684767017, 0, 0, 0.487232767409012, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0, 2.255143980360307, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8447475093955579, 2.155252490604442, 2, 0, 0.2815825031318526, 2.367571348545389, 0, -6.230023208762923, 1, 0.07928870606999983, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9996738702451825, 2.000180025021454, 0, 2, 0.3332408527703741, 0, 0.9999099955907961, 2.63116145709062, 0.444567760414378, 1, 0.3800260880593912],
[0.372744802391168, 2.43576403231865, 1, 0, 0.132719825476241, 2.682800654992298, 0, -7.059517068136186, 1, 0.1327198254762409, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.792371912737297, 0, 1, 0.2729514333345776, 0, 0.5579199232556639, 1.468109534544563, 0.7270485666654224, 1, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 2.154710015167968, 0, 0, 0.2817633282773439, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450189243620643, 2.154981075637936, 1, 0, 0.2816729747873548, 1.183405449475509, 0, -3.114011081498606, 1, 0.2816729747873548, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.631398294539502, 0.4444444444444445, 1, 0.3800260880593912],
[1.070951540155401, 1.085547262332144, 0, 1, 0.4966158751955004, 0, 0.9211943456534925, 2.424029230092031, 0.5033841248044997, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.465473275083363, 1, 0, 0.4056016384790007, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.4056016384790007, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9996373017442751, 2.000362698255724, 0, 1, 0.3332124339147585, 0, 0.4999093418768406, 1.315460589639083, 0.6667875660852416, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6562090294812474, 2.343790970518751, 0, 0, 0.218736343160416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 2.154710015167968, 0, 0, 0.2817633282773439, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999098826268041, 2.000090117373194, 0, 1, 0.3333032942089348, 0, 0.4999774716717983, 1.315639866265341, 0.6666967057910651, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450189207235471, 2.154981079276453, 1, 0, 0.2816729735745157, 1.183405454571065, 0, -3.114011094907043, 1, 0.2816729735745157, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411015920354326, 0, 2, 0.1960952027572357, 0, 0.8295258372686637, 2.182812873465213, 0.64626292302993, 1, 0.3800260880593912],
[0.8445657860085627, 2.15399510847631, 1, 2, 0.2816570400694337, 1.184040386866751, 0.9285072153273167, -0.6724095517871366, 0.8066960289997889, 0.6293231023771837, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6562090294812474, 2.343790970518751, 0, 0, 0.218736343160416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2970839490309219, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450189452495162, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2970169835460993, 1.18340542022371, 0, -3.114011004525472, 1, 0.2970169835460993, 0.3800260880593912],
[1.069309424180954, 1.085400590987012, 0, 0, 0.4962660481705694, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8080014263887501, 2.000709241652496, 0, 1, 0.2876769884426146, 0, 0.4998227524425512, 1.315232738349368, 0.7123230115573853, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.315699147269751, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.8085088347098194, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2878783305637549, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[1.069309424180954, 1.085400590987012, 0, 0, 0.4962660481705694, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6562090294812474, 2.343790970518751, 0, 0, 0.218736343160416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.999565463028447, 2.000434536971552, 0, 1, 0.3331884876761491, 0, 0.4998913893547824, 1.315413349403156, 0.6668115123238509, 1, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 2.154710015167968, 0, 0, 0.2817633282773439, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.0003450900633800206, 2.999654909936618, 0, 1, 0.0001150300211266736, 0, 0.3333716810848518, 0.8772336730544453, 0.9998849699788733, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5883865410403784, 2.409875643267357, 1, 2, 0.1962425247931512, 1.699563008752395, 0.8299183427109794, -2.288381491076754, 0.8995816565819721, 0.4807517098646538, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8085088347098194, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2878783305637549, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.0008935136533300563, 2.2549645531357, 0, 1, 0.0003960859357618524, 0, 0.4434659509877545, 1.166935547115515, 0.9996039140642381, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2272368804014167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450748072563898, 2.15492519274361, 2, 1, 0.2816916024187966, 2.366654387075124, 0.4640532318093227, -5.006501435155313, 0.9776477265948029, 0.1933459298094132, 0.3800260880593912],
[0.8444770493509085, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2968830595921359, 1.184164804441555, 0, -3.116009246861209, 1, 0.2968830595921359, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2970839490309219, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[1.845289984832031, 1.154710015167966, 0, 0, 0.6150966616106774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.465472735286117, 1, 0, 0.4056017272825165, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.4056017272825165, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999435834832189, 1, 0, 0.3333960301424309, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333960301424309, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999836928068792, 0, 1, 0.3333514534217601, 0, 0.50004077130713, 1.315806432817798, 0.6666485465782399, 1, 0.3800260880593912],
[0.6757593746733936, 1.799626046072524, 0, 0, 0.2729915790122753, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3784176794431107],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.5, 3.947097441809252, 0.2962962962962963, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.464908689372888, 0, 0, 0.4056945412669284, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9995650878479295, 2.000434912152069, 0, 1, 0.3331883626159767, 0, 0.4998912956004148, 1.315413102698073, 0.6668116373840234, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.315699147269751, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2272368804014167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.8450189261045657, 2.154981073895434, 1, 0, 0.2816729753681886, 1.183405447035226, 0, -3.114011075077248, 1, 0.2816729753681886, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8412273971629939, 2.158227149396868, 1, 1, 0.2804601250343385, 1.188739220063993, 0.463343258507084, -1.908805696106691, 0.9213421182657233, 0.4822623683344002, 0.3800260880593912],
[0.9998369293377279, 2.000163070662271, 0, 1, 0.3332789764459095, 0, 0.4999592356581664, 1.315591880050171, 0.6667210235540906, 1, 0.3800260880593912],
[0.9143270529011475, 2.085672947098848, 1, 0, 0.3047756843003829, 1.093700549302368, 0, -2.877961760171165, 1, 0.3047756843003828, 0.3800260880593912],
[0.3271006847670173, 2.672899315232983, 0, 0, 0.1090335615890057, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.001653756147457464, 2.254909888972738, 0, 2, 0.000732864836776796, 0, 0.8869534032294006, 2.33392767259385, 0.9985348074173154, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.315699147269751, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3800260880593912],
[0.9989128283834493, 2.001087171616549, 1, 2, 0.3329709427944832, 1.001088354845047, 0.9994567095167217, -0.004293508734248169, 0.7412237967037882, 0.7032202536171733, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.09248067955304, 0, 0, 0.1510920105988174, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.465474100887649, 1, 0, 0.4056015026237623, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.4056015026237623, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9914980189607051, 1.942994756516367, 4, 2, 0.3378771374891231, 4.034299538180447, 1.029338856058386, -7.907248414094243, 0.9810183833854557, 0.1046861217461822, 0.3800260880593912],
[0.5888207961335021, 2.411179203866495, 1, 1, 0.1962735987111676, 1.698309581737789, 0.4147348311549924, -3.377596409597535, 0.9614766744489676, 0.3540238718713027, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999836983346948, 0, 1, 0.3333514472790751, 0, 0.5000407574853374, 1.315806396447157, 0.6666485527209249, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5878879123832902, 2.411113967528988, 0, 3, 0.1960278572417855, 0, 1.244238157300597, 3.274086165121762, 0.5196644437713349, 1, 0.3800260880593912],
[0.8444771154680953, 2.155359817942601, 1, 1, 0.2815076733214155, 1.184164711728983, 0.4639596561443509, -1.895146354984127, 0.9207534298611633, 0.4837687765039942, 0.3800260880593912],
[0.6561371871095035, 2.343862812890495, 0, 1, 0.218712395703168, 0, 0.4266461306951586, 1.122675900683117, 0.781287604296832, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999099841909044, 2.000090015809095, 0, 1, 0.3333033280636349, 0, 0.4999774970605365, 1.315639933073224, 0.6666966719363652, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -5.262796589079003, 1, 0.1111111111111109, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.631398294539502, 0.4444444444444445, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.5, 3.947097441809252, 0.2962962962962963, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450189082572723, 2.154981091742728, 1, 0, 0.2816729694190908, 1.183405472029441, 0, -3.114011140846983, 1, 0.2816729694190907, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999836936042894, 0, 1, 0.3333514525356524, 0, 0.5000407693132792, 1.315806427571183, 0.6666485474643475, 1, 0.3800260880593912],
[0.9144171679128456, 2.08558283208715, 1, 1, 0.3048057226376156, 1.093592766070323, 0.4794822745060902, -1.615969300160937, 0.9070934714473611, 0.5167049167225921, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[1.845289984832031, 1.154710015167966, 0, 0, 0.6150966616106774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9995653454299996, 2.000434654569999, 0, 1, 0.3331884484766667, 0, 0.4998913599679435, 1.315413272074678, 0.6668115515233333, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6725825807794258, 1.482816694920643, 1, 1, 0.3120454703507184, 1.486806272682746, 0.6743921911760765, -2.137785028536525, 0.9026276244335989, 0.5267185651350359, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.466037927107451, 1, 0, 0.4055087673257945, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.4055087673257944, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9992907731825381, 2.000709226817461, 0, 1, 0.3330969243941795, 0, 0.499822756148681, 1.315232748101672, 0.6669030756058205, 1, 0.3800260880593912],
[0.9601490936616623, 1.971829173053857, 0, 1, 0.3274748331396219, 0, 0.5071433234001994, 1.334496076282379, 0.6725251668603781, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999836916968532, 0, 1, 0.3333514546552565, 0, 0.5000407740826476, 1.315806440121291, 0.6666485453447435, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450190470215189, 2.154688314863122, 1, 2, 0.2817004944411026, 1.18340527769729, 0.9282084959592176, -0.671524376237533, 0.806643274739244, 0.6293903678403873, 0.3800260880593912],
[0.8450189189293466, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2970169770425811, 1.18340545708375, 0, -3.114011101518919, 1, 0.2970169770425811, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 3, 0, 0.3333333333333333, 3.000000000000001, 0, -7.894194883618503, 1, 0.03703703703703698, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.792009374139903, 0, 0, 0.2729915790122753, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 2.154710015167968, 0, 0, 0.2817633282773439, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8081917144837334, 2.000519221792978, 1, 0, 0.2877447102317656, 1.23733018054855, 0, -3.255908526877707, 1, 0.2877447102317656, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9997880785023862, 2.00011698157433, 0, 1, 0.3332732398127355, 0, 0.4999707563169036, 1.315622195491924, 0.6667267601872644, 1, 0.3800260880593912],
[0.5891279328869659, 2.410800236597138, 0, 4, 0.1963806796708329, 0, 1.659200102637301, 4.366016320379557, 0.4170628219234493, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.482138919714024, 0, 1, 0.3122447223074578, 0, 0.6747005875757909, 1.775405975471735, 0.6877552776925422, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.631398294539502, 0.4444444444444445, 1, 0.3800260880593912],
[0.9995651783523855, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3332366922933248, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6667633077066752, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.998133772110337, 2.001629454136663, 0, 3, 0.3327375185404552, 0, 1.498778904257257, 3.943884252554328, 0.29709142622218, 1, 0.3800260880593912],
[0.9996735169235808, 2.000163176778665, 0, 2, 0.3332426458487761, 0, 0.9999184182667898, 2.631183620505865, 0.4445653693147407, 1, 0.3800260880593912],
[1.000275472259775, 1.844743092793289, 0, 1, 0.3515883813718167, 0, 0.542080902162811, 1.426430761453655, 0.6484116186281833, 1, 0.3800260880593912],
[1.00137651114104, 1.842720444555278, 0, 2, 0.3520894423572398, 0, 1.085351826376833, 2.855992944903329, 0.4197880907049524, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5886336939735874, 2.41136630602641, 0, 2, 0.1962112313245293, 0, 0.8294053022975661, 2.182495697947834, 0.6460763846488293, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998369377272301, 2.000090011072955, 1, 3, 0.3332870949164656, 1.000163088866411, 1.499932494733395, 1.3150923622614, 0.5926747942221843, 0.8024143290142376, 0.3800260880593912],
[0.8442474467514712, 2.155550058900441, 2, 2, 0.2814348119034123, 2.368973702787825, 0.927837417526834, -3.792203563234763, 0.9296557590086663, 0.3157242790790197, 0.3800260880593912],
[0.5893192848250619, 2.410680715174936, 1, 5, 0.1964397616083541, 1.696873029187985, 2.074102957113159, 0.9926421889915611, 0.6641090603784572, 0.7307779458292765, 0.3800260880593912],
[1.001715471525702, 1.841884278134526, 0, 2, 0.3522702066791903, 0, 1.085844547207719, 2.857289489657407, 0.4195538851554189, 1, 0.3800260880593912],
[0.8078583675470984, 2.000852310560042, 0, 2, 0.2876260534216127, 0, 0.9995740262509414, 2.630277387942709, 0.507476639763667, 1, 0.3800260880593912],
[0.5883863728370898, 2.411613627162908, 1, 0, 0.1961287909456968, 1.699563494610159, 0, -4.472228481178765, 1, 0.1961287909456968, 0.3800260880593912],
[1.003848291945189, 1.837650013281751, 0, 2, 0.3532813270022399, 0, 1.088346521668899, 2.863873180987539, 0.4182450420039838, 1, 0.3800260880593912],
[0.9992747395637328, 2.000725260436266, 1, 2, 0.3330915798545778, 1.000725786820734, 0.9996375012348733, -0.002863712834604639, 0.7410630202394122, 0.7033812488284112, 0.3800260880593912],
[1.000890929989771, 1.998619591288219, 0, 4, 0.3336847538588812, 0, 2.001381362133943, 5.266431503042399, 0.1971146950048611, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998368827129435, 2.000163117287055, 1, 1, 0.3332789609043146, 1.000163143898647, 0.4999592240038711, -1.316235741733085, 0.8889251342185402, 0.5554830560271696, 0.3800260880593912],
[0.8450189261921855, 2.154981073807814, 1, 0, 0.2816729753973952, 1.183405446912519, 0, -3.114011074754357, 1, 0.2816729753973952, 0.3800260880593912],
[0.5881870062895846, 2.411812993710413, 0, 4, 0.1960623354298617, 0, 1.658503379172142, 4.364182963441573, 0.4177240726304734, 1, 0.3800260880593912],
[0.5333592886286025, 2.434503472836081, 1, 2, 0.1797115741178618, 1.874908755355597, 0.8215227549747935, -2.771878124893833, 0.9147192701894136, 0.4480499826404128, 0.3800260880593912],
[1.010810334811165, 1.405197278336043, 1, 3, 0.418380442723206, 0.9893052787067271, 2.134931547513695, 3.014599009918307, 0.4437013687668672, 0.8855657557059844, 0.3800260880593912],
[0.9985505322372653, 2.001449467762733, 0, 2, 0.3328501774124219, 0, 0.9992757909774491, 2.62949261215267, 0.4450888857786369, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2.000000000000001, 5.262796589079003, 0.1975308641975309, 1, 0.3800260880593912],
[0.8087112504178171, 1.999999999999999, 0, 1, 0.2879296511157974, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.7120703488842026, 1, 0.3800260880593912],
[0.0006916426251948834, 2.999308357374803, 0, 1, 0.000230547541731628, 0, 0.3334102002353861, 0.8773350322814685, 0.9997694524582684, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.315699147269751, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411450209640494, 0, 1, 0.1960668112961045, 0, 0.4146882220508641, 1.091209880270261, 0.8039331887038955, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998368190637811, 2.000090076575687, 1, 1, 0.3332870612670896, 1.000163207568583, 0.4999774818702563, -1.316187865555579, 0.8889197347919474, 0.5554938573261263, 0.3800260880593912],
[0.998696857224651, 2.001303142775348, 0, 1, 0.3328989524082171, 0, 0.4996744264405789, 1.314842433560742, 0.6671010475917829, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.315699147269751, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.631398294539502, 0.4444444444444445, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -5.262796589079003, 1, 0.1111111111111109, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9605432410939679, 1.971362960698904, 0, 0, 0.3276173161701394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[1.845289984832031, 1.154710015167966, 0, 0, 0.6150966616106774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[1.845289984832031, 1.154710015167966, 0, 0, 0.6150966616106774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450186874751159, 2.154981312524884, 1, 0, 0.2816728958250386, 1.183405781223564, 0, -3.114011954459871, 1, 0.2816728958250386, 0.3800260880593912],
[0.8082763103424049, 2.000434555467139, 0, 1, 0.2877748365563568, 0, 0.4998913847328942, 1.315413337241127, 0.7122251634436432, 1, 0.3800260880593912],
[0.9605432410939679, 1.971362960698904, 0, 0, 0.3276173161701394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.844476903895776, 2.155359804846989, 1, 1, 0.2815076238765333, 1.184165008405509, 0.4639596589632935, -1.895147128240472, 0.9207534576993882, 0.4837687054524549, 0.3800260880593912],
[0.3729737665406538, 1.782628422164028, 1, 1, 0.1730253237332147, 2.681153715648795, 0.5609694020170769, -5.579049386999903, 0.9700622373470162, 0.3161128848134458, 0.3800260880593912],
[1.000023815384314, 1.999976184615685, 1, 2, 0.3333412717947715, 0.9999761851828448, 1.000011907833952, 9.40005232010421e-05, 0.7407301560624717, 0.7037142881929167, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.09248067955304, 0, 0, 0.1510920105988174, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8453970336360188, 2.15440086054508, 1, 2, 0.2818179968976876, 1.182876163758276, 0.9283323436354294, -0.6698061741568276, 0.8065006002211359, 0.6295722157404933, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.001729630934904371, 2.998270369065093, 0, 3, 0.0005765436449681243, 0, 1.000576876239299, 2.632916285691752, 0.9982713660811745, 1, 0.3800260880593912],
[0.9995658675079985, 2.000434132492, 0, 2, 0.3331886225026663, 0, 0.9997829808615295, 2.630827230748647, 0.4446374131598916, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9991829963762372, 2.000450989499496, 0, 1, 0.3331016387602799, 0, 0.4998872780433353, 1.315402530905226, 0.6668983612397201, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998369360428944, 2.000090012002715, 0, 1, 0.3332870944388387, 0, 0.4999774980120457, 1.315639935577023, 0.6667129055611614, 1, 0.3800260880593912],
[0.6733178293445944, 1.481392185823373, 0, 1, 0.3124865177238743, 0, 0.6750406877866647, 1.776300914586601, 0.6875134822761257, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.315699147269751, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3800260880593912],
[0.999746958591511, 2.000253041408488, 0, 3, 0.3332489861971705, 0, 1.49981024295183, 3.946598115436318, 0.2964087733739924, 1, 0.3800260880593912],
[0.9996376297683548, 2.000362370231644, 0, 2, 0.3332125432561184, 0, 0.9998188477062774, 2.630921610702747, 0.4446055124709738, 1, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.436080824889973, 0, 0, 0.1326070280488632, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 2, 0.3333333333333333, 1, 1, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.3800260880593912],
[0.3740406740954156, 2.09143224688284, 1, 1, 0.1517115320605521, 2.67350603625772, 0.4781412362224227, -5.776879190704933, 0.97698361103984, 0.2804066751609443, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.998697191247686, 2.001302808752313, 0, 3, 0.3328990637492287, 0, 1.499023529512914, 3.944527959034864, 0.2968756996704781, 1, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.436080824889973, 0, 0, 0.1326070280488632, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.436080824889973, 0, 0, 0.1326070280488632, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[1.069309424180954, 1.930690575819045, 0, 0, 0.3564364747269849, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9995650803567643, 2.000434919643235, 1, 1, 0.3331883601189215, 1.000435108880635, 0.4998912937284378, -1.317130141533787, 0.8889855166812639, 0.5553622369191069, 0.3800260880593912],
[0.9992731346656362, 2.000726865334362, 0, 1, 0.3330910448885456, 0, 0.4998183496840683, 1.315221152938205, 0.6669089551114544, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.8439346262245655, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2967489542278692, 1.184925904123179, 0, -3.118012003265408, 1, 0.2967489542278692, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9992894430597387, 2.00071055694026, 0, 1, 0.333096481019913, 0, 0.4998224238539165, 1.315231873701795, 0.666903518980087, 1, 0.3800260880593912],
[0.9964477414148681, 2.003552258585131, 0, 1, 0.3321492471382895, 0, 0.4991135098747963, 1.313366438666163, 0.6678507528617105, 1, 0.3800260880593912],
[0.6761724536103295, 1.48767562527399, 0, 1, 0.3124861029795419, 0, 0.6721895438838198, 1.776299843029008, 0.6875138970204582, 1, 0.378421214482336],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.8447475233255676, 2.155252476674433, 2, 0, 0.2815825077751892, 2.367571309503793, 0, -6.230023106028933, 1, 0.07928870868496452, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8085088347098194, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2878783305637549, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[1.000891976415399, 1.998944961364449, 0, 2, 0.3336487939761651, 0, 1.00052779774128, 2.632787140615766, 0.4440239297694191, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.792009374139903, 0, 0, 0.2729915790122753, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.672264860818045, 1.482445154349922, 1, 0, 0.3119978354793324, 1.487508954109472, 0, -3.914228524955901, 1, 0.3119978354793324, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.464908689372888, 0, 0, 0.4056945412669284, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999435502064747, 1, 0, 0.3333960671305055, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333960671305054, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 2.154710015167968, 0, 1, 0.2817633282773439, 0, 0.4640995739382805, 1.2212308273577, 0.718236671722656, 1, 0.3800260880593912],
[0.3738358378691723, 1.785329220832172, 1, 1, 0.1731390735333686, 2.674970932963255, 0.5601207823921029, -5.565013079419534, 0.9700228612160067, 0.3163010082827441, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.792009374139903, 0, 0, 0.2729915790122753, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[1.84159557648019, 1.155800051626408, 2, 0, 0.6143985662791847, 1.086014771941713, 0, -2.857737418732127, 1, 0.3774855982459175, 0.3800260880593912],
[0.9138725183532802, 2.086127481646715, 1, 1, 0.3046241727844272, 1.094244525266953, 0.4793570904931636, -1.618013747197518, 0.9072041133554033, 0.5164524589242578, 0.3800260880593912],
[0.8085088347098194, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2878783305637549, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.464908689372888, 0, 0, 0.4056945412669284, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450188625520949, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2970169631121811, 1.183405536037192, 0, -3.11401130927687, 1, 0.2970169631121811, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411450264639042, 0, 1, 0.1960668077011205, 0, 0.4146882125929663, 1.091209855382765, 0.8039331922988795, 1, 0.3800260880593912],
[0, 2.255143980360307, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -5.262796589079003, 1, 0.1111111111111109, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6562090294812474, 2.343790970518751, 0, 0, 0.218736343160416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5883863728370898, 2.411613627162908, 1, 0, 0.1961287909456968, 1.699563494610159, 0, -4.472228481178765, 1, 0.1961287909456968, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.631398294539502, 1, 0.3333333333333333, 0.3800260880593912],
[0.8444758798238458, 2.155524120176154, 1, 1, 0.2814919599412819, 1.184166444408804, 0.4639242913775782, -1.895243973141826, 0.9207622764884157, 0.4837461963709796, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.845289984832031, 0, 0, 0.3514580254845391, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -5.262796589079003, 1, 0.1111111111111109, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 2.154710015167968, 0, 0, 0.2817633282773439, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8447474994119714, 2.155252500588029, 2, 0, 0.2815824998039904, 2.367571376526358, 0, -6.230023282391997, 1, 0.07928870419586431, 0.3800260880593912],
[0.9996549099365625, 1.465253779436326, 0, 1, 0.4055545401119465, 0, 0.682475632572464, 1.795865215615948, 0.5944454598880535, 1, 0.3800260880593912],
[0, 2.999999999999997, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.930746561085163, 3, 0, 0.3412099883620546, 3.000000000000001, 0, -7.894194883618503, 1, 0.03972511908874343, 0.3800260880593912],
[0.9998366364568184, 2.000163363543181, 1, 1, 0.3332788788189396, 1.000163390235189, 0.4999591624498883, -1.316236551915689, 0.8889251889331906, 0.5554829465710698, 0.3800260880593912],
[0.6562090294812474, 2.343790970518751, 0, 0, 0.218736343160416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998368827129432, 2.000163117287056, 0, 2, 0.3332789609043145, 0, 0.999918448007742, 2.631183698766157, 0.4445169439728305, 1, 0.3800260880593912],
[0.002781478222554617, 2.997218521777443, 0, 3, 0.0009271594075182063, 0, 1.000928019829835, 2.633840284337026, 0.9972210998541372, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.792009374139903, 0, 0, 0.2729915790122753, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9964452346259215, 2.003554765374077, 0, 1, 0.3321484115419741, 0, 0.4991128853986147, 1.313364795420604, 0.6678515884580259, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998751999979362, 1.930965411895639, 2, 3, 0.3411564572772624, 2.000249631158097, 1.553627000006636, -1.175242029914698, 0.7783992552240615, 0.5544549691561804, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.465473454721734, 0, 1, 0.4056016089262113, 0, 0.6823733290958052, 1.795596014421943, 0.5943983910737887, 1, 0.3800260880593912],
[0.9989446094789008, 2.001055390521098, 2, 1, 0.332981536492967, 2.002113011094078, 0.4997362915274366, -3.95335153762351, 0.9630801048589404, 0.2587903206535318, 0.3800260880593912],
[0.002034983755918313, 2.264119208526754, 0, 2, 0.0008979899791675237, 0, 0.883345714513586, 2.334305087354354, 0.9982048264276675, 1, 0.3784191360841994],
[0.9601507057830124, 1.971827266176304, 0, 1, 0.3274754159020453, 0, 0.5071438138388072, 1.334497366821695, 0.6725245840979548, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998196039356487, 2.00018039606435, 1, 1, 0.333273201311883, 1.000180428612963, 0.4999549050513881, -1.316292589585057, 0.8889289732873289, 0.5554753759110953, 0.3800260880593912],
[0.8444771693471416, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2968830892536094, 1.184164636177307, 0, -3.116008804090954, 1, 0.2968830892536094, 0.3800260880593912],
[0.9964543886223257, 2.003382385912647, 0, 3, 0.3321695357164203, 0, 1.497467493522631, 3.940433408583791, 0.2978507368782431, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9134362100940939, 2.086563789905902, 2, 1, 0.3044787366980318, 2.189534395394702, 0.4792568551403345, -4.500421402614554, 0.9717725980780139, 0.2216670994597152, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9601501597063462, 1.971827912096251, 0, 1, 0.3274752185019038, 0, 0.5071436477115792, 1.334496929674791, 0.6725247814980961, 1, 0.3800260880593912],
[0.5885495467451265, 2.411450453254871, 0, 2, 0.1961831822483756, 0, 0.8293763603148, 2.182419540063743, 0.6461214765003481, 1, 0.3800260880593912],
[0.8442053389433763, 2.155794661056624, 2, 0, 0.2814017796477921, 2.36909186395722, 0, -6.234024290424434, 1, 0.07918696158894456, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5885497903595243, 2.411450209640473, 0, 1, 0.1961832634531749, 0, 0.4146882220508677, 1.091209880270271, 0.8038167365468251, 1, 0.3800260880593912],
[1.000891032069988, 1.998293666832657, 0, 2, 0.3337210383996018, 0, 1.000853895098435, 2.633645232645239, 0.4439276546713048, 1, 0.3800260880593912],
[0.588386541040377, 2.411613458959621, 1, 0, 0.1961288470134592, 1.699563008752399, 0, -4.472227202693484, 1, 0.1961288470134592, 0.3800260880593912],
[0.845018908257826, 2.154981091742174, 1, 0, 0.2816729694192753, 1.183405472028665, 0, -3.114011140844942, 1, 0.2816729694192753, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.410145723235182, 0, 3, 0.1961521162424548, 0, 1.244738013589089, 3.275401486106815, 0.5194235286896474, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9998369360428794, 2.00016306395712, 0, 1, 0.3332789786809599, 0, 0.4999592373341809, 1.315591884460433, 0.6667210213190401, 1, 0.3800260880593912],
[0.6565714258995059, 2.343428574100492, 0, 1, 0.2188571419665021, 0, 0.4267251884917563, 1.122883933234254, 0.7811428580334978, 1, 0.3800260880593912],
[0.9605432410939679, 1.971362960698904, 0, 0, 0.3276173161701394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[1.84261831561157, 1.157381684388427, 1, 0, 0.6142061052038574, 0.5427059915379693, 0, -1.428075620569381, 1, 0.6142061052038574, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.436080824889973, 0, 0, 0.1326070280488632, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411884768725875, 0, 0, 0.1960384104247077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6562090294812474, 2.343790970518751, 0, 0, 0.218736343160416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450189261918918, 2.154981073808108, 1, 0, 0.2816729753972972, 1.18340544691293, 0, -3.114011074755439, 1, 0.2816729753972973, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999836934316425, 0, 1, 0.3333514527275032, 0, 0.500040769744967, 1.315806428707125, 0.6666485472724968, 1, 0.3800260880593912],
[0.843120222852912, 1.999999999999999, 5, 0, 0.2965475100475661, 5.930352356015405, 0, -15.60511907563724, 0.9999999999999999, 0.002293355647670525, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8455081255788597, 2.15449187442114, 1, 2, 0.2818360418596199, 1.182720744777433, 0.9282931273701609, -0.6695003985292433, 0.8064786863597627, 0.6296001370220952, 0.3800260880593912],
[1.000891130146474, 1.999108869853525, 0, 1, 0.3336303767154915, 0, 0.5002228818449843, 1.316285638176526, 0.6663696232845085, 1, 0.3800260880593912],
[1.00214239041653, 2.003726965302462, 0, 1, 0.3333951918135915, 0, 0.4990699917286636, 1.316065423429452, 0.6666048081864084, 1, 0.3792136643390936],
[1.000720092858594, 2.005707078390998, 0, 2, 0.332860247681521, 0, 0.9971545803210825, 2.629532303533832, 0.4450754491235615, 1, 0.3792136643390936],
[0.3755638047263897, 2.094625681400231, 1, 0, 0.1520384597358531, 2.662663407429616, 0, -7.021538667574641, 1, 0.1520384597358531, 0.3792136643390936],
[1.00214239041653, 2.004284780833061, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.498931094803983, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3792136643390936],
[0.6743409282772271, 2.140184828844815, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3792136643390936],
[0.3734536724140706, 2.441274308868665, 0, 1, 0.1326784239533794, 0, 0.4096221372449619, 1.080188230977555, 0.8673215760466206, 1, 0.3792136643390936],
[0.8452899848320317, 2.154710015167968, 0, 1, 0.2817633282773439, 0, 0.4640995739382805, 1.2212308273577, 0.718236671722656, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.3727764768548347, 2.43674168733928, 0, 4, 0.1326834193868835, 0, 1.641536327294367, 4.319535892067033, 0.5658620853819502, 1, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.436080824889973, 0, 0, 0.1326070280488632, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.436080824889973, 0, 0, 0.1326070280488632, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.5889837646557624, 2.4097136041379, 0, 5, 0.1964132062091691, 0, 2.074935374649554, 5.459981406132516, 0.3350919189298235, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.792406381333852, 0, 3, 0.2729476170724208, 0, 1.673727582785939, 4.404243906866641, 0.3843236466737363, 1, 0.3800260880593912],
[0.9970049093690382, 2.002995090630961, 1, 2, 0.3323349697896795, 1.003004088147226, 0.9985046939730554, -0.01183969815637395, 0.7420708934123166, 0.702370557857536, 0.3800260880593912],
[0.6723856430410478, 1.488618941022916, 1, 2, 0.3111449406444877, 1.487241749358637, 1.34352717467486, -0.3781702867233614, 0.7698110917650942, 0.6731236066830176, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 5, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 2.500000000000001, 1.31569914726975, 0.5706447187928672, 0.736625514403292, 0.3800260880593912],
[1.254212174545941, 1.336959736639666, 1, 2, 0.4840327919316122, 0.7973132618984718, 1.49593136217163, 1.838342477593214, 0.5239426703678293, 0.8626380954810842, 0.3800260880593912],
[1.000890982923419, 1.998962797804475, 3, 3, 0.3336465894949585, 2.99732943066142, 1.500778305276614, -3.938022079028746, 0.8995531462106114, 0.3202348349609205, 0.3800260880593912],
[0.3729723790680503, 1.78262871359778, 1, 1, 0.1730247680505652, 2.681163689650987, 0.5609693103067749, -5.579075873898593, 0.9700624296410482, 0.3161119657421785, 0.3800260880593912],
[0.8080014280768681, 2.00070923929289, 0, 1, 0.2876769891124201, 0, 0.4998227530320345, 1.315232739900533, 0.71232301088758, 1, 0.3800260880593912],
[0.3726553419439261, 1.7829456002174, 0, 1, 0.1728777041497677, 0, 0.5608696080677206, 1.475871330128438, 0.8271222958502323, 1, 0.3800260880593912],
[0.372428009819845, 2.436080824889973, 0, 0, 0.1326070280488632, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.3752303261608253, 1.782756761537227, 1.5, 2.5, 0.1738797828309007, 3.997544695673382, 1.402322545586259, -6.82906313969039, 0.919811688282555, 0.3381594463196688, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9996376417521151, 2.000362358247884, 1, 1, 0.3332125472507051, 1.000362489598981, 0.4999094268479934, -1.316891335820018, 0.8889693983546967, 0.5553944928561069, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 3, 0, 0.3333333333333333, 3.000000000000001, 0, -7.894194883618503, 1, 0.03703703703703698, 0.3800260880593912],
[1.000303898638345, 2.006059480997004, 0, 1, 0.3327288728349516, 0, 0.4984897055510059, 1.314507295667152, 0.6672711271650484, 1, 0.3792217108220819],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9994924986335502, 2.000507501366449, 1, 1, 0.3331641662111836, 1.000507759054864, 0.4998731568449251, -1.317369038442695, 0.889001638352807, 0.5553299707751739, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.631398294539502, 0.4444444444444445, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999510727129661, 1, 3, 0.3333877058532594, 1, 1.500367044445199, 1.316664987396865, 0.592495930335589, 0.8025335694243396, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411290471639871, 0, 1, 0.1960772531380982, 0, 0.4147156934269806, 1.091282168402523, 0.8039227468619018, 1, 0.3800260880593912],
[0.9608600406503779, 1.970683687838069, 1, 0, 0.3277658904804444, 1.040734298122263, 0, -2.738586457147687, 1, 0.3277658904804444, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.411450643241582, 0, 1, 0.1960667829537422, 0, 0.4146881474860934, 1.091209684060651, 0.8039332170462579, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881152312741225, 2.410860522519745, 0, 2, 0.1961053638163379, 0, 0.8295793063589062, 2.182953571938087, 0.6462465860848624, 1, 0.3800260880593912],
[0.8450189261918919, 2.154981073808108, 1, 0, 0.2816729753972973, 1.18340544691293, 0, -3.114011074755439, 1, 0.2816729753972973, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.315699147269751, 0.6666666666666667, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 2.135609519476836, 0, 0, 0.2395930918631088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9605432410939679, 1.971362960698904, 0, 0, 0.3276173161701394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.6728993152329819, 1.481810699934985, 0, 0, 0.3122922855029878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0, 2.999999999999997, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.8452899848320317, 2.154710015167968, 0, 0, 0.2817633282773439, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3800260880593912],
[0.5881870014405639, 2.411812998559434, 0, 1, 0.1960623338135215, 0, 0.4146258439594181, 1.091045738666814, 0.8039376661864786, 1, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.315699147269751, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3800260880593912],
[0.8450188735283808, 2.154981126471619, 1, 0, 0.2816729578427936, 1.183405520665467, 0, -3.11401126882774, 1, 0.2816729578427937, 0.3800260880593912],
[1.000275122112299, 1.844743787937211, 0, 1, 0.3515882156631754, 0, 0.5420806978936616, 1.426430223940163, 0.6484117843368246, 1, 0.3800260880593912],
[0.9989133179438398, 2.001086682056159, 0, 1, 0.33297110598128, 0, 0.4997284770155377, 1.314984662151508, 0.6670288940187199, 1, 0.3800260880593912],
[0.373200158489395, 1.783293796112519, 1, 2, 0.1730587547871365, 2.679527265067913, 1.121520191658766, -4.099737155849308, 0.9205179905904339, 0.4345112607439151, 0.3800260880593912],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.315699147269751, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.3800260880593912]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node1009":{
"Global MG94xREV":0.0008011322715902148,
"Nucleotide GTR":0.0007957781996276107,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "I", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ATT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1015":{
"Global MG94xREV":0.0008012922492268404,
"Nucleotide GTR":0.0007959371081127245,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "R", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AGG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node102":{
"Global MG94xREV":0.0008011456224256176,
"Nucleotide GTR":0.0007957914612376312,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "Y", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "TAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1037":{
"Global MG94xREV":0.0008009978713033132,
"Nucleotide GTR":0.0007956446975554387,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGT", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node105":{
"Global MG94xREV":0.000801789639314291,
"Nucleotide GTR":0.0007964311740770366,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAA", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1064":{
"Global MG94xREV":0.0008009978630906727,
"Nucleotide GTR":0.0007956446893976856,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACT", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node109":{
"Global MG94xREV":0.0008009507817403255,
"Nucleotide GTR":0.0007955979226981723,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "L", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TTA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1092":{
"Global MG94xREV":0.000801144528127141,
"Nucleotide GTR":0.0007957903742524946,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "TTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1098":{
"Global MG94xREV":0.0008012286588971387,
"Nucleotide GTR":0.0007958739427655309,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "S", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "TCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1103":{
"Global MG94xREV":0.0008011322555693206,
"Nucleotide GTR":0.0007957781837137868,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "V", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GTT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node117":{
"Global MG94xREV":0.0008012392536320255,
"Nucleotide GTR":0.0007958844666944159,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "I", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ATT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node131":{
"Global MG94xREV":0.0008016150575245579,
"Nucleotide GTR":0.0007962577590402836,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node135":{
"Global MG94xREV":0.0008012694832138447,
"Nucleotide GTR":0.0007959144942479771,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACT", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node138":{
"Global MG94xREV":0.0008011458156545905,
"Nucleotide GTR":0.0007957916531752289,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATT", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node153":{
"Global MG94xREV":0.0008012421618078996,
"Nucleotide GTR":0.0007958873554345697,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node158":{
"Global MG94xREV":0.0008016722932753683,
"Nucleotide GTR":0.0007963146122770701,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "S", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "AGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node161":{
"Global MG94xREV":0.0005160949483720118,
"Nucleotide GTR":0.0005126458181957476,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "Y", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "TAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node162":{
"Global MG94xREV":0.0002848200267851741,
"Nucleotide GTR":0.0002829165372193733,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "Y", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "TAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node167":{
"Global MG94xREV":0.0008010873245442359,
"Nucleotide GTR":0.0007957335529686302,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "L", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CTT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node17":{
"Global MG94xREV":0.000801220199286358,
"Nucleotide GTR":0.0007958655396914384,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "L", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CTA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node179":{
"Global MG94xREV":0.000801240973441648,
"Nucleotide GTR":0.0007958861750103246,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node180":{
"Global MG94xREV":0.0008006384337671376,
"Nucleotide GTR":0.0007952876621874239,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node190":{
"Global MG94xREV":0.0008001313986758946,
"Nucleotide GTR":0.0007947840156781454,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node202":{
"Global MG94xREV":0.0008012725822011259,
"Nucleotide GTR":0.0007959175725243218,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAT", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node207":{
"Global MG94xREV":0.0008009481645295962,
"Nucleotide GTR":0.0007955953229786048,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node21":{
"Global MG94xREV":0.0008012719385754621,
"Nucleotide GTR":0.0007959169332000914,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "V", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GTC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node219":{
"Global MG94xREV":0.0005614172047390333,
"Nucleotide GTR":0.0005576651799838075,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "C", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "TGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node220":{
"Global MG94xREV":0.0002394966857774792,
"Nucleotide GTR":0.0002378960980394361,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "C", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "TGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node227":{
"Global MG94xREV":0.0008013910785092792,
"Nucleotide GTR":0.0007960352769061162,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node230":{
"Global MG94xREV":0.0005701694059007489,
"Nucleotide GTR":0.0005663588890381485,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node231":{
"Global MG94xREV":0.001034695944462386,
"Nucleotide GTR":0.00102778093586453,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node331":{
"Global MG94xREV":0.000801978936059365,
"Nucleotide GTR":0.0007966192057271552,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "G", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "GGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node334":{
"Global MG94xREV":0.0008025871575078537,
"Nucleotide GTR":0.0007972233623519934,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "I", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "ATA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node349":{
"Global MG94xREV":0.0008026059490098769,
"Nucleotide GTR":0.0007972420282679457,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "N", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "AAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node358":{
"Global MG94xREV":0.0008020235998907455,
"Nucleotide GTR":0.0007966635710642968,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "V", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GTG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node363":{
"Global MG94xREV":0.0008021175552451174,
"Nucleotide GTR":0.0007967568985027221,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "Y", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "TAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node376":{
"Global MG94xREV":0.000801990875325574,
"Nucleotide GTR":0.0007966310652016828,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATT", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node388":{
"Global MG94xREV":0.0008025409756664691,
"Nucleotide GTR":0.000797177489149907,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "C", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TGC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node416":{
"Global MG94xREV":0.0008012628583396333,
"Nucleotide GTR":0.0007959079136486695,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "M", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ATG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node420":{
"Global MG94xREV":0.0005205095765841009,
"Nucleotide GTR":0.0005170309428689414,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "T", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "ACC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node421":{
"Global MG94xREV":0.0002808385492511395,
"Nucleotide GTR":0.0002789616684214864,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "T", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "ACC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node425":{
"Global MG94xREV":0.000109816439429199,
"Nucleotide GTR":0.000109082521772613,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node426":{
"Global MG94xREV":0.0004413268028073066,
"Nucleotide GTR":0.0004383773579465144,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "I", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "ATT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node427":{
"Global MG94xREV":0.0002497376123367197,
"Nucleotide GTR":0.000248068583144367,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "I", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "ATT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node432":{
"Global MG94xREV":0.0008012919456393386,
"Nucleotide GTR":0.0007959368065541376,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "F", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTT", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node438":{
"Global MG94xREV":0.0008012718937674013,
"Nucleotide GTR":0.0007959168886914889,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "V", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node445":{
"Global MG94xREV":9.36059201597001e-05,
"Nucleotide GTR":9.298033952784518e-05,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node446":{
"Global MG94xREV":0.0004235820453848136,
"Nucleotide GTR":0.0004207511910633968,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node447":{
"Global MG94xREV":0.0002836481469832823,
"Nucleotide GTR":0.0002817524892437765,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node454":{
"Global MG94xREV":0.0005240139929492306,
"Nucleotide GTR":0.000520511938760235,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "Y", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "TAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node455":{
"Global MG94xREV":0.0002769258750462081,
"Nucleotide GTR":0.000275075143131038,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "Y", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "TAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node477":{
"Global MG94xREV":0.0008011816961499019,
"Nucleotide GTR":0.0007958272938764887,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "L", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CTA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node486":{
"Global MG94xREV":0.0008014877642217119,
"Nucleotide GTR":0.0007961313164552624,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCC", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node495":{
"Global MG94xREV":0.0008011867416614239,
"Nucleotide GTR":0.0007958323056681962,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "S", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "TCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node500":{
"Global MG94xREV":0.0008013081282813574,
"Nucleotide GTR":0.0007959528810454399,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCG", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node508":{
"Global MG94xREV":0.0008010281789144936,
"Nucleotide GTR":0.0007956748026168827,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAT", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node531":{
"Global MG94xREV":0.0008020667182370476,
"Nucleotide GTR":0.0007967064012450403,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node557":{
"Global MG94xREV":0.0008037251728200981,
"Nucleotide GTR":0.000798353772158765,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "K", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAG", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node560":{
"Global MG94xREV":0.0008011322004400321,
"Nucleotide GTR":0.0007957781289529336,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAT", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node563":{
"Global MG94xREV":0.0008012805083035709,
"Nucleotide GTR":0.0007959254456555853,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAT", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node564":{
"Global MG94xREV":0.0008011786970035262,
"Nucleotide GTR":0.0007958243147738004,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAT", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node569":{
"Global MG94xREV":0.0005136687581841214,
"Nucleotide GTR":0.0005102358425548447,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAA", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node570":{
"Global MG94xREV":0.0002875143792751028,
"Nucleotide GTR":0.0002855928829985054,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAA", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node571":{
"Global MG94xREV":0.0008022581813154271,
"Nucleotide GTR":0.0007968965847505751,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAA", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node577":{
"Global MG94xREV":0.0008013546405831769,
"Nucleotide GTR":0.0007959990824994508,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "S", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "TCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node583":{
"Global MG94xREV":0.000533349836882154,
"Nucleotide GTR":0.0005297853900246556,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCT", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node584":{
"Global MG94xREV":0.0002680045104941336,
"Nucleotide GTR":0.0002662134012274455,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCT", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node590":{
"Global MG94xREV":0.0008010968095047196,
"Nucleotide GTR":0.0007957429745398795,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "I", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ATT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node598":{
"Global MG94xREV":0.0008012746889566341,
"Nucleotide GTR":0.0007959196652001055,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "I", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ATA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node601":{
"Global MG94xREV":0.0008013468587779368,
"Nucleotide GTR":0.0007959913527010347,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "I", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ATA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node607":{
"Global MG94xREV":0.0004922449789028478,
"Nucleotide GTR":0.0004889552411981795,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "S", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "TCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node612":{
"Global MG94xREV":0.0008010020242469775,
"Nucleotide GTR":0.0007956488227444375,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "I", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ATA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node619":{
"Global MG94xREV":0.0008012344006236551,
"Nucleotide GTR":0.0007958796461193354,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "C", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "TGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node622":{
"Global MG94xREV":0.0005052167419452567,
"Nucleotide GTR":0.0005018403122481757,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "Y", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "TAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node63":{
"Global MG94xREV":0.0008011973512167674,
"Nucleotide GTR":0.0007958428443184897,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node640":{
"Global MG94xREV":0.0008012401274361336,
"Nucleotide GTR":0.0007958853346587758,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAT", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node645":{
"Global MG94xREV":0.0008012690435496776,
"Nucleotide GTR":0.0007959140575221438,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "I", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ATA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node648":{
"Global MG94xREV":0.0008013588617292975,
"Nucleotide GTR":0.0007960032754350978,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTT", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node651":{
"Global MG94xREV":0.0008011461420121513,
"Nucleotide GTR":0.0007957919773516997,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "I", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ATT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node656":{
"Global MG94xREV":0.0005607134716240975,
"Nucleotide GTR":0.0005569661500095057,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "C", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "TGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node659":{
"Global MG94xREV":0.0008010728594848014,
"Nucleotide GTR":0.0007957191845810836,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node665":{
"Global MG94xREV":0.0008010601477948302,
"Nucleotide GTR":0.0007957065578450036,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "I", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ATT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node665_1":{
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node670":{
"Global MG94xREV":0.0008009406387558892,
"Nucleotide GTR":0.0007955878475006327,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGT", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node676":{
"Global MG94xREV":0.0008011414685222054,
"Nucleotide GTR":0.0007957873350953001,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "I", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "ATA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node681":{
"Global MG94xREV":0.0008011322492897078,
"Nucleotide GTR":0.0007957781774761419,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "V", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GTT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node69":{
"Global MG94xREV":0.0008011015157415449,
"Nucleotide GTR":0.0007957476493243086,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "I", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "ATT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node696":{
"Global MG94xREV":0.000498058929338544,
"Nucleotide GTR":0.0004947303362411726,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCA", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node708":{
"Global MG94xREV":0.0008012708161407425,
"Nucleotide GTR":0.0007959158182667507,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "L", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CTC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node717":{
"Global MG94xREV":0.0008023776662465779,
"Nucleotide GTR":0.000797015271148271,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "Y", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TAT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node722":{
"Global MG94xREV":0.0008012719326394658,
"Nucleotide GTR":0.0007959169273037668,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "S", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "TCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node737":{
"Global MG94xREV":0.0008013134838011121,
"Nucleotide GTR":0.0007959582007735526,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node746":{
"Global MG94xREV":0.0008013851843114901,
"Nucleotide GTR":0.0007960294221000236,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCT", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node758":{
"Global MG94xREV":0.0008012700607824072,
"Nucleotide GTR":0.0007959150679565728,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAT", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node761":{
"Global MG94xREV":0.0008011320290364292,
"Nucleotide GTR":0.0007957779586948439,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAT", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node767":{
"Global MG94xREV":0.0008011868856816384,
"Nucleotide GTR":0.0007958324487259041,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node775":{
"Global MG94xREV":0.0008007521274371186,
"Nucleotide GTR":0.0007954005960277094,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node778":{
"Global MG94xREV":0.0008012662946527473,
"Nucleotide GTR":0.0007959113269964521,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGT", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node788":{
"Global MG94xREV":0.0008008606408615198,
"Nucleotide GTR":0.000795508384242674,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "S", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "TCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node795":{
"Global MG94xREV":0.0005132325528939651,
"Nucleotide GTR":0.0005098025524818099,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "Y", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "TAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node799":{
"Global MG94xREV":0.0008015198166094255,
"Nucleotide GTR":0.0007961631546326681,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "I", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATA", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node813":{
"Global MG94xREV":0.0008011015157415449,
"Nucleotide GTR":0.0007957476493243086,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "S", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "TCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node836":{
"Global MG94xREV":0.0008011015157415449,
"Nucleotide GTR":0.0007957476493243086,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "I", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "ATA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node841":{
"Global MG94xREV":0.0008008954717577675,
"Nucleotide GTR":0.0007955429823594779,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "V", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GTA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node85":{
"Global MG94xREV":0.0008012214440001323,
"Nucleotide GTR":0.0007958667760866268,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "C", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "TGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node89":{
"Global MG94xREV":0.0008012742531701126,
"Nucleotide GTR":0.0007959192323260028,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "I", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ATT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node903":{
"Global MG94xREV":0.0008012206036258942,
"Nucleotide GTR":0.0007958659413287198,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "H", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAT", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node94":{
"Global MG94xREV":0.0004920118775685178,
"Nucleotide GTR":0.0004887236977106161,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node95":{
"Global MG94xREV":0.0003092860789062445,
"Nucleotide GTR":0.0003072190795077444,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node972":{
"Global MG94xREV":0.0008017330020377147,
"Nucleotide GTR":0.000796374915314802,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "E", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GAG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node990":{
"Global MG94xREV":0.0008011320040378994,
"Nucleotide GTR":0.000795777933863383,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAT", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "SL", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TYA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008005427385384396,
"Nucleotide GTR":0.000795192606502482,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCT", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801126910215584,
"Nucleotide GTR":0.0007957728740837481,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "I", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ATC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008034130402483123,
"Nucleotide GTR":0.0007980437256098621,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "C", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGC", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801329571112626,
"Nucleotide GTR":0.0007959741805714564,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCC", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021379031931388,
"Nucleotide GTR":0.0007967771104627408,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCT", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018931594229923,
"Nucleotide GTR":0.0007965340023472845,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "V", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GTT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008019445090921071,
"Nucleotide GTR":0.0007965850088398307,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "K", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "AAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413607_USA_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011324593260641,
"Nucleotide GTR":0.0007957783861087962,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "S", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "TCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413607_USA_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011322088229282,
"Nucleotide GTR":0.0007957781372798055,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGT", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011850512790273,
"Nucleotide GTR":0.0007958306265828457,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "G", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "GGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020308151471478,
"Nucleotide GTR":0.0007966707381001956,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTT", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017503065990061,
"Nucleotide GTR":0.0007963921042274426,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "S", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "TCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414485_USA_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "RC", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "S", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "YGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "AGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414485_USA_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012696964419496,
"Nucleotide GTR":0.0007959147060510508,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "S", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "TCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000308729665403698,
"Nucleotide GTR":0.0003066663845895558,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "S", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "TCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008010988504091949,
"Nucleotide GTR":0.0007957450018047242,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "Y", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "TAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414617_USA_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003032884905557533,
"Nucleotide GTR":0.0003012615738262076,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCA", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414617_USA_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008025446743856672,
"Nucleotide GTR":0.0007971811631500805,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "H", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CAT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415137_England_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "YTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415137_England_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "V", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GTC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000800936846129232,
"Nucleotide GTR":0.0007955840802205947,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "N", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAT", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008022016501878648,
"Nucleotide GTR":0.0007968404314279458,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "F", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTT", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021187466650884,
"Nucleotide GTR":0.0007967580819602776,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "H", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAT", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008015849162701247,
"Nucleotide GTR":0.0007962278192238035,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "A", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "GCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000804661049638999,
"Nucleotide GTR":0.0007992833943902339,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "EDAGV", "MLV", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAA", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GNN", "NTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 17, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010617635202669,
"Nucleotide GTR":0.0007957081627723345,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "P", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "CCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013002459843527,
"Nucleotide GTR":0.0007959450514268599,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "L", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CTC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022835938996178,
"Nucleotide GTR":0.0007969218274991343,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "Y", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TAC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011850511938529,
"Nucleotide GTR":0.0007958306264982411,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "V", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "GTT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "V", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GTT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013550309283202,
"Nucleotide GTR":0.0007959994702358658,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "D", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GAC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018931593844875,
"Nucleotide GTR":0.0007965340023090364,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "Y", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "TAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008010872153238775,
"Nucleotide GTR":0.0007957334444782062,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "S", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "TCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801329571112626,
"Nucleotide GTR":0.0007959741805714564,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "P", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "CCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008018931594237634,
"Nucleotide GTR":0.0007965340023480506,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "F", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "TTT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000801329571112626,
"Nucleotide GTR":0.0007959741805714564,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAC", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00160429066237285,
"Nucleotide GTR":0.00159356897762755,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "KQE", "K", "D", "K", "KQE", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "F", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "NAA", "AAG", "GAC", "AAA", "NAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "TTC", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000800623594860461,
"Nucleotide GTR":0.0007952729224511059,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "G", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GGT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "K", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "YTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAG", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417238_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417253_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017915580757255,
"Nucleotide GTR":0.0007964330800151363,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "Y", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAA", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "TAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417253_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417257_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "GV", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GKC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417257_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417259_England_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCY", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417259_England_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417281_England_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010872152895069,
"Nucleotide GTR":0.0007957334444440643,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "H", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAT", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417281_England_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417297_England_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008022016501883033,
"Nucleotide GTR":0.0007968404314283823,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "V", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GTA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417297_England_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008013550309273268,
"Nucleotide GTR":0.0007959994702348794,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "S", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "AGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0008019191178153676,
"Nucleotide GTR":0.0007965597872563207,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCC", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "ED", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAM", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001602567967207957,
"Nucleotide GTR":0.001591857795460208,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "S", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAT", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "TCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011322088229282,
"Nucleotide GTR":0.0007957781372798055,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "S", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "TCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011935084235584,
"Nucleotide GTR":0.0007958390272071721,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "H", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "S", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAT", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TCC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021120356955352,
"Nucleotide GTR":0.0007967514158410124,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "H", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAT", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001602926890604955,
"Nucleotide GTR":0.001592214320125106,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "Y", "V", "V", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TAT", "GTT", "GTA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010872152094769,
"Nucleotide GTR":0.0007957334443645707,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "S", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "TCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008025575831083288,
"Nucleotide GTR":0.0007971939856020563,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGC", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008032959049324262,
"Nucleotide GTR":0.0007979273731246432,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "Q", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "CAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "KTRIQPLEAGVS", "SI", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "KQE", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "DAGV", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "NNA", "AKT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "NAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GNT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 18.5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "VF", "QP", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAT", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "KTC", "CMA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801239917201825,
"Nucleotide GTR":0.0007958851258294914,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001602545766998494,
"Nucleotide GTR":0.001591835743617655,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "S", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "TCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "TTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACC", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001606138803303482,
"Nucleotide GTR":0.001595404767190136,
"amino-acid": [
["M", "S", "Y", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "TAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCA", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGT", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011850512790273,
"Nucleotide GTR":0.0007958306265828457,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "D", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "GAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018523526350012,
"Nucleotide GTR":0.0007964934682764058,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "T", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "ACG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008008513643895692,
"Nucleotide GTR":0.0007954991697666004,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAT", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011375070848233,
"Nucleotide GTR":0.0007957834001327232,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGT", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013354613717088,
"Nucleotide GTR":0.0007959800314651653,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAC", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011375054493367,
"Nucleotide GTR":0.0007957833985081663,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "L", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CTG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "KI", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AWA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008014011636488559,
"Nucleotide GTR":0.0007960452946453847,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAG", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008018523526722069,
"Nucleotide GTR":0.0007964934683133618,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "H", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CAC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020528440331676,
"Nucleotide GTR":0.0007966926197642822,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTT", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010845044195168,
"Nucleotide GTR":0.0007957307516911749,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "V", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GTC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010845007941453,
"Nucleotide GTR":0.0007957307480900317,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "V", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GTA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008012401429747495,
"Nucleotide GTR":0.0007958853500935439,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAT", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418669_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008005711566190839,
"Nucleotide GTR":0.0007952208346613684,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "F", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "TTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418669_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418754_England_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACT", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418754_England_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "S", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "TCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0008018506420202277,
"Nucleotide GTR":0.0007964917690938946,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCC", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018523526722069,
"Nucleotide GTR":0.0007964934683133618,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "S", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "AGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022772707265011,
"Nucleotide GTR":0.0007969155465846131,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018864826340238,
"Nucleotide GTR":0.0007965273701801716,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "S", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGT", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008012201537253325,
"Nucleotide GTR":0.0007958654944349018,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "I", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATT", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008007528932891678,
"Nucleotide GTR":0.0007954013567614704,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "M", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "ATG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018523527680838,
"Nucleotide GTR":0.0007964934684085982,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "E", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GAA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008025648265797271,
"Nucleotide GTR":0.0007972011806643861,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "H", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CAC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014435124998123,
"Nucleotide GTR":0.0007960873604734203,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "G", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GGG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "KAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "RC", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "YGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "SL", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TYA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "TS", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "WCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCK", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCK", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "K", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAG", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGT", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023447339323024,
"Nucleotide GTR":0.0007969825589249685,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "T", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "ACA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "QH", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAM", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "I", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ATA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000802010544122858,
"Nucleotide GTR":0.0007966506025498166,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "T", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ACC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009607098658734,
"Nucleotide GTR":0.0007956077844727581,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "R", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "CGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008005064942123528,
"Nucleotide GTR":0.0007951566044019752,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGT", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACT", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "AS", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "KCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023143410469352,
"Nucleotide GTR":0.0007969523691592362,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTA", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801443512529696,
"Nucleotide GTR":0.0007960873605031051,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGG", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010847597452065,
"Nucleotide GTR":0.0007957310053104892,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAT", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "DY", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "KAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021078576435714,
"Nucleotide GTR":0.0007967472657115181,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008010055226348637,
"Nucleotide GTR":0.0007956522977521403,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCT", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021830300647001,
"Nucleotide GTR":0.0007968219357455051,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "E", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAA", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAY", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011216762176782,
"Nucleotide GTR":0.0007957676750653382,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATT", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008005281363579726,
"Nucleotide GTR":0.0007951781019102995,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "V", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAT", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GTC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008006581952340867,
"Nucleotide GTR":0.000795307291585901,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "L", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGT", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TTA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021837933764006,
"Nucleotide GTR":0.0007968226939558933,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAT", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012401409289543,
"Nucleotide GTR":0.0007958853480614221,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "S", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "TCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021661755573298,
"Nucleotide GTR":0.0007968051938790167,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGG", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016069937933036,
"Nucleotide GTR":0.0007962497492000022,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "C", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TGC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00080432883287156,
"Nucleotide GTR":0.0007989533978709907,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGC", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001603987170906635,
"Nucleotide GTR":0.001593267514434575,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "A", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGG", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GCC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000803406987935464,
"Nucleotide GTR":0.0007980377137454141,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "R", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "CGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010847592423979,
"Nucleotide GTR":0.0007957310048110416,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "L", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CTC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001604405323113282,
"Nucleotide GTR":0.001593682872075224,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "P", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "S", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "CCT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "TCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008024714217719995,
"Nucleotide GTR":0.0007971084000932296,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "F", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "C", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTT", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TGC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "C", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TGC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023244229704041,
"Nucleotide GTR":0.0007969623837038904,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "N", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "AAT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420461_England_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "I", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "ATT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAY", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420461_England_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018523526722069,
"Nucleotide GTR":0.0007964934683133618,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCA", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "E", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GAG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008018588240293079,
"Nucleotide GTR":0.0007964998964215357,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAA", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420640_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420641_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "SI", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AKT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420641_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420648_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "SG", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "PL", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "RGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CYT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420648_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420657_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "SI", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AKT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420657_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420691_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008021572979310124,
"Nucleotide GTR":0.0007967963755830402,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTT", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420691_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "VF", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "KTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420706_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "PA", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "SCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420727_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420743_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "DY", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "KAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420743_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420745_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "PS", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "YCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420745_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420758_England_20200327_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420758_England_20200327_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420772_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018523526350012,
"Nucleotide GTR":0.0007964934682764058,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "I", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATA", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420772_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGY", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008043772373092724,
"Nucleotide GTR":0.0007990014788155019,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "F", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "-", "ILVF", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTT", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTN", "---", "NTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "H", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAT", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGY", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "YS", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TMT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "AS", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "KCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010405831419144,
"Nucleotide GTR":0.0007956871239452271,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "E", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAG", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "PL", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGW", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CYT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATT", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000800421258407685,
"Nucleotide GTR":0.0007950719382393606,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATT", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAT", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010845007941453,
"Nucleotide GTR":0.0007957307480900317,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGT", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008007274027649935,
"Nucleotide GTR":0.0007953760365938083,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTT", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008012185900516045,
"Nucleotide GTR":0.000795863941211412,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACC", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008023518614123688,
"Nucleotide GTR":0.0007969896387711508,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "T", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "ACT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011919437246992,
"Nucleotide GTR":0.0007958374729653996,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "I", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ATT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTC", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011857383906209,
"Nucleotide GTR":0.0007958313091023817,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "L", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TTG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008011316896774804,
"Nucleotide GTR":0.0007957776216038757,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAT", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008010847592433276,
"Nucleotide GTR":0.000795731004811964,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "V", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GTT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020057516341881,
"Nucleotide GTR":0.0007966458420899766,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAT", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "I", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ATT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCG", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "I", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ATT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000812423720297543,
"Nucleotide GTR":0.0008069941861034385,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421670_India_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008016677235761484,
"Nucleotide GTR":0.000796310073117749,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "C", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "TGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421670_India_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421709_New_York_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "I", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATA", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421709_New_York_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421783_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019955838137958,
"Nucleotide GTR":0.0007966357422224609,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421783_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421803_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "V", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GTG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421803_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421804_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "AV", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GYG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421804_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421842_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCY", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421842_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421844_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "I", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "SL", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "ATA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TYG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421844_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421850_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020247449956557,
"Nucleotide GTR":0.0007966647085163204,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGT", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421850_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421855_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801169358558868,
"Nucleotide GTR":0.0007958150387391929,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "C", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "TGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421855_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "PS", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "KGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "YCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421860_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421871_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "TM", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "AYG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421871_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421872_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "DG", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "AV", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GRT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GYR", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421872_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421878_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011697383998218,
"Nucleotide GTR":0.0007958154160416199,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "S", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "V", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "TCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTY", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GTC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421878_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421879_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019765910793957,
"Nucleotide GTR":0.0007966168764189939,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421879_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421898_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "-", "RG", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "L", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "SR", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "---", "NGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CTA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "MGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421898_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421906_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "I", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ATT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421906_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAY", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAY", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421917_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421929_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008008038764281888,
"Nucleotide GTR":0.0007954519991734902,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGT", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421929_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421955_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAY", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421955_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421969_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801787858360616,
"Nucleotide GTR":0.0007964294050257072,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "P", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CCA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421969_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422053_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008007195846235914,
"Nucleotide GTR":0.0007953682707020696,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "L", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "R", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CTT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CGA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422053_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008007054418043578,
"Nucleotide GTR":0.0007953542224011512,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAT", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "DY", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "KAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422097_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801084501662295,
"Nucleotide GTR":0.0007957307489523809,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTT", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422097_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422103_Wales_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATY", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422103_Wales_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422106_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCT", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422106_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "SI", "S", "R", "N", "S", "T", "PS", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AKT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "YCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018523526722069,
"Nucleotide GTR":0.0007964934683133618,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "S", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "AGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422142_Wales_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008012225431447851,
"Nucleotide GTR":0.0007958678678855517,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "H", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAT", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422142_Wales_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422152_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "KQE", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACN", "NAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCT", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422152_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "TI", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "AYT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCT", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "SL", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "RM", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TYA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AKG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422164_Wales_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008006403620710377,
"Nucleotide GTR":0.0007952895776042166,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "L", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CTT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAT", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422164_Wales_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422172_Wales_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "L", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CTT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422172_Wales_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "PS", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "YCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422186_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "KE", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "RAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422186_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCK", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422226_Wales_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "N", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "AAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422226_Wales_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422245_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "N", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCR", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "AAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422245_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422251_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020308151473594,
"Nucleotide GTR":0.0007966707381004059,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "I", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ATC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422251_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422256_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001601971665222944,
"Nucleotide GTR":0.001591265478639507,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "I", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "S", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCT", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ATA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "TCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422256_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422270_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCY", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422270_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422274_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAY", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422274_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422276_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010847592956004,
"Nucleotide GTR":0.0007957310048638875,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "I", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ATA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422276_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008019639209491735,
"Nucleotide GTR":0.000796604290964912,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "T", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "AGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "ACC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422287_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020308151471478,
"Nucleotide GTR":0.0007966707381001956,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "L", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CTA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422287_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422288_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "RM", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AKG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422288_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021518084137853,
"Nucleotide GTR":0.0007967909227529749,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "L", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TTA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008027368038979248,
"Nucleotide GTR":0.0007973720086356278,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "G", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "I", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GGT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ATT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013558787496733,
"Nucleotide GTR":0.0007960003123911176,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTT", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422429_Singapore_20200216_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "GV", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GKC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422429_Singapore_20200216_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422464_Wisconsin_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "DV", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GWT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422464_Wisconsin_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422510_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAT", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422510_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422511_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021830523065443,
"Nucleotide GTR":0.0007968219578387036,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "R", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGA", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422511_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422515_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010872152895069,
"Nucleotide GTR":0.0007957334444440643,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "I", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "ATT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422515_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422543_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018266777404165,
"Nucleotide GTR":0.0007964679649705062,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAC", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422543_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001602714375039925,
"Nucleotide GTR":0.001592003224829448,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "L", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CTC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AGC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422556_New_York_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801826677744258,
"Nucleotide GTR":0.0007964679649743212,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "A", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GCC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422556_New_York_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422581_Netherlands_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018266777039218,
"Nucleotide GTR":0.0007964679649342548,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "T", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ACG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422581_Netherlands_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422607_Netherlands_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008010847592433276,
"Nucleotide GTR":0.000795731004811964,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "S", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "TCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422607_Netherlands_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021857276365626,
"Nucleotide GTR":0.0007968246152891413,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCT", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422628_Zuid_Holland_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008010847592956004,
"Nucleotide GTR":0.0007957310048638875,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "C", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "TGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422628_Zuid_Holland_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014148271080014,
"Nucleotide GTR":0.0007960588667898427,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "V", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GTG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422657_Netherlands_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008024533085784521,
"Nucleotide GTR":0.0007970904079525286,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "I", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATA", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422657_Netherlands_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422727_Netherlands_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008007496402161014,
"Nucleotide GTR":0.000795398125429116,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "V", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "L", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GTT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TTG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422727_Netherlands_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422748_Netherlands_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021441763828288,
"Nucleotide GTR":0.0007967833417278814,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "S", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AGT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422748_Netherlands_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008035488832365672,
"Nucleotide GTR":0.0007981786607416245,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACA", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019375486675163,
"Nucleotide GTR":0.0007965780949326709,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "H", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAA", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAT", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422822_Netherlands_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012949980063388,
"Nucleotide GTR":0.0007959398385217707,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTG", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422822_Netherlands_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422877_Noord_Brabant_20200312_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422877_Noord_Brabant_20200312_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422883_Noord_Brabant_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801813175272665,
"Nucleotide GTR":0.000796454552741516,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "T", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "ACT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422883_Noord_Brabant_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422917_Zuid_Holland_20200319_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "C", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "TGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422917_Zuid_Holland_20200319_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422937_Zuid_Holland_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022335808332415,
"Nucleotide GTR":0.0007968721486766345,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "L", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TTG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422937_Zuid_Holland_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422942_Zuid_Holland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011746511963346,
"Nucleotide GTR":0.0007958202960052692,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTT", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422942_Zuid_Holland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422951_Zuid_Holland_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008022080285369732,
"Nucleotide GTR":0.000796846767149712,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "S", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "TCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422951_Zuid_Holland_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422953_Zuid_Holland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00029572071009053,
"Nucleotide GTR":0.0002937443698296209,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "Y", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "TAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422953_Zuid_Holland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422983_USA_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001607539681073086,
"Nucleotide GTR":0.001596796282710014,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "T", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "T", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "ACC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "ACA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422983_USA_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422989_Washington_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008012437240621203,
"Nucleotide GTR":0.0007958889072480406,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "L", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TTG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422989_Washington_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423044_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018523526722069,
"Nucleotide GTR":0.0007964934683133618,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "I", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "ATT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423044_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014437701088928,
"Nucleotide GTR":0.0007960876163608643,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "R", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CGG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423060_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423064_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008021646170564984,
"Nucleotide GTR":0.0007968036457938505,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "I", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ATT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423064_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423128_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "TM", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "AYG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423128_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423133_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "L", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CTA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423133_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423152_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "PL", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CYT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423152_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423156_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008012401296210937,
"Nucleotide GTR":0.000795885336829135,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "S", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "TCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423156_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423172_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008022080590375202,
"Nucleotide GTR":0.0007968467974464187,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "H", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAT", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423172_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423187_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTY", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "YAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423187_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423192_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAR", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423192_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423203_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "GV", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GKA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423203_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423204_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010988505233084,
"Nucleotide GTR":0.000795745001918074,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "I", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "ATA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423204_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423207_England_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008021723502133032,
"Nucleotide GTR":0.0007968113272689532,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "V", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GTC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423207_England_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423247_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "AV", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GYR", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423247_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423270_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020308151474429,
"Nucleotide GTR":0.0007966707381004878,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "F", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "TTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423270_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423288_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "DY", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "KAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423288_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423338_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010847592956004,
"Nucleotide GTR":0.0007957310048638875,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGT", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423338_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423357_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008006036921327804,
"Nucleotide GTR":0.0007952531527359633,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "S", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "L", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "TCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CTA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423357_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423376_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "LF", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTK", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423376_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423378_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008031194744927561,
"Nucleotide GTR":0.0007977521217927234,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "TPAS", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGT", "-C-", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 12, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423378_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 12, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423382_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "SG", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "RGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423382_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423426_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423426_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423454_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "TR", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "ASA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423454_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423463_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "PL", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CYA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423463_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423469_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008011324553234416,
"Nucleotide GTR":0.000795778382132925,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATT", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423469_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423478_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008024330209734334,
"Nucleotide GTR":0.0007970702559322331,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "R", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "QH", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CGA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CA-", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423478_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423500_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008017608263078169,
"Nucleotide GTR":0.0007964025536316599,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "C", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "TGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423500_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423514_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008010988505233084,
"Nucleotide GTR":0.000795745001918074,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "I", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATT", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423514_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423524_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000802158963464371,
"Nucleotide GTR":0.0007967980299854196,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "Y", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "TAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423524_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "NHDY", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "KTRIQPLEAGVS", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "NAY", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "NNA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 17.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423531_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423546_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "RI", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AKA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423546_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423548_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "GV", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GKC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423548_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423551_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "RL", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CKC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423551_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423553_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022419783259956,
"Nucleotide GTR":0.0007968804900478446,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "I", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATT", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423553_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423566_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000802165657979679,
"Nucleotide GTR":0.0007968046797604045,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "Y", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "TAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423566_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "SL", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "EDAGV", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TYA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GNN", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 17, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423569_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423628_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000802036323433057,
"Nucleotide GTR":0.0007966762095735079,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "S", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "TCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423628_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423634_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCS", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423634_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423646_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "AV", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GYT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423646_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423668_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "PL", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "AV", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "HY", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CYY", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GYT", "CCA", "ATY", "AAC", "ACC", "AAY", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "YAC", "CGA", "AGA", "GCY", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423668_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423701_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008032933331435111,
"Nucleotide GTR":0.0007979248185233316,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "H", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "CAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423701_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423714_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "TI", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "AYT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423714_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423726_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "NY", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "WAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423726_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423765_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGY", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423765_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423783_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022080590552866,
"Nucleotide GTR":0.0007968467974640681,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "H", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAT", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423783_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423790_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010898047424864,
"Nucleotide GTR":0.0007957360165913918,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCT", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423790_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423805_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008010898024153095,
"Nucleotide GTR":0.0007957360142797669,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "V", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GTA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423805_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423807_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008034372287246402,
"Nucleotide GTR":0.0007980677524314328,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "R", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "CGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423807_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423819_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAY", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423819_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423828_England_20200323_null_23":{
"Global MG94xREV":0.0008010899095527304,
"Nucleotide GTR":0.0007957361207011744,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "L", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CTA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423828_England_20200323_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423833_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "EV", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "KTRMQPLEAGVSW", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GWA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACN", "NNG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 23, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423833_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423862_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "RC", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "YGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423862_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423867_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "TI", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "AYT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423867_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423875_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCR", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423875_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423879_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "AS", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "KCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423879_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423890_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "S", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "TCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423890_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423896_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "SI", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AKT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423896_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423921_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801858342054204,
"Nucleotide GTR":0.0007964994176675349,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "N", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "AAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423921_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423945_England_20200319_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "SI", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AKT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423945_England_20200319_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423970_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018864826340238,
"Nucleotide GTR":0.0007965273701801716,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "S", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "TCA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423970_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423971_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "RS", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGK", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423971_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423977_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "KTRMQPLEAGVSW", "Q", "I", "AV", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "NNG", "CAA", "ATT", "GYR", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 21, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423977_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423998_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAY", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423998_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424021_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "LF", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTW", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424021_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424049_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018326722877227,
"Nucleotide GTR":0.0007964739194554673,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGC", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424049_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424056_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "IV", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "RTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424056_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424058_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "I", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "ATA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424058_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424085_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "TI", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "AYA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424085_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424092_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010899095199205,
"Nucleotide GTR":0.0007957361206685839,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTT", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424092_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424097_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "FL", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTS", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424097_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424122_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "GC", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "PA", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "DY", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "KGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "SCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "KAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424122_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424123_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "TI", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "AYT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424123_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424138_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "TA", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "RCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424138_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424142_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "T", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "ACC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424142_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424176_Washington_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "S", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "TCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424176_Washington_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424185_USA_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004858045894528757,
"Nucleotide GTR":0.004825578937149403,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "V", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "N", "H", "P", "K", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "AAT", "CAT", "CCA", "AAA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424185_USA_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424207_Washington_20200320_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424207_Washington_20200320_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424212_Washington_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008013613440523126,
"Nucleotide GTR":0.0007960057411684239,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "L", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CTT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424212_Washington_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424215_Washington_20200320_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008013550309283202,
"Nucleotide GTR":0.0007959994702358658,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "N", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "AAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424215_Washington_20200320_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424269_Washington_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008019279169748802,
"Nucleotide GTR":0.0007965685276098999,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCT", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424269_Washington_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424301_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAT", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424301_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011375038548125,
"Nucleotide GTR":0.0007957833969242992,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTT", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424336_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008006888229182724,
"Nucleotide GTR":0.0007953377145812588,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "V", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "I", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GTT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ATT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424336_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424341_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801329571112626,
"Nucleotide GTR":0.0007959741805714564,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTC", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424341_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424361_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012078451432911,
"Nucleotide GTR":0.0007958532681127272,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAT", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424361_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424438_Reykjavik_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008012225431447851,
"Nucleotide GTR":0.0007958678678855517,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACT", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424438_Reykjavik_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011903510920434,
"Nucleotide GTR":0.0007958358909765172,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAG", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424501_Reykjavik_20200320_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "I", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ATA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424501_Reykjavik_20200320_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424507_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011322087822316,
"Nucleotide GTR":0.0007957781372393811,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATT", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424507_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801335461240974,
"Nucleotide GTR":0.0007959800313353043,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCC", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011375054911155,
"Nucleotide GTR":0.0007957833985496646,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAT", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424611_Reykjavik_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "R", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AGG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424611_Reykjavik_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424623_Reykjavik_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001608306943989493,
"Nucleotide GTR":0.001597558417907797,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "L", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CTC", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424623_Reykjavik_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424645_Li_ge_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014358293494283,
"Nucleotide GTR":0.0007960797286705358,
"amino-acid": [
["M", "S", "N", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "AAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424645_Li_ge_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424657_Li_ge_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAT", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424657_Li_ge_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424662_Li_ge_20200405_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008017892309237197,
"Nucleotide GTR":0.0007964307684157933,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "L", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CTC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424662_Li_ge_20200405_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019286730784467,
"Nucleotide GTR":0.0007965692786603252,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAT", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424872_North_Carolina_20200308_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "SI", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AKT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424872_North_Carolina_20200308_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008019464889994576,
"Nucleotide GTR":0.000796586975515202,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGT", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011323046502417,
"Nucleotide GTR":0.0007957782324666936,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "V", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GTT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424951_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014295632015582,
"Nucleotide GTR":0.0007960735044001542,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "I", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "Y", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATA", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "TAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424951_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008011414932735921,
"Nucleotide GTR":0.0007957873596812697,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCT", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424957_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000802074859667223,
"Nucleotide GTR":0.0007967144882649708,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "I", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ATA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424957_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424971_Taoyuan_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008013550309295376,
"Nucleotide GTR":0.0007959994702370751,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTA", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424971_Taoyuan_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425050_Ghent_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008022772801218649,
"Nucleotide GTR":0.0007969155559171862,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACA", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425050_Ghent_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008016472985423336,
"Nucleotide GTR":0.0007962897845871123,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "F", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TTC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "I", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ATT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013236787703824,
"Nucleotide GTR":0.0007959683276085091,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACC", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008004077290020228,
"Nucleotide GTR":0.0007950584992524904,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "Y", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "TAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008005404869444026,
"Nucleotide GTR":0.0007951903699561424,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "L", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "F", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CTC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "TTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425219_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008003037054394934,
"Nucleotide GTR":0.0007949551708930601,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "V", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GTA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425219_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425221_Comunitat_Valenciana_20200317_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "TTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425221_Comunitat_Valenciana_20200317_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425238_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "L", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CTA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425238_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425249_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010845007943307,
"Nucleotide GTR":0.0007957307480902153,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "S", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "TCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425249_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425264_England_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008018357025568647,
"Nucleotide GTR":0.0007964769294729218,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "I", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "ATT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425264_England_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425276_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018091614628718,
"Nucleotide GTR":0.00079645056575654,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "S", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "TCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425276_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425296_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011006627638385,
"Nucleotide GTR":0.0007957468020471626,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGT", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425296_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425323_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020836108206876,
"Nucleotide GTR":0.0007967231809333301,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "G", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GGT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425323_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425333_England_20200329_null_23":{
"Global MG94xREV":0.000801093034021942,
"Nucleotide GTR":0.0007957392242891493,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "S", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "TCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425333_England_20200329_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425428_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008026595457385095,
"Nucleotide GTR":0.0007972952668026173,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "Y", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "TAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425428_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425430_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "V", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425430_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425439_England_20200101_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008011294940228676,
"Nucleotide GTR":0.0007957754406231105,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "Y", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "TAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425439_England_20200101_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425441_England_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "I", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "ATA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425441_England_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425451_England_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000801335461240974,
"Nucleotide GTR":0.0007959800313353043,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGC", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425451_England_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425452_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008006996729595877,
"Nucleotide GTR":0.000795348492110326,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "V", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GTA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425452_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425457_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010979116625329,
"Nucleotide GTR":0.000795744069331829,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "H", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAC", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425457_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425505_England_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAA", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425505_England_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425512_England_20200319_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "V", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GTT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425512_England_20200319_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425549_England_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000801141339290416,
"Nucleotide GTR":0.0007957872067271835,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "I", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "ATT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425549_England_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425592_England_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008010930340213219,
"Nucleotide GTR":0.0007957392242885319,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "Y", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "TAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425592_England_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425611_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008017001793496323,
"Nucleotide GTR":0.0007963423119850464,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAA", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425611_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425619_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020136774797567,
"Nucleotide GTR":0.0007966537149660804,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "K", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATT", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "AAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425619_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425627_England_20200329_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAT", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425627_England_20200329_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425656_Scotland_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008042076838117193,
"Nucleotide GTR":0.0007988330584661955,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "E", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "GAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425656_Scotland_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "C", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "TPAS", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "TGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "-CT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425695_Scotland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008025711447633665,
"Nucleotide GTR":0.0007972074566227758,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "T", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "ACT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425695_Scotland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425739_Scotland_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008020184141359919,
"Nucleotide GTR":0.0007966584199666209,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "L", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TTG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425739_Scotland_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425742_Scotland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017900032817274,
"Nucleotide GTR":0.0007964315356120302,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "Y", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "TAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAT", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425742_Scotland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_23":{
"Global MG94xREV":0.0008031383223299997,
"Nucleotide GTR":0.0007977708436674005,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "N", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "AAT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425781_Scotland_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008002714577580431,
"Nucleotide GTR":0.0007949231387270933,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "V", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GTT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425781_Scotland_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425804_Scotland_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021133539923465,
"Nucleotide GTR":0.0007967527253274736,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "S", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "TCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425804_Scotland_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425814_Scotland_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001603695574899495,
"Nucleotide GTR":0.001592977867201765,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "V", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "L", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GTA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "CTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425814_Scotland_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425895_Scotland_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013550309283202,
"Nucleotide GTR":0.0007959994702358658,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "T"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "ACC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_425895_Scotland_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425914_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020308151471478,
"Nucleotide GTR":0.0007966707381001956,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "W", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "TGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425914_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008025584978550217,
"Nucleotide GTR":0.0007971948942353789,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "H", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CAT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008018073701787395,
"Nucleotide GTR":0.0007964487864437934,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCA", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425938_Scotland_20200325_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425938_Scotland_20200325_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425947_Scotland_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008013835092695458,
"Nucleotide GTR":0.000796027758252605,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "K", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "AAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425947_Scotland_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008030081412438366,
"Nucleotide GTR":0.0007976415325984973,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "R", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "L", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "CGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TTA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425995_Scotland_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008010988505233084,
"Nucleotide GTR":0.000795745001918074,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "S", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "TCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425995_Scotland_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426008_Scotland_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008010930340956111,
"Nucleotide GTR":0.0007957392243623264,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "F", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "TTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426008_Scotland_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426010_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTT", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426010_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008011377547274043,
"Nucleotide GTR":0.0007957836461202752,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "V", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GTT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426033_New_York_20200304_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0002402023089682232,
"Nucleotide GTR":0.0002385970054579216,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "C", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "TGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426033_New_York_20200304_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426062_Idaho_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "Y", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "TAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426062_Idaho_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426073_Idaho_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801132208721936,
"Nucleotide GTR":0.000795778137179488,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "L", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TTA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426073_Idaho_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002405999323419487,
"Nucleotide GTR":0.002389919714625307,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "N", "V", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AAT", "GTT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0008011414849859598,
"Nucleotide GTR":0.0007957873514490242,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCT", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426102_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011791507150181,
"Nucleotide GTR":0.0007958247654530791,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "Y", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "TAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426102_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426127_Washington_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008011625751341711,
"Nucleotide GTR":0.0007958083006490122,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "L", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CTT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426127_Washington_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426288_Latvia_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008011059653652094,
"Nucleotide GTR":0.0007957520692105551,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "Y", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "TAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426288_Latvia_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426326_New_York_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "GC", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "KGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426326_New_York_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426415_Gujarat_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000801135596685498,
"Nucleotide GTR":0.0007957815025008463,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "I", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGA", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ATT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426415_Gujarat_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "AV", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GYC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426451_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011375950292857,
"Nucleotide GTR":0.0007957834874894405,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGT", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426451_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426453_Washington_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426453_Washington_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426461_Virginia_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008010930340160782,
"Nucleotide GTR":0.0007957392242833245,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "H", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAT", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426461_Virginia_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426535_Arizona_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008011585488635177,
"Nucleotide GTR":0.0007958043012864522,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "A", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "GCT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426535_Arizona_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426559_Arizona_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008013491435366099,
"Nucleotide GTR":0.0007959936221903648,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGA", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426559_Arizona_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426626_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020308152380126,
"Nucleotide GTR":0.0007966707381904543,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "S", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "TCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426626_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426653_Victoria_20200320_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0008009064814099832,
"Nucleotide GTR":0.0007955539184327446,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCT", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426653_Victoria_20200320_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426658_Victoria_20200320_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "I", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ATA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426658_Victoria_20200320_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426662_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "G", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "GGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426662_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022016503839986,
"Nucleotide GTR":0.000796840431622769,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "S", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "TCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426675_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012770162293533,
"Nucleotide GTR":0.0007959219769193567,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "K", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "AAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426675_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426678_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00160840861628056,
"Nucleotide GTR":0.001597659410709618,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "L", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "KNTRSIM", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "S", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "-", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CTA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "A--", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TCC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "---", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCN", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 17.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426678_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426684_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019575795752222,
"Nucleotide GTR":0.0007965979919711935,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCT", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426684_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426703_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022208091129188,
"Nucleotide GTR":0.0007968594623113927,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "L", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CTT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426703_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "SF", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TYT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426733_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008007935160671327,
"Nucleotide GTR":0.0007954417080520856,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "F", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "I", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TTT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ATA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426733_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426761_Victoria_20200327_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "F", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTT", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426761_Victoria_20200327_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "GV", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GKC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAT", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426848_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "Y", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "VF", "T", "PL", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "TAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "KTC", "ACA", "CYT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426848_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426850_Victoria_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "S", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "TCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426850_Victoria_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426854_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022335807540918,
"Nucleotide GTR":0.0007968721485980167,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "Y", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "TAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426854_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001604873577055257,
"Nucleotide GTR":0.001594147996614739,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "Y", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "-", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "TAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACN", "---", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAG", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426906_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022221323881633,
"Nucleotide GTR":0.0007968607767430164,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426906_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426930_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009889543144212,
"Nucleotide GTR":0.0007956358401599536,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "S", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "TCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAT", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426930_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426958_Victoria_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000801093034021942,
"Nucleotide GTR":0.0007957392242891493,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "C", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "TGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426958_Victoria_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426963_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801858063368594,
"Nucleotide GTR":0.0007964991408444175,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACA", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426963_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426967_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0007996190587725576,
"Nucleotide GTR":0.0007942750998095271,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "TTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426967_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426978_Victoria_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008022097035393895,
"Nucleotide GTR":0.0007968484309578686,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "Y", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "TAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426978_Victoria_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426984_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001605497335423738,
"Nucleotide GTR":0.001594767586324297,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "SF", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "TPAS", "T", "K", "V", "Y", "N", "V", "I", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "I", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TYT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "-C-", "ACT", "AAA", "GTA", "TAC", "AAT", "GTA", "ATA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ATC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 12, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426984_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 12, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427006_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012401314086462,
"Nucleotide GTR":0.0007958853386047399,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "F", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TTT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427006_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427008_Victoria_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001606951975191846,
"Nucleotide GTR":0.0015962125045442,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "I", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "I", "P", "S", "G", "T", "-", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ATT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ATA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "---", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAT", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427008_Victoria_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427043_Athens_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020417353624895,
"Nucleotide GTR":0.0007966815853343067,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "I", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ATT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427043_Athens_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427062_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008006438490998203,
"Nucleotide GTR":0.0007952930413287295,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "I", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAT", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ATT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427062_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427074_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008004515663777076,
"Nucleotide GTR":0.0007951020436572486,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTT", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAT", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427074_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427085_Victoria_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020431780056831,
"Nucleotide GTR":0.0007966830183361267,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "F", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TTT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAA", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427085_Victoria_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427105_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011414932735921,
"Nucleotide GTR":0.0007957873596812697,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "S", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "TCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427105_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427111_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021518622163237,
"Nucleotide GTR":0.000796790976195945,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "M", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ATG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427111_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427119_Victoria_20200405_null_30":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "I", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ATT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427119_Victoria_20200405_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427134_Victoria_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008014148272125361,
"Nucleotide GTR":0.0007960588668936768,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "S", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "TCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427134_Victoria_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427148_Victoria_20200408_null_37":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAT", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427148_Victoria_20200408_null_37",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427155_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012718937674013,
"Nucleotide GTR":0.0007959168886914889,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "I", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ATT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427155_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427159_Victoria_20200330_null_44":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "Y", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "TAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427159_Victoria_20200330_null_44",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010969090102041,
"Nucleotide GTR":0.0007957430733803563,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAC", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGT", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427164_Connecticut_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAT", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427164_Connecticut_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427183_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015621935431798,
"Nucleotide GTR":0.0007962052483558213,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTC", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427183_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001606258004188619,
"Nucleotide GTR":0.00159552317144013,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "G", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "C", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "A", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GGT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "TGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "GCT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427200_Washington_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "S", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "TCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427200_Washington_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427214_Washington_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008018506420202277,
"Nucleotide GTR":0.0007964917690938946,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACC", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427214_Washington_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010872152951365,
"Nucleotide GTR":0.0007957334444496572,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "H", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAT", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427232_Washington_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014436170578676,
"Nucleotide GTR":0.0007960874643326996,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "G", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GGT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427232_Washington_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427250_Washington_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008011006642311293,
"Nucleotide GTR":0.0007957468035046497,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "I", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ATT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427250_Washington_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427267_Washington_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011271617792111,
"Nucleotide GTR":0.0007957731239661447,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "V", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GTT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427267_Washington_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427321_Saint_Petersburg_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008017878583743348,
"Nucleotide GTR":0.0007964294050393365,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "T", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "ACT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427321_Saint_Petersburg_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427344_Liege_20200330_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0008016616439289619,
"Nucleotide GTR":0.0007963040341016413,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "K", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AAA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427344_Liege_20200330_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427363_Liege_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021298392389494,
"Nucleotide GTR":0.0007967691004010149,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTT", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427363_Liege_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427377_Liege_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801826677744258,
"Nucleotide GTR":0.0007964679649743212,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAC", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427377_Liege_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427404_Doha_20200323_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427404_Doha_20200323_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427428_Wisconsin_20200411_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0008013565467795254,
"Nucleotide GTR":0.0007960009759564396,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCT", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427428_Wisconsin_20200411_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427454_Wisconsin_20200410_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0008011846640245845,
"Nucleotide GTR":0.0007958302419164763,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCT", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427454_Wisconsin_20200410_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008012240299690005,
"Nucleotide GTR":0.000795869344773126,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACT", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "I", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "ATA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427461_Wisconsin_20200412_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008011059653652094,
"Nucleotide GTR":0.0007957520692105551,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "F", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TTT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427461_Wisconsin_20200412_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427470_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011797524394055,
"Nucleotide GTR":0.0007958253631560628,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGG", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427470_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427471_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "I", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ATT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427471_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427488_New_York_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008011758123836727,
"Nucleotide GTR":0.00079582144943224,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "Y", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "TAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427488_New_York_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427509_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAT", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427509_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427557_New_York_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "YS", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TMT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427557_New_York_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427583_New_York_20200316_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0008034910515088891,
"Nucleotide GTR":0.0007981212155109618,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "G", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GGT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427583_New_York_20200316_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427607_New_York_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008011270052055141,
"Nucleotide GTR":0.0007957729684388487,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCT", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427607_New_York_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427612_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011059653295359,
"Nucleotide GTR":0.0007957520691751198,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAT", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427612_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427615_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010930341014752,
"Nucleotide GTR":0.0007957392243681512,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTT", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427615_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427665_New_South_Wales_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "I", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "ATT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427665_New_South_Wales_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427687_New_South_Wales_20200318_null_33":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427687_New_South_Wales_20200318_null_33",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427689_New_South_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "I", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ATA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427689_New_South_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427693_New_South_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "Y", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "TAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427693_New_South_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427697_New_South_Wales_20200322_null_9":{
"Global MG94xREV":0.00080208036117748,
"Nucleotide GTR":0.0007967199530079139,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTT", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427697_New_South_Wales_20200322_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427698_New_South_Wales_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008011413174363823,
"Nucleotide GTR":0.0007957871850192029,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCT", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427698_New_South_Wales_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCC", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427716_New_South_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018218116837165,
"Nucleotide GTR":0.0007964631314343021,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGA", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427716_New_South_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427722_New_South_Wales_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0002876912114801823,
"Nucleotide GTR":0.0002857685334107844,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "Y", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "TAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427722_New_South_Wales_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAA", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427781_New_South_Wales_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000802069357433208,
"Nucleotide GTR":0.0007967090228031068,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "F", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "TTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427781_New_South_Wales_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_61":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_61",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428206_Nebraska_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008014437701208999,
"Nucleotide GTR":0.0007960876163727926,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCG", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428206_Nebraska_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0008019191178134377,
"Nucleotide GTR":0.0007965597872544053,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "P", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "CCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428279_Wisconsin_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008022874879283626,
"Nucleotide GTR":0.0007969256955035755,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "T", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "ACC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428279_Wisconsin_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428280_Wisconsin_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008030642911901675,
"Nucleotide GTR":0.0007976973072873777,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "G", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "Y", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GGT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "TAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428280_Wisconsin_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGT", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428302_Wisconsin_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008011271578973006,
"Nucleotide GTR":0.000795773120110176,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "I", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ATT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428302_Wisconsin_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428305_Wisconsin_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012403007895003,
"Nucleotide GTR":0.0007958855068536002,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "V", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GTC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428305_Wisconsin_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428307_Wisconsin_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000801084501662295,
"Nucleotide GTR":0.0007957307489523809,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAT", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428307_Wisconsin_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428331_Wisconsin_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018931594229923,
"Nucleotide GTR":0.0007965340023472845,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "F", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "TTC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428331_Wisconsin_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428345_Wisconsin_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010930340160782,
"Nucleotide GTR":0.0007957392242833245,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "I", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATT", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428345_Wisconsin_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428350_Hauts_De_France_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018218116826501,
"Nucleotide GTR":0.0007964631314332409,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "T", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "ACC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428350_Hauts_De_France_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428353_Hauts_De_France_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010930340160782,
"Nucleotide GTR":0.0007957392242833245,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "S", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "TCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428353_Hauts_De_France_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012102515405585,
"Nucleotide GTR":0.0007958556584277264,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "C", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "TGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "AGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "Y", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TAT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428398_Connecticut_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008023447122626532,
"Nucleotide GTR":0.0007969825374001406,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "T", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "ACT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428398_Connecticut_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428444_Guangdong_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009062904696085,
"Nucleotide GTR":0.0007955537287684493,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "Y", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "TAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428444_Guangdong_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011259748522014,
"Nucleotide GTR":0.0007957719449715224,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "S", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "S", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "AGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "TCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428457_Guangdong_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008033324186762382,
"Nucleotide GTR":0.0007979636428423207,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCC", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428457_Guangdong_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009247386890333,
"Nucleotide GTR":0.0007955720536960055,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "H", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "S", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CAT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "TCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428484_Karnataka_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015104529479317,
"Nucleotide GTR":0.0007961538535497508,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "S", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "AGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428484_Karnataka_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428489_Taiwan_20200131_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008008632326311971,
"Nucleotide GTR":0.0007955109586912153,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCT", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428489_Taiwan_20200131_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017053650771919,
"Nucleotide GTR":0.0007963474630557075,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "S", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "TCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428701_Madrid_20200327_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "L", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CTC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428701_Madrid_20200327_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428710_Madrid_20200322_null_93":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428710_Madrid_20200322_null_93",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428722_Balikesir_20200322_null_90":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428722_Balikesir_20200322_null_90",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428730_Wisconsin_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "V", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GTA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428730_Wisconsin_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428758_New_York_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001607128148082118,
"Nucleotide GTR":0.001596387500047958,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "T", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "ACT", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428758_New_York_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428780_New_York_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000801135014864649,
"Nucleotide GTR":0.0007957809245683818,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "N", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAT", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428780_New_York_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428782_New_York_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013373619196501,
"Nucleotide GTR":0.0007959819193114961,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAA", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428782_New_York_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010930340160782,
"Nucleotide GTR":0.0007957392242833245,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "S", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "TCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428796_New_York_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801857069691003,
"Nucleotide GTR":0.0007964981538077036,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCA", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428796_New_York_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428799_New_York_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATT", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428799_New_York_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428822_Singapore_20200216_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCK", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428822_Singapore_20200216_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428825_Singapore_20200316_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008022208092134846,
"Nucleotide GTR":0.0007968594624112865,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "N", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAT", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428825_Singapore_20200316_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428831_Singapore_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "S", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "TCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428831_Singapore_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428844_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "QR", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CRA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428844_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428854_Friuli_Venezia_Giulia_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008017865157714213,
"Nucleotide GTR":0.0007964280714092121,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "I", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "ATC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428854_Friuli_Venezia_Giulia_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428884_Moscow_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008007555086668824,
"Nucleotide GTR":0.0007954039546602715,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "V", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCT", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GTT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428884_Moscow_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428888_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022334961236793,
"Nucleotide GTR":0.0007968720645331986,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "S", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "TCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428888_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428890_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008017916704027786,
"Nucleotide GTR":0.0007964331915914925,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "E", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "Y", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GAG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "TAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428890_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428897_St__Petersburg_20200324_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "I", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "ATT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428897_St__Petersburg_20200324_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428898_Republic_of_Kabardino_Balkaria_20200323_null_59":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428898_Republic_of_Kabardino_Balkaria_20200323_null_59",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428912_Sakhalin_Region_20200327_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008010872152951365,
"Nucleotide GTR":0.0007957334444496572,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "I", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "ATT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428912_Sakhalin_Region_20200327_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCT", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428932_Malopolskie_20200328_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "C", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "TGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428932_Malopolskie_20200328_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428953_Luxembourg_20200404_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008034130405503553,
"Nucleotide GTR":0.0007980437259098865,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "T", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "ACA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428953_Luxembourg_20200404_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428955_Luxembourg_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010872152094769,
"Nucleotide GTR":0.0007957334443645707,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "S", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "TCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428955_Luxembourg_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428969_Budapest_20200326_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008010872153238775,
"Nucleotide GTR":0.0007957334444782062,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "F", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTT", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428969_Budapest_20200326_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429016_California_20200323_null_208":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429016_California_20200323_null_208",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429020_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010872153238775,
"Nucleotide GTR":0.0007957334444782062,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "L", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CTT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429020_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429035_California_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008012698827462297,
"Nucleotide GTR":0.0007959148911102353,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "L", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CTA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429035_California_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429062_California_20200408_null_79":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429062_California_20200408_null_79",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429063_California_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008011271614011703,
"Nucleotide GTR":0.0007957731235906301,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTT", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429063_California_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429069_California_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAT", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429069_California_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429079_Guangzhou_20200205_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008017413786694342,
"Nucleotide GTR":0.0007963832359643945,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAA", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429079_Guangzhou_20200205_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_429095_Guangzhou_20200208_null_31":{
"Global MG94xREV":0.0008011059654145723,
"Nucleotide GTR":0.0007957520692595866,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTT", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429095_Guangzhou_20200208_null_31",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429164_Bangkok_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGY", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429164_Bangkok_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429169_Bangkok_20200317_null_1662":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429169_Bangkok_20200317_null_1662",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429175_Bangkok_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008035232526762821,
"Nucleotide GTR":0.0007981532014737329,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "R", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CGC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429175_Bangkok_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "YAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429181_Bangkok_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAY", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429181_Bangkok_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429203_Switzerland_20200321_null_25":{
"Global MG94xREV":0.000802544933273725,
"Nucleotide GTR":0.0007971814203079543,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "T", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ACC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429203_Switzerland_20200321_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429204_Switzerland_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACT", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429204_Switzerland_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429207_Switzerland_20200403_null_7094":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429207_Switzerland_20200403_null_7094",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429209_Switzerland_20200316_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "L", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TTA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429209_Switzerland_20200316_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429214_Switzerland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "M", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ATG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429214_Switzerland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429219_Switzerland_20200403_null_61":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429219_Switzerland_20200403_null_61",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":12956.02031247537,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03561575904563913],
[0.02372746743527599],
[0.01704470894006514],
[0.03333325966983931],
[0.02770702843939617],
[0.01845861586668989],
[0.01325981104989083],
[0.02593137415565199],
[0.02276989088765022],
[0.01516946034616831],
[0.01089703471656208],
[0.02131064186051331],
[0.01615917508086747],
[0.0107653553029962],
[0.007733330507206013],
[0.01512358555466204],
[0.02729971513984357],
[0.01818726090163903],
[0.01306488226487195],
[0.02555016425462004],
[0.02123762076214053],
[0.01414865128637855],
[0.01016373297018058],
[0.01987656999607538],
[0.01745327213724741],
[0.01162749180060656],
[0.008352649265453621],
[0.01633474809546346],
[0.01238611469819438],
[0.008251716123034171],
[0.005927649040371521],
[0.01159232846915499],
[0.03337647867966468],
[0.02223564321515966],
[0.01597305181142365],
[0.03123748757589208],
[0.0259649960793858],
[0.01729806174118673],
[0.01242612294843825],
[0.02430098304324922],
[0.0213382726667734],
[0.01421570628825046],
[0.010211902164512],
[0.01997077144406619],
[0.01514319438977615],
[0.01008850187045115],
[0.007247110484597846],
[0.01417271579635385],
[0.01469129393418723],
[0.02063889527738391],
[0.01715531166385182],
[0.01142898845211877],
[0.008210053693135086],
[0.01605588294988797],
[0.009392447861385681],
[0.0067470976609179],
[0.01319487232900101],
[0.01000524777853336],
[0.006665565951937374],
[0.004788232536046859],
[0.009364043648081979]
],
"Log Likelihood":-5796.012950979428,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[1.054474899042166, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":680
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":13972.65647741552,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3169220172504992],
[0.2504486792631339],
[0.2220779583803396],
[0.2105513451060274]
],
"Log Likelihood":-5869.541726064169,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.1787009252577407,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.3001553520251704,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.3142261626905529,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":3.280459082557721,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":2.162618698107244
},
"display order":0,
"estimated parameters":1115
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-23/sequences.N.compressed.fas",
"number of sequences":555,
"number of sites":419,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_2,epi_isl_423828_England_20200323_null_23,epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1,epi_isl_428345_Wisconsin_20200316_null_1,epi_isl_427615_New_York_20200316_null_1,epi_isl_428302_Wisconsin_20200325_null_2,epi_isl_422581_Netherlands_20200330_null_1,epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1,epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1,epi_isl_428279_Wisconsin_20200322_null_2,(epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1,epi_isl_425221_Comunitat_Valenciana_20200317_null_21)Node1092,epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1,(epi_isl_427200_Washington_20200325_null_2,epi_isl_428398_Connecticut_20200408_null_3)Node1098,epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1,(epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1,epi_isl_428884_Moscow_20200322_null_1)Node1103,epi_isl_427698_New_South_Wales_20200321_null_2,epi_isl_422097_Wales_20200330_null_1,epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1,epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_1,epi_isl_426461_Virginia_20200327_null_2,epi_isl_427470_New_York_20200401_null_1,epi_isl_422276_Wales_20200323_null_1,epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1,epi_isl_425333_England_20200329_null_23,(epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_429204_Switzerland_20200403_null_2)Node1064,epi_isl_425439_England_20200101_null_5,epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1,epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_427321_Saint_Petersburg_20200405_null_2,epi_isl_422556_New_York_20200321_null_1,epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1,epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1,epi_isl_423204_England_20200326_null_1,epi_isl_427607_New_York_20200316_null_2,epi_isl_422607_Netherlands_20200401_null_3,epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2,epi_isl_423469_England_20200331_null_2,(epi_isl_418060_USA_20200314_null_1,epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_1)Node1037,epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2,epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1,epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2,epi_isl_429020_California_20200331_null_1,epi_isl_423921_England_20200319_null_1,epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1,epi_isl_428353_Hauts_De_France_20200324_null_1,epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1,(epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1,epi_isl_421906_England_20200327_null_1)Node1009,epi_isl_427183_Washington_20200325_null_1,(epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_424611_Reykjavik_20200327_null_1)Node1015,epi_isl_428206_Nebraska_20200325_null_2,epi_isl_425249_England_20200331_null_1,(epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1)Node63,epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1,(epi_isl_424872_North_Carolina_20200308_null_3,epi_isl_427665_New_South_Wales_20200311_null_3)Node69,epi_isl_427716_New_South_Wales_20200322_null_1,(epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1,epi_isl_428701_Madrid_20200327_null_7)Node708,epi_isl_428854_Friuli_Venezia_Giulia_20200330_null_4,epi_isl_420727_England_20200328_null_1,epi_isl_427105_Victoria_20200404_null_1,(epi_isl_427557_New_York_20200315_null_1,epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_15)Node717,epi_isl_429095_Guangzhou_20200208_null_31,(epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_1,epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10,epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1)Node722,epi_isl_424212_Washington_20200319_null_3,epi_isl_421855_England_20200327_null_1,epi_isl_426102_Washington_20200325_null_1,epi_isl_428350_Hauts_De_France_20200324_null_1,epi_isl_423634_England_20200321_null_1,epi_isl_424955_New_York_20200401_null_2,(epi_isl_420745_England_20200328_null_1,epi_isl_424176_Washington_20200317_null_1)Node788,epi_isl_428457_Guangdong_20200123_null_1,epi_isl_423945_England_20200319_null_5,(epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1,epi_isl_424657_Li_ge_20200405_null_2)Node761,(epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1,epi_isl_422274_Wales_20200325_null_1,epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1,epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1,epi_isl_429016_California_20200323_null_208,epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1,epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1,epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1,(epi_isl_422106_Wales_20200325_null_1,epi_isl_422152_Wales_20200330_null_1)Node746,epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1)Node737,(epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1,epi_isl_422510_New_York_20200320_null_1)Node758,epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1,epi_isl_427454_Wisconsin_20200410_null_7,epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2,(epi_isl_414617_USA_20200308_null_1,epi_isl_423875_England_20200318_null_1)Node696,epi_isl_427428_Wisconsin_20200411_null_9,(epi_isl_421844_England_20200324_null_1,epi_isl_425441_England_20200331_null_5)Node676,epi_isl_427344_Liege_20200330_null_11,(epi_isl_422727_Netherlands_20200324_null_3,epi_isl_425512_England_20200319_null_12)Node681,epi_isl_422989_Washington_20200318_null_4,epi_isl_428822_Singapore_20200216_null_2,epi_isl_426096_Washington_20200325_null_8,epi_isl_428796_New_York_20200406_null_1,(epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2,epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1)Node670,(epi_isl_423867_England_20200318_null_1,epi_isl_424336_Washington_20200324_null_1,epi_isl_427119_Victoria_20200405_null_30)Node665,epi_isl_429181_Bangkok_20200328_null_1,epi_isl_429164_Bangkok_20200313_null_1,epi_isl_423192_England_20200325_null_1,(epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1,epi_isl_428799_New_York_20200405_null_2)Node138,(epi_isl_418754_England_20200317_null_2,epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_2)Node135,(epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_428898_Republic_of_Kabardino_Balkaria_20200323_null_59)Node131,epi_isl_425549_England_20200322_null_4,epi_isl_417257_England_20200303_null_1,epi_isl_423998_England_20200321_null_1,epi_isl_423646_England_20200321_null_1,(epi_isl_422053_Wales_20200324_null_1,epi_isl_422172_Wales_20200323_null_4)Node167,epi_isl_426127_Washington_20200325_null_4,((epi_isl_426848_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1)Node162,epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1)Node161,(epi_isl_429062_California_20200408_null_79,epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_428844_Singapore_20200408_null_1)Node153,(epi_isl_414485_USA_20200224_null_1,epi_isl_428484_Karnataka_20200410_null_1)Node158,epi_isl_423463_England_20200330_null_1,epi_isl_427488_New_York_20200401_null_3,epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1,(((epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_426967_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_61)Node190,epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_5,epi_isl_428710_Madrid_20200322_null_93,epi_isl_425219_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_425781_Scotland_20200324_null_1,epi_isl_426675_Victoria_20200322_null_1)Node180,epi_isl_426453_Washington_20200320_null_2)Node179,epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1,(epi_isl_421955_England_20200330_null_1,epi_isl_423819_England_20200323_null_1,epi_isl_425452_England_20200331_null_1,epi_isl_425938_Scotland_20200325_null_6)Node207,epi_isl_425814_Scotland_20200312_null_2,(epi_isl_417938_California_20200318_null_1,epi_isl_425627_England_20200329_null_11)Node202,epi_isl_429035_California_20200325_null_2,(epi_isl_423376_England_20200328_null_2,epi_isl_426761_Victoria_20200327_null_7)Node432,(((epi_isl_420461_England_20200310_null_1,epi_isl_428897_St__Petersburg_20200324_null_16)Node427,epi_isl_420641_England_20200325_null_1)Node426,epi_isl_420657_England_20200325_null_1)Node425,((epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2,epi_isl_424142_England_20200321_null_2)Node421,epi_isl_424138_England_20200320_null_2)Node420,((epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1,epi_isl_428932_Malopolskie_20200328_null_13)Node220,epi_isl_423862_England_20200318_null_1)Node219,epi_isl_427404_Doha_20200323_null_17,epi_isl_420706_England_20200328_null_1,(epi_isl_423896_England_20200318_null_1,((epi_isl_426906_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1,epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1,epi_isl_425276_England_20200331_null_1,epi_isl_421783_England_20200325_null_1,epi_isl_425804_Scotland_20200307_null_1,epi_isl_425739_Scotland_20200313_null_2,epi_isl_427043_Athens_20200318_null_1,epi_isl_423566_England_20200401_null_2,epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_23,epi_isl_421879_England_20200327_null_1,epi_isl_424957_New_York_20200401_null_1,epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1,epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1,epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1,epi_isl_422937_Zuid_Holland_20200324_null_1,epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1,epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_1,epi_isl_425264_England_20200331_null_3,(epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1,epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2)Node388,epi_isl_420691_England_20200328_null_2,epi_isl_423714_England_20200323_null_1,epi_isl_423064_England_20200324_null_2,epi_isl_423172_England_20200324_null_2,epi_isl_423783_England_20200324_null_1,epi_isl_422951_Zuid_Holland_20200327_null_4,epi_isl_428825_Singapore_20200316_null_4,epi_isl_428888_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200320_null_1,epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1,(epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1,epi_isl_425619_England_20200329_null_1)Node376,epi_isl_423524_England_20200328_null_1,epi_isl_424662_Li_ge_20200405_null_5,epi_isl_426684_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_425323_England_20200329_null_1,epi_isl_423270_England_20200326_null_1,epi_isl_423628_England_20200322_null_1,epi_isl_425695_Scotland_20200316_null_1,epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1,epi_isl_427697_New_South_Wales_20200322_null_9,epi_isl_427363_Liege_20200407_null_1,(epi_isl_421803_England_20200326_null_1,epi_isl_421804_England_20200325_null_1)Node358,epi_isl_422103_Wales_20200329_null_2,epi_isl_423454_England_20200331_null_1,epi_isl_424097_England_20200321_null_1,(epi_isl_422226_Wales_20200325_null_2,epi_isl_422245_Wales_20200330_null_1)Node349,epi_isl_422748_Netherlands_20200325_null_1,epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1,epi_isl_423548_England_20200331_null_1,epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1,epi_isl_427111_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2,epi_isl_425428_England_20200331_null_1,epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1,epi_isl_426703_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_426854_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_425656_Scotland_20200314_null_1,epi_isl_423207_England_20200324_null_3,epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1,(epi_isl_424056_England_20200312_null_1,epi_isl_424058_England_20200312_null_1)Node334,(epi_isl_423500_England_20200331_null_2,epi_isl_426662_Victoria_20200321_null_1)Node331,epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1,epi_isl_426626_New_York_20200401_null_1,epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1,epi_isl_429203_Switzerland_20200321_null_25,epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3,epi_isl_427781_New_South_Wales_20200322_null_2,epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1,epi_isl_421850_England_20200327_null_1,epi_isl_422186_Wales_20200329_null_1,epi_isl_423478_England_20200330_null_1,epi_isl_423531_England_20200326_null_1,epi_isl_423833_England_20200323_null_1,epi_isl_422287_Wales_20200325_null_1,epi_isl_425914_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_422251_Wales_20200327_null_1,epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_417297_England_20200306_null_2,epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_422657_Netherlands_20200318_null_1,epi_isl_423553_England_20200326_null_1,(epi_isl_425742_Scotland_20200319_null_1,epi_isl_427159_Victoria_20200330_null_44)Node363,epi_isl_429169_Bangkok_20200317_null_1662)Node231,epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1)Node230,epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1,epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1,epi_isl_424207_Washington_20200320_null_4)Node227,(epi_isl_422288_Wales_20200327_null_1,epi_isl_429214_Switzerland_20200323_null_1)Node416,epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2,epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2,(epi_isl_424185_USA_20200318_null_1,epi_isl_425430_England_20200330_null_1)Node438,epi_isl_427155_Victoria_20200330_null_1,(((epi_isl_429219_Switzerland_20200403_null_61,epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2)Node447,epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1)Node446,epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1)Node445,((epi_isl_426062_Idaho_20200324_null_4,epi_isl_428444_Guangdong_20200130_null_1)Node455,epi_isl_423288_England_20200326_null_1)Node454,epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1,epi_isl_423765_England_20200323_null_1,epi_isl_423382_England_20200329_null_1,(epi_isl_421860_England_20200327_null_1,epi_isl_428831_Singapore_20200313_null_2)Node495,epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1,(epi_isl_421898_England_20200320_null_1,epi_isl_423133_England_20200323_null_1)Node477,epi_isl_417259_England_20200304_null_1,epi_isl_423971_England_20200320_null_1,(epi_isl_423668_England_20200320_null_1,epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_1)Node486,epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_423187_England_20200329_null_1,epi_isl_423128_England_20200323_null_1,epi_isl_423378_England_20200328_null_1,epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1,(epi_isl_428489_Taiwan_20200131_null_3,epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1,epi_isl_426678_Victoria_20200322_null_1)Node500,epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1,(epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1,epi_isl_421917_England_20200327_null_1)Node508,epi_isl_423152_England_20200324_null_1,epi_isl_422464_Wisconsin_20200326_null_1,epi_isl_422270_Wales_20200329_null_1,epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1,epi_isl_429207_Switzerland_20200403_null_7094,epi_isl_423203_England_20200324_null_2,epi_isl_421871_England_20200327_null_1,epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4,(epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1,epi_isl_426850_Victoria_20200323_null_3)Node577,epi_isl_429079_Guangzhou_20200205_null_4,(((epi_isl_427085_Victoria_20200402_null_1,epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_17)Node571,epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1)Node570,epi_isl_423569_England_20200331_null_1)Node569,epi_isl_415137_England_20200302_null_1,((epi_isl_424301_Washington_20200324_null_1,epi_isl_426930_Victoria_20200328_null_1)Node564,epi_isl_427509_New_York_20200403_null_1)Node563,((epi_isl_417238_England_20200303_null_1,epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1)Node557,epi_isl_429175_Bangkok_20200328_null_1,epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1,epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_2,epi_isl_428722_Balikesir_20200322_null_90,epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2,epi_isl_421670_India_20200312_null_2,epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1,epi_isl_426978_Victoria_20200329_null_3,epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1,epi_isl_427134_Victoria_20200406_null_2,epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2,epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6,epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_9)Node531,(epi_isl_424361_India_20200310_null_1,epi_isl_427164_Connecticut_20200331_null_3)Node560,((epi_isl_422256_Wales_20200327_null_1,epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1,epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_5)Node584,epi_isl_421842_England_20200323_null_1)Node583,(epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1,epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_3)Node590,(epi_isl_426658_Victoria_20200320_null_4,epi_isl_426984_Victoria_20200327_null_1)Node601,(epi_isl_424501_Reykjavik_20200320_null_6,epi_isl_426733_Victoria_20200325_null_1)Node598,epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1,epi_isl_427006_Victoria_20200328_null_1,(epi_isl_424085_England_20200313_null_1,epi_isl_427689_New_South_Wales_20200322_null_1)Node612,epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1,(epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1)Node607,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_423551_England_20200331_null_1,(epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_1)Node619,(epi_isl_422953_Zuid_Holland_20200327_null_1,epi_isl_424122_England_20200312_null_1)Node622,epi_isl_423726_England_20200322_null_1,epi_isl_422429_Singapore_20200216_null_1,epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1,epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_1,epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1,(epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1,epi_isl_427062_Victoria_20200330_null_1)Node651,(epi_isl_426010_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_427074_Victoria_20200401_null_1)Node648,(epi_isl_427148_Victoria_20200408_null_37,epi_isl_422164_Wales_20200326_null_2,epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_1)Node640,(epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_427008_Victoria_20200329_null_1)Node645,(epi_isl_426033_New_York_20200304_null_3,epi_isl_426326_New_York_20200306_null_1)Node656,(epi_isl_420648_England_20200323_null_1,epi_isl_420758_England_20200327_null_7)Node659,epi_isl_422822_Netherlands_20200309_null_1,epi_isl_424021_England_20200320_null_1,epi_isl_421872_England_20200327_null_1,((epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1,epi_isl_423426_England_20200330_null_1)Node775,epi_isl_426653_Victoria_20200320_null_6,epi_isl_427687_New_South_Wales_20200318_null_33,epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1,epi_isl_418669_England_20200311_null_1)Node767,(epi_isl_421929_England_20200329_null_1,epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_1)Node778,(epi_isl_424123_England_20200312_null_1,epi_isl_427471_New_York_20200401_null_1)Node117,epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1,epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3,epi_isl_423247_England_20200325_null_1,epi_isl_423977_England_20200320_null_1,epi_isl_424269_Washington_20200322_null_4,(epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2,epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_1,epi_isl_429209_Switzerland_20200316_null_12)Node109,epi_isl_425296_England_20200320_null_1,(epi_isl_420743_England_20200327_null_1,epi_isl_427722_New_South_Wales_20200318_null_3)Node795,(epi_isl_421709_New_York_20200318_null_2,epi_isl_424951_New_York_20200401_null_1)Node799,epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2,epi_isl_423701_England_20200323_null_2,(epi_isl_427693_New_South_Wales_20200322_null_1,epi_isl_428280_Wisconsin_20200322_null_1)Node102,(epi_isl_417253_England_20200303_null_1,epi_isl_425505_England_20200318_null_6)Node105,epi_isl_422628_Zuid_Holland_20200331_null_5,epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1,epi_isl_426958_Victoria_20200327_null_2,epi_isl_422983_USA_20200317_null_1,(epi_isl_423879_England_20200319_null_1,epi_isl_423890_England_20200318_null_2)Node813,epi_isl_427612_New_York_20200316_null_1,epi_isl_423807_England_20200324_null_1,epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1,((epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1,epi_isl_422877_Noord_Brabant_20200312_null_6)Node95,epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1)Node94,epi_isl_423044_England_20200325_null_1,epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1,epi_isl_425050_Ghent_20200324_null_4,epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1,epi_isl_428955_Luxembourg_20200401_null_1,(epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2,epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1,epi_isl_426415_Gujarat_20200405_null_2)Node89,(epi_isl_423546_England_20200331_null_1,epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_6)Node836,epi_isl_427214_Washington_20200327_null_4,(epi_isl_422917_Zuid_Holland_20200319_null_6,epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1)Node85,epi_isl_427583_New_York_20200316_null_8,(epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1,epi_isl_428730_Wisconsin_20200406_null_1)Node841,epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1,epi_isl_423060_England_20200324_null_1,epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2,epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1,epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1,epi_isl_423970_England_20200320_null_1,epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1,epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_426008_Scotland_20200331_null_2,epi_isl_427250_Washington_20200331_null_2,epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1,epi_isl_422942_Zuid_Holland_20200326_null_1,epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1,epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2,epi_isl_426073_Idaho_20200327_null_1,epi_isl_424092_England_20200311_null_1,epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_424971_Taoyuan_20200317_null_2,epi_isl_425995_Scotland_20200330_null_2,epi_isl_427267_Washington_20200330_null_1,epi_isl_423338_England_20200327_null_1,epi_isl_421969_England_20200401_null_1,epi_isl_425451_England_20200401_null_3,epi_isl_418938_Washington_20200316_null_6,epi_isl_422511_New_York_20200320_null_1,epi_isl_428758_New_York_20200403_null_2,epi_isl_423805_England_20200324_null_2,epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2,epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_427232_Washington_20200328_null_1,epi_isl_428969_Budapest_20200326_null_4,epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_1,(epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1,epi_isl_421878_England_20200327_null_1)Node21,(epi_isl_423357_England_20200329_null_2,epi_isl_425238_England_20200330_null_1)Node17,epi_isl_423156_England_20200324_null_2,epi_isl_422515_New_York_20200320_null_1,epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_4,epi_isl_427377_Liege_20200407_null_1,epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4,epi_isl_425947_Scotland_20200326_null_2,epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1,epi_isl_413609_USA_20200221_null_1,epi_isl_428953_Luxembourg_20200404_null_4,epi_isl_427461_Wisconsin_20200412_null_4,epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1,epi_isl_424645_Li_ge_20200404_null_1,epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1,epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2,epi_isl_428912_Sakhalin_Region_20200327_null_5,(epi_isl_425457_England_20200401_null_1,epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2)Node903,epi_isl_428782_New_York_20200406_null_1,epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3,epi_isl_417281_England_20200306_null_1,epi_isl_424507_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_423790_England_20200312_null_1,epi_isl_413607_USA_20200218_null_1,epi_isl_428331_Wisconsin_20200328_null_1,epi_isl_426288_Latvia_20200330_null_3,epi_isl_424623_Reykjavik_20200328_null_1,epi_isl_425611_England_20200329_null_2,epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1,epi_isl_425895_Scotland_20200322_null_1,epi_isl_424049_England_20200313_null_1,epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1,epi_isl_429063_California_20200325_null_4,epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1,epi_isl_424215_Washington_20200320_null_4,epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2,epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_424341_Washington_20200324_null_1,epi_isl_426535_Arizona_20200317_null_5,epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1,epi_isl_422543_New_York_20200320_null_1,epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1,epi_isl_426451_Washington_20200319_null_1,epi_isl_423514_England_20200329_null_3,epi_isl_426559_Arizona_20200325_null_3,epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1,epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1,epi_isl_425592_England_20200325_null_2,(epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1,epi_isl_428890_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3)Node972,epi_isl_428780_New_York_20200406_null_2,epi_isl_428307_Wisconsin_20200325_null_2,epi_isl_424438_Reykjavik_20200319_null_2,epi_isl_426963_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_420772_England_20200330_null_1,epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1,epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1,epi_isl_422883_Noord_Brabant_20200101_null_1,(epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1,epi_isl_429069_California_20200325_null_1)Node990,epi_isl_428305_Wisconsin_20200325_null_1,epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1,epi_isl_420640_England_20200323_null_2,epi_isl_422142_Wales_20200325_null_3)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node1009":"test",
"Node1015":"test",
"Node102":"test",
"Node1037":"test",
"Node105":"test",
"Node1064":"test",
"Node109":"test",
"Node1092":"test",
"Node1098":"test",
"Node1103":"test",
"Node117":"test",
"Node131":"test",
"Node135":"test",
"Node138":"test",
"Node153":"test",
"Node158":"test",
"Node161":"test",
"Node162":"test",
"Node167":"test",
"Node17":"test",
"Node179":"test",
"Node180":"test",
"Node190":"test",
"Node202":"test",
"Node207":"test",
"Node21":"test",
"Node219":"test",
"Node220":"test",
"Node227":"test",
"Node230":"test",
"Node231":"test",
"Node331":"test",
"Node334":"test",
"Node349":"test",
"Node358":"test",
"Node363":"test",
"Node376":"test",
"Node388":"test",
"Node416":"test",
"Node420":"test",
"Node421":"test",
"Node425":"test",
"Node426":"test",
"Node427":"test",
"Node432":"test",
"Node438":"test",
"Node445":"test",
"Node446":"test",
"Node447":"test",
"Node454":"test",
"Node455":"test",
"Node477":"test",
"Node486":"test",
"Node495":"test",
"Node500":"test",
"Node508":"test",
"Node531":"test",
"Node557":"test",
"Node560":"test",
"Node563":"test",
"Node564":"test",
"Node569":"test",
"Node570":"test",
"Node571":"test",
"Node577":"test",
"Node583":"test",
"Node584":"test",
"Node590":"test",
"Node598":"test",
"Node601":"test",
"Node607":"test",
"Node612":"test",
"Node619":"test",
"Node622":"test",
"Node63":"test",
"Node640":"test",
"Node645":"test",
"Node648":"test",
"Node651":"test",
"Node656":"test",
"Node659":"test",
"Node665":"test",
"Node670":"test",
"Node676":"test",
"Node681":"test",
"Node69":"test",
"Node696":"test",
"Node708":"test",
"Node717":"test",
"Node722":"test",
"Node737":"test",
"Node746":"test",
"Node758":"test",
"Node761":"test",
"Node767":"test",
"Node775":"test",
"Node778":"test",
"Node788":"test",
"Node795":"test",
"Node799":"test",
"Node813":"test",
"Node836":"test",
"Node841":"test",
"Node85":"test",
"Node89":"test",
"Node903":"test",
"Node94":"test",
"Node95":"test",
"Node972":"test",
"Node990":"test",
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":"test",
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":"test",
"epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1":"test",
"epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_413607_USA_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1":"test",
"epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1":"test",
"epi_isl_414485_USA_20200224_null_1":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1":"test",
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_414617_USA_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_415137_England_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2":"test",
"epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2":"test",
"epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1":"test",
"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2":"test",
"epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417253_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417257_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417259_England_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417281_England_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_417297_England_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6":"test",
"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3":"test",
"epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4":"test",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_418669_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418754_England_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10":"test",
"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_6":"test",
"epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1":"test",
"epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2":"test",
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":"test",
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_420461_England_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420641_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420648_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420657_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420691_England_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420743_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420745_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420758_England_20200327_null_7":"test",
"epi_isl_420772_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2":"test",
"epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2":"test",
"epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2":"test",
"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421670_India_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_421709_New_York_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_421783_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421803_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421804_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421842_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421844_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421850_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421855_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421871_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421872_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421878_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421879_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421898_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421906_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421929_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_421955_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_421969_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422053_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422097_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422103_Wales_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_422106_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422142_Wales_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_422152_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422164_Wales_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_422172_Wales_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422186_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422226_Wales_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_422245_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422251_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422256_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422270_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422274_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422276_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_422287_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422288_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422429_Singapore_20200216_null_1":"test",
"epi_isl_422464_Wisconsin_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422510_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422511_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422515_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422543_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422556_New_York_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_422581_Netherlands_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422607_Netherlands_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422628_Zuid_Holland_20200331_null_5":"test",
"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_422657_Netherlands_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_422727_Netherlands_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_422748_Netherlands_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_422822_Netherlands_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_422877_Noord_Brabant_20200312_null_6":"test",
"epi_isl_422883_Noord_Brabant_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_422917_Zuid_Holland_20200319_null_6":"test",
"epi_isl_422937_Zuid_Holland_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422942_Zuid_Holland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422951_Zuid_Holland_20200327_null_4":"test",
"epi_isl_422953_Zuid_Holland_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422983_USA_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_422989_Washington_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_423044_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423064_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423128_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423133_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423152_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423156_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423172_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423187_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423192_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423203_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423204_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423207_England_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_423247_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423270_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423288_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423338_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423357_England_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_423376_England_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_423378_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423382_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423426_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423454_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423463_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423469_England_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_423478_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423500_England_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_423514_England_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_423524_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423546_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423548_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423551_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423553_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423566_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423628_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423634_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_423646_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_423668_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423701_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_423714_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423726_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423765_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423783_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423790_England_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_423805_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_423807_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423819_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423828_England_20200323_null_23":"test",
"epi_isl_423833_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423862_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423867_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423875_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423879_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423890_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_423896_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423921_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423945_England_20200319_null_5":"test",
"epi_isl_423970_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423971_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423977_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423998_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424021_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424049_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_424056_England_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_424058_England_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_424085_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_424092_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_424097_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424122_England_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_424123_England_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_424138_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_424142_England_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_424176_Washington_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_424185_USA_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_424207_Washington_20200320_null_4":"test",
"epi_isl_424212_Washington_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_424215_Washington_20200320_null_4":"test",
"epi_isl_424269_Washington_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_424301_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_424336_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_424341_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_424361_India_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_424438_Reykjavik_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424501_Reykjavik_20200320_null_6":"test",
"epi_isl_424507_Reykjavik_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_424611_Reykjavik_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_424623_Reykjavik_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_424645_Li_ge_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_424657_Li_ge_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_424662_Li_ge_20200405_null_5":"test",
"epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_424872_North_Carolina_20200308_null_3":"test",
"epi_isl_424901_New_Jersey_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424951_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424955_New_York_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_424957_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424971_Taoyuan_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_425050_Ghent_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_425130_Duesseldorf_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425191_Comunitat_Valenciana_20200316_null_5":"test",
"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_425219_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425221_Comunitat_Valenciana_20200317_null_21":"test",
"epi_isl_425238_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425249_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425264_England_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_425276_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425296_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_425323_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_425333_England_20200329_null_23":"test",
"epi_isl_425428_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425430_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425439_England_20200101_null_5":"test",
"epi_isl_425441_England_20200331_null_5":"test",
"epi_isl_425451_England_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_425452_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425457_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_425505_England_20200318_null_6":"test",
"epi_isl_425512_England_20200319_null_12":"test",
"epi_isl_425549_England_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_425592_England_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_425611_England_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_425619_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_425627_England_20200329_null_11":"test",
"epi_isl_425656_Scotland_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_425695_Scotland_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_425739_Scotland_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_425742_Scotland_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_425777_Scotland_20200313_null_23":"test",
"epi_isl_425781_Scotland_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_425804_Scotland_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_425814_Scotland_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_425895_Scotland_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_425914_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_425938_Scotland_20200325_null_6":"test",
"epi_isl_425947_Scotland_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_425982_Scotland_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_425995_Scotland_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_426008_Scotland_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_426010_Scotland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_426023_Scotland_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_426033_New_York_20200304_null_3":"test",
"epi_isl_426062_Idaho_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_426073_Idaho_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_8":"test",
"epi_isl_426102_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426127_Washington_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_426288_Latvia_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_426326_New_York_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_426415_Gujarat_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_426425_Maryland_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_426451_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_426453_Washington_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_426461_Virginia_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_426535_Arizona_20200317_null_5":"test",
"epi_isl_426559_Arizona_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_426626_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_426653_Victoria_20200320_null_6":"test",
"epi_isl_426658_Victoria_20200320_null_4":"test",
"epi_isl_426662_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426675_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426678_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426684_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426703_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426732_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426733_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426761_Victoria_20200327_null_7":"test",
"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426848_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426850_Victoria_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_426854_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426906_Victoria_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_426930_Victoria_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_426958_Victoria_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_426963_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426967_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426978_Victoria_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_426984_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427006_Victoria_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_427008_Victoria_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_427043_Athens_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_427062_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427074_Victoria_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_427085_Victoria_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_427105_Victoria_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_427111_Victoria_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_427119_Victoria_20200405_null_30":"test",
"epi_isl_427134_Victoria_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_427148_Victoria_20200408_null_37":"test",
"epi_isl_427155_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427159_Victoria_20200330_null_44":"test",
"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_427164_Connecticut_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_427183_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_427200_Washington_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_427214_Washington_20200327_null_4":"test",
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427232_Washington_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_427250_Washington_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_427267_Washington_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427321_Saint_Petersburg_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_427344_Liege_20200330_null_11":"test",
"epi_isl_427363_Liege_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_427377_Liege_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_427404_Doha_20200323_null_17":"test",
"epi_isl_427428_Wisconsin_20200411_null_9":"test",
"epi_isl_427454_Wisconsin_20200410_null_7":"test",
"epi_isl_427456_Wisconsin_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_6":"test",
"epi_isl_427461_Wisconsin_20200412_null_4":"test",
"epi_isl_427470_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_427471_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_427488_New_York_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_427509_New_York_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_427557_New_York_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_427583_New_York_20200316_null_8":"test",
"epi_isl_427607_New_York_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_427612_New_York_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_427615_New_York_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_427665_New_South_Wales_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_427687_New_South_Wales_20200318_null_33":"test",
"epi_isl_427689_New_South_Wales_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_427693_New_South_Wales_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_427697_New_South_Wales_20200322_null_9":"test",
"epi_isl_427698_New_South_Wales_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_427716_New_South_Wales_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_427722_New_South_Wales_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_17":"test",
"epi_isl_427781_New_South_Wales_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_61":"test",
"epi_isl_428206_Nebraska_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_9":"test",
"epi_isl_428279_Wisconsin_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_428280_Wisconsin_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_428302_Wisconsin_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_428305_Wisconsin_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_428307_Wisconsin_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_428331_Wisconsin_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_428345_Wisconsin_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_428350_Hauts_De_France_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_428353_Hauts_De_France_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_428387_Connecticut_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_15":"test",
"epi_isl_428398_Connecticut_20200408_null_3":"test",
"epi_isl_428444_Guangdong_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_428457_Guangdong_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_428475_Guangdong_20200128_null_1":"test",
"epi_isl_428484_Karnataka_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_428489_Taiwan_20200131_null_3":"test",
"epi_isl_428670_Sri_Lanka_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_428701_Madrid_20200327_null_7":"test",
"epi_isl_428710_Madrid_20200322_null_93":"test",
"epi_isl_428722_Balikesir_20200322_null_90":"test",
"epi_isl_428730_Wisconsin_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_428758_New_York_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_428780_New_York_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_428782_New_York_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_428796_New_York_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_428799_New_York_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_428822_Singapore_20200216_null_2":"test",
"epi_isl_428825_Singapore_20200316_null_4":"test",
"epi_isl_428831_Singapore_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_428844_Singapore_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_428854_Friuli_Venezia_Giulia_20200330_null_4":"test",
"epi_isl_428884_Moscow_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_428888_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_428890_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_428897_St__Petersburg_20200324_null_16":"test",
"epi_isl_428898_Republic_of_Kabardino_Balkaria_20200323_null_59":"test",
"epi_isl_428912_Sakhalin_Region_20200327_null_5":"test",
"epi_isl_428924_Chelyabinsk_Region_20200328_null_5":"test",
"epi_isl_428932_Malopolskie_20200328_null_13":"test",
"epi_isl_428953_Luxembourg_20200404_null_4":"test",
"epi_isl_428955_Luxembourg_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_428969_Budapest_20200326_null_4":"test",
"epi_isl_429016_California_20200323_null_208":"test",
"epi_isl_429020_California_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_429035_California_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_429062_California_20200408_null_79":"test",
"epi_isl_429063_California_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_429069_California_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_429079_Guangzhou_20200205_null_4":"test",
"epi_isl_429095_Guangzhou_20200208_null_31":"test",
"epi_isl_429164_Bangkok_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_429169_Bangkok_20200317_null_1662":"test",
"epi_isl_429175_Bangkok_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429181_Bangkok_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429203_Switzerland_20200321_null_25":"test",
"epi_isl_429204_Switzerland_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_429207_Switzerland_20200403_null_7094":"test",
"epi_isl_429209_Switzerland_20200316_null_12":"test",
"epi_isl_429214_Switzerland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_429219_Switzerland_20200403_null_61":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":23
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":13
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":36
}
}
}